DALI
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FSSP FAMILIES OF STRUCTURALLY SIMILAR PROTEINS, VERSION 1.0 (Apr 1 1995) CREATED Tue May 8 05:53:50 BST 2007 for dali on s040-033.ebi.ac.uk METHOD Dali ver. 2.0: Holm, L., Sander, C. (1993) J.Mol.Biol. 233,123-138 DATABASE 8969 protein chains PDBID 3027-A HEADER COMPND SOURCE AUTHOR SEQLENGTH 349 NALIGN 230 WARNING pairs with Z<2.0 are structurally dissimilar
- SUMMARY: PDB/chain identifiers and structural alignment statistics
NR. STRID1 STRID2 Z RMSD LALI LSEQ2 %IDE REVERS PERMUT NFRAG TOPO PROTEIN 1: 3027-A 1zkd-A 56.8 0.0 349 349 100 0 0 1 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION duf185 (rhodops 2: 3027-A 2ex4-A 11.7 3.0 185 221 12 0 0 22 S TRANSFERASE adrenal gland protein ad-003 (homo sapien 3: 3027-A 1im8-A 11.6 3.2 178 225 10 0 0 18 S TRANSFERASE yeco (methyltransferase, hypothetical pro 4: 3027-A 2gb4-A 10.8 3.3 184 231 13 0 0 19 S TRANSFERASE thiopurine s-methyltransferase (thiopurine 5: 3027-A 2fk7-A 10.7 3.8 186 277 14 0 0 19 S TRANSFERASE methoxy mycolic acid synthase 4 (mycobact 6: 3027-A 2ob1-A 10.2 3.9 196 319 9 0 0 23 S TRANSFERASE leucine carboxyl methyltransferase 1 (prot 7: 3027-A 2f8l-A 10.0 3.7 182 318 8 0 0 22 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 8: 3027-A 2avn-A 10.0 3.7 183 242 11 0 0 20 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION ubiquinoneMENAQU 9: 3027-A 2bzg-A 9.9 3.4 182 226 13 0 0 20 S TRANSFERASE thiopurine s-methyltransferase (thiopurine 10: 3027-A 2aot-A 9.8 4.3 182 285 13 0 0 23 S TRANSFERASE histamine n-methyltransferase (hmt) (homo 11: 3027-A 2p8j-A 9.7 3.4 168 203 10 0 0 16 S TRANSFERASE s-adenosylmethionine-dependent methyltrans 12: 3027-A 1vl5-A 9.7 3.3 167 225 9 0 0 18 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION unknown conserve 13: 3027-A 1hnn-A 9.7 3.4 183 261 13 0 0 18 S TRANSFERASE phenylethanolamine n-methyltransferase (p 14: 3027-A 1m6e-X 9.6 3.6 206 359 9 0 0 27 S TRANSFERASE s-adenosyl-l-methionnine:salicylic acid ca 15: 3027-A 2fay-A 9.5 3.9 178 274 14 0 0 21 S 16: 3027-A 2h00-A 9.2 2.9 158 225 9 0 0 18 S TRANSFERASE methyltransferase 10 domain containing pro 17: 3027-A 1wy7-A 9.2 3.1 155 195 13 0 0 15 S TRANSFERASE hypothetical protein ph1948 (pyrococcus h 18: 3027-A 1m6y-A 8.8 4.3 156 289 10 0 0 19 S TRANSFERASE s-adenosyl-methyltransferase mraw (thermo 19: 3027-A 1i9g-A 8.7 3.0 149 264 9 0 0 15 S TRANSFERASE hypothetical protein rv2118c (mycobacter 20: 3027-A 1zq9-A 8.6 3.2 144 278 16 0 0 19 S TRANSFERASE probable dimethyladenosine transferase (s- 21: 3027-A 1vid 8.6 3.1 153 214 10 0 0 18 S TRANSFERASE (METHYLTRANSFERASE) catechol o-methyltrans 22: 3027-A 1af7 8.6 3.0 160 275 8 0 0 18 S METHYLTRANSFERASE chemotaxis receptor methyltransferas 23: 3027-A 1t43-A 8.4 5.8 162 274 16 0 0 17 S TRANSFERASE protein methyltransferase hemk (protein-gl 24: 3027-A 1fpq-A 8.3 5.8 169 333 8 0 0 25 S TRANSFERASE isoliquiritigenin 2'-o-methyltransferase 25: 3027-A 1dus-A 8.3 3.3 143 194 13 0 0 15 S STRUCTURAL GENOMICS mj0882 (methanococcus jannaschii) 26: 3027-A 2gh1-A 8.2 4.5 173 273 8 0 0 19 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION methyltransferas 27: 3027-A 2oo3-A 8.1 3.6 165 267 11 0 0 17 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION protein involved 28: 3027-A 1wxw-A 8.1 5.2 165 373 10 0 0 21 S TRANSFERASE hypothetical protein ttha1280 (tt1595) (t 29: 3027-A 2b78-A 8.0 4.5 159 376 8 0 0 22 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 30: 3027-A 1jsx-A 8.0 3.4 148 193 10 0 0 17 S UNKNOWN FUNCTION glucose-inhibited division protein b 31: 3027-A 1nv8-A 7.9 5.8 156 271 10 0 0 20 S TRANSFERASE hemk protein (thermatoga maritima) bacter 32: 3027-A 2frn-A 7.8 5.4 156 241 12 0 0 20 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 33: 3027-A 1qyr-A 7.8 3.6 148 252 11 0 0 18 S TRANSFERASE, TRANSLATION high level kasugamycin resist 34: 3027-A 2dul-A 7.6 3.2 153 367 8 0 0 17 S TRANSFERASE n(2),N(2)-dimethylguanosine trna methyltra 35: 3027-A 1wxx-A 7.6 5.5 166 378 10 0 0 20 S TRANSFERASE hypothetical protein ttha1280 (tt1595) (t 36: 3027-A 1kxz-A 7.5 3.3 141 178 11 0 0 18 S TRANSFERASE, LYASE precorrin-6y methyltransferasePUTAT 37: 3027-A 2erc-A 7.4 3.0 145 235 14 0 0 17 S METHYLTRANSFERASE rrna methyl transferase fragment (er 38: 3027-A 2ar0-A 7.4 4.5 188 476 11 0 0 23 S TRANSCRIPTION,TRANSFERASE type i restriction enzyme ec 39: 3027-A 2ift-A 7.3 3.3 137 175 10 0 0 17 S TRANSFERASE putative methylase hi0767 (haemophilus in 40: 3027-A 2gpy-A 7.3 2.9 136 178 12 0 0 16 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION o-methyltransfer 41: 3027-A 1ixk-A 7.3 3.2 146 298 8 0 0 18 S TRANSFERASE methyltransferase (pyrococcus horikoshii) 42: 3027-A 2ozv-A 7.2 3.6 147 200 14 0 0 17 S TRANSFERASE hypothetical protein atu0636 fragment (ag 43: 3027-A 1ws6-A 7.2 3.0 135 169 13 0 0 15 S TRANSFERASE methyltransferase fragment (hypothetical p 44: 3027-A 3mag 6.9 3.7 157 292 7 0 0 19 S MRNA PROCESSING vp39 (poly(a) polymerase regulatory s 45: 3027-A 1yb2-A 6.9 4.2 146 219 15 0 0 17 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 46: 3027-A 1sqf-A 6.9 3.9 168 424 10 0 0 21 S TRANSFERASE sun protein (fmu protein) (escherichia co 47: 3027-A 1uwv-A 6.7 7.1 159 406 14 0 0 20 S METHYLTRANSFERASE 23s rrna (uracil-5-)-methyltransfera 48: 3027-A 1jq3-A 6.7 3.5 165 295 10 0 0 24 S TRANSFERASE spermidine synthase (putrescine aminoprop 49: 3027-A 1q0s-A 6.6 3.2 137 241 10 0 0 17 S TRANSFERASE DNA adenine methylase (deoxyadenosyl-methy 50: 3027-A 2jh9-A 6.5 3.2 142 613 7 0 0 18 S VIRAL PROTEIN vp4 core protein (bluetongue virus vp4) 51: 3027-A 2jh8-A 6.5 3.4 145 613 8 0 0 19 S VIRAL PROTEIN vp4 core protein (bluetongue virus vp4) 52: 3027-A 2jhp-A 6.4 3.4 146 613 7 0 0 19 S VIRAL PROTEIN vp4 core protein (bluetongue virus vp4) 53: 3027-A 2jha-A 6.3 3.4 145 613 7 0 0 19 S VIRAL PROTEIN vp4 core protein (bluetongue virus vp4) 54: 3027-A 2bm8-A 6.3 4.3 156 232 12 0 0 22 S PORIN cephalosporin hydroxylase cmci Mutant (streptom 55: 3027-A 2jhc-A 6.2 3.6 144 613 9 0 0 18 S VIRAL PROTEIN vp4 core protein (bluetongue virus vp4) 56: 3027-A 1kr5-A 6.0 3.4 131 218 10 0 0 14 S TRANSFERASE protein-l-isoaspartate o-methyltransferas 57: 3027-A 2pgx-A 5.6 5.3 136 241 13 0 0 17 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION upf0341 protein 58: 3027-A 2exx-A 5.6 3.4 146 305 12 0 0 20 S UNKNOWN FUNCTION hscarg protein (homo sapiens) human 59: 3027-A 2fk8-A 5.5 4.8 165 281 14 0 0 20 S TRANSFERASE methoxy mycolic acid synthase 4 (mycobact 60: 3027-A 2i99-A 5.3 3.6 129 312 8 0 0 17 S OXIDOREDUCTASE mu-crystallin homolog (nadp-regulated t 61: 3027-A 2i6g-A 4.9 3.3 133 161 11 0 0 21 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION putative methylt 62: 3027-A 1obb-A 4.9 4.2 146 477 12 0 0 16 S HYDROLASE alpha-glucosidase (maltase) (thermotoga mar 63: 3027-A 1l9k-A 4.8 4.1 143 261 8 0 0 20 S TRANSFERASE RNA-directed RNA polymerase fragment (meth 64: 3027-A 2nvw-A 4.7 3.8 140 413 11 0 0 17 S TRANSCRIPTION galactoseLACTOSE METABOLISM REGULATORY P 65: 3027-A 2fkn-A 4.7 4.0 165 544 9 0 0 21 S LYASE urocanate hydratase (urocanase, imidazolonepropi 66: 3027-A 2be7-A 4.7 4.2 131 309 12 0 0 17 S TRANSFERASE aspartate carbamoyltransferase catalytic c 67: 3027-A 2a35-A 4.7 3.4 126 208 11 0 0 12 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 68: 3027-A 1fds 4.7 4.4 134 282 8 0 0 15 S DEHYDROGENASE 17-beta-hydroxysteroid-dehydrogenase (h 69: 3027-A 2fmu-A 4.6 3.5 125 209 12 0 0 13 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hiv-1 tat intera 70: 3027-A 2cmd 4.6 5.4 142 312 13 0 0 19 S OXIDOREDUCTASE(NAD(A)-CHOH(D)) Malate dehydrogenase ( 71: 3027-A 1ygy-A 4.6 6.9 145 527 13 0 0 20 S OXIDOREDUCTASE d-3-phosphoglycerate dehydrogenase (pgd 72: 3027-A 1qor-A 4.6 5.3 130 326 10 0 0 19 S OXIDOREDUCTASE Quinone oxidoreductase complexed with n 73: 3027-A 2i1q-A 4.5 3.7 136 311 8 0 0 15 S RECOMBINATION DNA repair and recombination protein rad 74: 3027-A 2hwk-A 4.5 3.8 132 320 14 0 0 20 S HYDROLASE helicase nsp2 fragment (protease, triphospha 75: 3027-A 1xea-A 4.5 4.2 130 304 14 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE oxidoreductase, gfoIDHmoca family (gfoI 76: 3027-A 2dr3-A 4.4 4.4 133 232 6 0 0 19 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION upf0273 protein 77: 3027-A 1uwk-A 4.4 5.0 167 554 8 0 0 25 S HYDROLASE urocanate hydratase (urocanase, imidazolonep 78: 3027-A 1psd-A 4.4 3.4 133 404 11 0 0 18 S OXIDOREDUCTASE (NAD(A)) D-3-phosphoglycerate dehydroge 79: 3027-A 1k6i-A 4.4 3.5 140 318 11 0 0 17 S TRANSCRIPTION nmra (aspergillus nidulans) expression 80: 3027-A 1c9k-B 4.4 3.5 120 180 6 0 0 16 S TRANSFERASE adenosylcobinamide kinase (cobu) (salmone 81: 3027-A 2dpo-A 4.3 3.4 114 310 13 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE l-gulonate 3-dehydrogenase (oryctolagu 82: 3027-A 2ag8-A 4.2 3.1 100 254 13 0 0 13 S OXIDOREDUCTASE pyrroline-5-carboxylate reductase (nei 83: 3027-A 1qyc-A 4.2 3.5 131 307 11 0 0 19 S PLANT PROTEIN phenylcoumaran benzylic ether reductase 84: 3027-A 1krh-A 4.2 10.2 116 337 7 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE benzoate 1,2-dioxygenase reductase (ac 85: 3027-A 1id1-A 4.2 3.2 108 153 11 0 0 14 S MEMBRANE PROTEIN putative potassium channel protein f 86: 3027-A 1bxk-A 4.2 4.3 147 341 7 0 0 21 S LYASE dtdp-glucose 4,6-dehydratase (escherichia coli) 87: 3027-A 2gjk-A 4.1 7.3 141 614 10 0 0 17 S HYDROLASE regulator of nonsense transcripts 1 fragment 88: 3027-A 1e7w-A 4.1 3.4 125 268 10 0 0 16 S DIHYDROFOLATE REDUCTASE pteridine reductase (leishma 89: 3027-A 2p5u-D 4.0 3.9 136 311 13 0 0 18 S ISOMERASE udp-glucose 4-epimerase (thermus thermophil 90: 3027-A 1yh1-A 4.0 5.7 141 334 10 0 0 17 S HYDROLASE n-acetyl-l-ornithine carbamoyltransferase (a 91: 3027-A 1g6q-2 4.0 4.9 136 320 10 0 0 21 S TRANSFERASE hnrnp arginine n-methyltransferase fragme 92: 3027-A 8abp 3.9 6.5 141 305 9 0 0 20 S BINDING PROTEINS L-Arabinose-binding protein (mutant w 93: 3027-A 2gn4-A 3.9 4.3 133 329 4 0 0 22 S LYASE udp-glcnac c6 dehydratase (flaa1 protein) (heli 94: 3027-A 1e6w-A 3.9 4.1 133 251 8 0 0 16 S DEHYDROGENASE short chain 3-hydroxyacyl-coa dehydroge 95: 3027-A 1dpg-A 3.9 4.8 137 485 9 0 0 17 S OXIDOREDUCTASE (CHOH(D) - NAD(P)) glucose 6-phosphate 96: 3027-A 2g5c-A 3.8 3.6 119 270 9 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE prephenate dehydrogenase (aquifex aeol 97: 3027-A 2ax3-A 3.7 4.0 136 483 13 0 0 17 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 98: 3027-A 1dap-A 3.7 5.0 127 320 12 0 0 18 S OXIDOREDUCTASE diaminopimelic acid dehydrogenase (dapd 99: 3027-A 1d3v-A 3.7 3.9 128 308 9 0 0 18 S HYDROLASE arginase (rattus norvegicus) rat expression 100: 3027-A 2ohx-A 3.6 5.4 127 374 12 0 0 19 S OXIDOREDUCTASE(NAD(A)-CHOH(D)) Alcohol dehydrogenase ( 101: 3027-A 1vl6-A 3.6 7.4 142 371 8 0 0 20 S OXIDOREDUCTASE malate oxidoreductase (thermotoga mari 102: 3027-A 1tf7-A 3.6 6.4 137 484 6 0 0 19 S CIRCADIAN CLOCK PROTEIN kaic (synechococcus sp.) expr 103: 3027-A 1db3-A 3.6 3.8 121 335 14 0 0 17 S LYASE gdp-mannose 4,6-dehydratase (escherichia coli) 104: 3027-A 1c7n-A 3.6 3.7 115 394 9 0 0 16 S TRANSFERASE cystalysin (treponema denticola) bacteria 105: 3027-A 2okj-A 3.5 4.0 115 500 12 0 0 13 S LYASE glutamate decarboxylase 1 (glutamate decarboxyla 106: 3027-A 2g1u-A 3.5 3.3 98 135 8 0 0 11 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 107: 3027-A 2c0c-A 3.5 5.6 129 353 9 0 0 22 S OXIDOREDUCTASE zinc binding alcohol dehydrogenase, dom 108: 3027-A 1i36-A 3.5 3.2 104 258 17 0 0 14 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION conserved hypoth 109: 3027-A 1fdr 3.5 3.5 110 244 12 0 0 15 S FLAVOPROTEIN flavodoxin reductase (ferredoxin reductas 110: 3027-A 1cqx-A 3.5 9.1 115 403 11 0 0 15 S LIPID BINDING PROTEIN flavohemoprotein (alcaligenes e 111: 3027-A 2iv7-A 3.4 4.2 129 364 14 0 0 16 S TRANSFERASE lipopolysaccharide core biosynthesis prote 112: 3027-A 1yj8-A 3.4 5.0 144 357 10 0 0 21 S OXIDOREDUCTASE glycerol-3-phosphate dehydrogenase (pl 113: 3027-A 1yac-A 3.4 4.8 122 204 8 0 0 14 S UNKNOWN BACTERIAL HYDROLASE ycac gene product (ycacgp) 114: 3027-A 1hv8-A 3.4 4.3 139 363 8 0 0 19 S RNA BINDING PROTEIN putative atp-dependent RNA helica 115: 3027-A 1dty-A 3.4 3.8 116 429 9 0 0 16 S TRANSFERASE adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate 116: 3027-A 1cyd-A 3.4 4.1 132 242 12 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE carbonyl reductase (mus musculus) mous 117: 3027-A 1cl2-A 3.4 4.0 110 391 5 0 0 15 S METHIONINE BIOSYNTHESIS cystathionine beta-lyase (beta 118: 3027-A 2gti-A 3.3 4.9 103 343 10 0 0 16 S VIRUS/VIRAL PROTEIN replicase polyprotein 1ab fragment 119: 3027-A 2gpj-A 3.3 3.3 104 240 9 0 0 14 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION siderophore-inte 120: 3027-A 2dg2-A 3.3 4.0 130 226 10 0 0 17 S PROTEIN BINDING apolipoprotein a-i binding protein fra 121: 3027-A 2dc1-A 3.3 3.4 105 236 10 0 0 14 S OXIDOREDUCTASE l-aspartate dehydrogenase (archaeoglob 122: 3027-A 2b69-A 3.3 4.2 134 302 10 0 0 22 S LYASE udp-glucuronate decarboxylase 1 fragment (homo 123: 3027-A 1wp9-A 3.3 4.5 127 479 7 0 0 17 S HYDROLASE atp-dependent RNA helicase, putative fragmen 124: 3027-A 2jgd-A 3.2 4.8 138 811 9 0 0 19 S OXIDOREDUCTASE 2-oxoglutarate dehydrogenase e1 compone 125: 3027-A 2fr0-A 3.2 4.0 127 468 7 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE erythromycin synthase, eryai fragment 126: 3027-A 2ffj-A 3.2 4.3 141 263 9 0 0 23 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION conserved hypoth 127: 3027-A 1x9g-A 3.2 4.1 112 192 14 0 0 13 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION putative mar1 ( 128: 3027-A 1bw9-A 3.2 5.2 145 350 6 0 0 21 S AMINO ACID DEHYDROGENASE phenylalanine dehydrogenase b 129: 3027-A 2obn-A 3.1 3.9 97 335 11 0 0 12 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 130: 3027-A 2fph-X 3.1 3.5 76 165 12 0 0 8 S DNA BINDING PROTEIN ylmh fragment (streptococcus pneu 131: 3027-A 2aeu-A 3.1 3.4 108 366 6 0 0 13 S UNKNOWN FUNCTION hypothetical protein mj0158 (methano 132: 3027-A 1vl1-A 3.1 3.9 122 218 7 0 0 19 S HYDROLASE 6-phosphogluconolactonase (6pgl) (thermotog 133: 3027-A 1upa-A 3.1 5.8 129 548 9 0 0 18 S SYNTHASE carboxyethylarginine synthase (streptomyces 134: 3027-A 1o14-A 3.1 3.8 128 319 8 0 0 16 S 135: 3027-A 1n2s-A 3.1 3.7 124 298 10 0 0 18 S OXIDOREDUCTASE dtdp-glucose oxidoreductase (dtdp-6-deo 136: 3027-A 1gz5-A 3.1 4.0 129 452 6 0 0 15 S SYNTHASE alpha-trehalose-phosphate synthase (trehalose 137: 3027-A 1g8y-A 3.1 3.6 131 242 9 0 0 18 S TRANSCRIPTION regulatory protein repa (replication pr 138: 3027-A 2p2s-A 3.0 3.4 105 329 10 0 0 15 S OXIDOREDUCTASE putative oxidoreductase (erwinia carot 139: 3027-A 2nvu-A 3.0 3.3 100 530 9 0 0 13 S PROTEIN TURNOVER, LIGASE nedd8-activating enzyme e1 re 140: 3027-A 1trk-A 3.0 3.8 126 678 10 0 0 16 S TRANSFERASE(KETONE RESIDUES) Transketolase Baker's ye 141: 3027-A 1sht-X 3.0 3.6 98 177 6 0 0 13 S MEMBRANE PROTEIN anthrax toxin receptor 2 fragment (ca 142: 3027-A 1m6n-A 3.0 3.3 111 802 6 0 0 14 S PROTEIN TRANSPORT preprotein translocase seca (seca) 143: 3027-A 1g8j-A 3.0 3.8 132 820 6 0 0 19 S OXIDOREDUCTASE arsenite oxidase fragment arsenite oxi 144: 3027-A 2j4j-A 2.9 4.2 109 216 7 0 0 14 S TRANSFERASE uridylate kinase (uk, uridine monophosphat 145: 3027-A 1zmb-A 2.9 3.9 123 274 7 0 0 20 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION acetylxylan este 146: 3027-A 1q74-A 2.9 3.9 131 287 7 0 0 21 S HYDROLASE 1d-myo-inosityl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-d- 147: 3027-A 1o89-A 2.9 7.7 122 320 8 0 0 17 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION yhdh (b3253, yhd 148: 3027-A 1n9g-A 2.9 7.3 131 364 12 0 0 17 S HYDROLASE 2,4-dienoyl-coa reductase 2,4-dienoyl-coa re 149: 3027-A 1jw9-B 2.9 4.2 106 240 9 0 0 13 S LIGASE molybdopterin biosynthesis moeb protein molybd 150: 3027-A 1j3v-A 2.9 3.2 108 283 12 0 0 13 S 151: 3027-A 1e8c-A 2.9 8.0 122 495 9 0 0 14 S LIGASE udp-n-acetylmuramoylalanyl-d-glutamate--2,6- d 152: 3027-A 2i4i-A 2.8 3.7 120 408 10 0 0 18 S HYDROLASE atp-dependent RNA helicase ddx3x (dead box p 153: 3027-A 2fwr-A 2.8 3.7 104 434 6 0 0 14 S DNA BINDING PROTEIN DNA repair protein rad25 (archaeo 154: 3027-A 2cpm-A 2.8 3.4 76 94 8 0 0 7 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION sperm-associated 155: 3027-A 1ngv-A 2.8 3.2 97 529 9 0 0 14 S 156: 3027-A 1mjg-M 2.8 7.8 116 728 8 0 0 14 S OXIDOREDUCTASE carbon monoxide dehydrogenase beta subu 157: 3027-A 1kqf-A 2.8 4.4 131 982 8 0 0 18 S OXIDOREDUCTASE formate dehydrogenase, nitrate-inducibl 158: 3027-A 1eg2-A 2.8 3.2 106 270 7 0 0 13 S TRANSFERASE modification methylase rsri (adenine-spec 159: 3027-A 1ecx-A 2.8 5.6 110 364 8 0 0 13 S TRANSFERASE aminotransferase (thermotoga maritima) ex 160: 3027-A 1ajs-A 2.8 5.9 138 413 8 0 0 19 S AMINOTRANSFERASE aspartate aminotransferase biological 161: 3027-A 2hzb-A 2.7 4.0 115 306 10 0 0 17 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical upf 162: 3027-A 2dri 2.7 7.1 121 271 8 0 0 18 S SUGAR TRANSPORT D-ribose-binding protein complexed wit 163: 3027-A 2c1x-A 2.7 4.4 114 434 11 0 0 17 S TRANSFERASE udp-glucose flavonoid 3-o glycosyltransfer 164: 3027-A 2bfw-A 2.7 3.5 99 196 12 0 0 11 S TRANSFERASE glga glycogen synthase (c domain of glycog 165: 3027-A 1z5u-A 2.7 8.0 106 208 8 0 0 13 S HYDROLASE apha protein (salmonella typhimurium) bacte 166: 3027-A 1wdh-A 2.7 3.4 93 248 9 0 0 14 S 167: 3027-A 1tlt-A 2.7 4.7 121 304 9 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE putative oxidoreductase (virulence fact 168: 3027-A 1t9k-A 2.7 5.7 124 332 7 0 0 15 S ISOMERASE probable methylthioribose-1-phosphate isomer 169: 3027-A 1sxg-A 2.7 4.1 121 275 5 0 0 18 S TRANSCRIPTION glucose-resistance amylase regulator (ca 170: 3027-A 1rkx-A 2.7 4.1 142 349 8 0 0 22 S LYASE cdp-glucose-4,6-dehydratase (yersinia pseudotub 171: 3027-A 1r27-A 2.7 4.2 111 1218 12 0 0 17 S OXIDOREDUCTASE respiratory nitrate reductase 1 alpha c 172: 3027-A 1qs0-A 2.7 5.8 138 407 12 0 0 20 S OXIDOREDUCTASE 2-oxoisovalerate dehydrogenase alpha-su 173: 3027-A 1pmm-A 2.7 4.2 117 450 9 0 0 15 S LYASE glutamate decarboxylase beta (gad-beta) (escher 174: 3027-A 1g6o-A 2.7 5.3 133 323 8 0 0 19 S HYDROLASE cag-alpha (traffic atpase) (helicobacter p 175: 3027-A 1fnc 2.7 4.5 112 296 6 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE (NADP+(A),FERREDOXIN(A)) Ferredoxin:nad 176: 3027-A 1e20-A 2.7 3.7 110 185 5 0 0 17 S FLAVOPROTEIN halotolerance protein hal3 (hal3) (arab 177: 3027-A 4uag-A 2.6 4.5 106 429 9 0 0 17 S LIGASE udp-n-acetylmuramoyl-l-alanine:d-glutamate liga 178: 3027-A 2b8t-A 2.6 3.9 104 206 7 0 0 14 S TRANSFERASE thymidine kinase (ureaplasma parvum) prot 179: 3027-A 1zmt-A 2.6 4.1 126 252 12 0 0 17 S LYASE haloalcohol dehalogenase hhec (agrobacterium ra 180: 3027-A 1z88-A 2.6 7.9 113 208 8 0 0 15 S HYDROLASE apha protein Mutant (salmonella typhimurium 181: 3027-A 1z5g-A 2.6 7.9 110 208 7 0 0 14 S HYDROLASE apha protein (salmonella typhimurium) bacte 182: 3027-A 1yns-A 2.6 3.4 89 254 9 0 0 14 S HYDROLASE e-1 enzyme (enolase-phosphatase e1) (homo s 183: 3027-A 1thg 2.6 4.2 129 544 5 0 0 23 S HYDROLASE(CARBOXYLIC ESTERASE) Lipase triacylglycerol 184: 3027-A 1t57-A 2.6 3.7 91 179 4 0 0 13 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION conserved protei 185: 3027-A 1qyi-A 2.6 4.0 98 375 9 0 0 14 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 186: 3027-A 1ohi-A 2.6 3.2 97 240 7 0 0 13 S 187: 3027-A 1ngv-B 2.6 3.3 105 398 11 0 0 12 S 188: 3027-A 1nf8-A 2.6 3.7 102 207 11 0 0 14 S HYDROLASE phenazine biosynthesis protein phzd Mutant 189: 3027-A 1im5-A 2.6 3.2 94 179 13 0 0 11 S HYDROLASE 180aa long hypothetical pyrazinamidaseNICOT 190: 3027-A 1ibj-A 2.6 11.7 109 380 12 0 0 16 S LYASE cystathionine beta-lyase (cbl) (arabidopsis th 191: 3027-A 1a8i 2.6 4.3 143 813 7 0 0 21 S GLYCOGEN PHOSPHORYLASE glycogen phosphorylase b biolog 192: 3027-A 2h1q-A 2.5 5.1 120 241 8 0 0 18 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 193: 3027-A 2ex0-A 2.5 6.5 117 392 9 0 0 18 S TRANSFERASE a2,3-sialyltransferase, a2,6-sialyltransfe 194: 3027-A 2dt5-A 2.5 3.6 87 210 11 0 0 12 S DNA BINDING PROTEIN at-rich DNA-binding protein (redox 195: 3027-A 2db3-A 2.5 4.8 129 420 12 0 0 23 S HYDROLASE/RNA atp-dependent RNA helicase vasa fragment 196: 3027-A 2crq-A 2.5 3.1 80 112 8 0 0 10 S TRANSLATION mitochondrial translational initiation fac 197: 3027-A 2b8j-A 2.5 8.7 111 211 8 0 0 15 S HYDROLASE class b acid phosphatase (apha) (escherichi 198: 3027-A 2b82-A 2.5 8.3 110 211 5 0 0 15 S HYDROLASE class b acid phosphatase (apha) (escherichi 199: 3027-A 1tj5-A 2.5 3.4 94 244 9 0 0 11 S HYDROLASE sucrose-phosphatase (synechocystis sp.) exp 200: 3027-A 1tj3-A 2.5 3.3 94 244 9 0 0 11 S HYDROLASE sucrose-phosphatase (synechocystis sp.) exp 201: 3027-A 1svv-A 2.5 5.1 114 328 9 0 0 17 S LYASE threonine aldolase (leishmania major) expressio 202: 3027-A 1fui-A 2.5 3.6 105 591 11 0 0 16 S ISOMERASE l-fucose isomerase biological_unit (escheri 203: 3027-A 1esc 2.5 4.8 134 302 12 0 0 23 S HYDROLASE (SERINE ESTERASE) esterase (streptomyces sc 204: 3027-A 2hru-A 2.4 3.9 122 581 6 0 0 15 S LIGASE phosphoribosylformylglycinamidine synthase ii ( 205: 3027-A 2h85-A 2.4 5.6 112 347 4 0 0 16 S VIRUS/VIRAL PROTEIN putative orf1ab polyprotein Mutant 206: 3027-A 2fi1-A 2.4 2.7 77 187 13 0 0 10 S HYDROLASE hydrolase, haloacid dehalogenase-like family 207: 3027-A 2ahr-A 2.4 4.2 113 250 12 0 0 17 S OXIDOREDUCTASE putative pyrroline carboxylate reductas 208: 3027-A 1u2s-A 2.4 3.8 96 244 7 0 0 11 S HYDROLASE sucrose-phosphatase (spp) (synechocystis sp 209: 3027-A 1c0n-A 2.4 8.8 123 404 12 0 0 18 S LYASE csdb protein (escherichia coli) bacteria expres 210: 3027-A 2hs4-A 2.3 3.8 123 602 7 0 0 17 S LIGASE phosphoribosylformylglycinamidine synthase ii ( 211: 3027-A 2fzl-A 2.3 4.4 99 197 7 0 0 11 S DNA BINDING PROTEIN DNA repair protein rad25, xpb frag 212: 3027-A 1rzu-A 2.3 6.2 123 477 8 0 0 21 S TRANSFERASE glycogen synthase 1 (starch [bacterial gly 213: 3027-A 1qq5-A 2.3 3.8 100 245 12 0 0 14 S HYDROLASE l-2-haloacid dehalogenase (xanthobacter aut 214: 3027-A 1jv1-A 2.3 6.1 139 490 7 0 0 19 S TRANSFERASE glcnac1p uridyltransferase isoform 1 (udp- 215: 3027-A 1fmt-A 2.3 3.9 112 308 5 0 0 15 S FORMYLTRANSFERASE methionyl-trna fmet formyltransferas 216: 3027-A 2p4e-A 2.2 4.1 109 494 12 0 0 18 S HYDROLASE proprotein convertase subtilisinKEXIN TYPE 9 217: 3027-A 2oas-A 2.2 4.1 130 420 12 0 0 22 S TRANSFERASE 4-hydroxybutyrate coenzyme a transferase ( 218: 3027-A 2iya-A 2.2 3.8 94 392 13 0 0 12 S TRANSFERASE oleandomycin glycosyltransferase (olei) e 219: 3027-A 2hx1-A 2.2 3.9 102 275 4 0 0 15 S HYDROLASE predicted sugar phosphatases of the had supe 220: 3027-A 2gk4-A 2.2 5.3 128 225 6 0 0 22 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION conserved hypoth 221: 3027-A 2bde-A 2.2 4.4 135 450 6 0 0 20 S DNA BINDING PROTEIN cytosolic imp-gmp specific 5'-nucl 222: 3027-A 1zwx-A 2.2 4.3 127 288 6 0 0 20 S HYDROLASE sphingomyelinase-c (smcl) (listeria ivanovi 223: 3027-A 1p3y-1 2.2 4.0 104 171 3 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE mrsd protein (bacillus sp. hil-y855472 224: 3027-A 1e32-A 2.2 4.4 116 438 10 0 0 15 S ATPASE p97 fragment (mus musculus) house mouse expre 225: 3027-A 2glz-A 2.1 4.2 86 147 6 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION similar to formy 226: 3027-A 2ako-A 2.1 4.1 103 237 7 0 0 13 S TRANSFERASE glutamate 5-kinase (gamma-glutamyl kinase, 227: 3027-A 1tyo-A 2.1 4.7 110 427 9 0 0 15 S OXIDOREDUCTASE isocitrate dehydrogenase (aeropyrum pe 228: 3027-A 1i6w-A 2.1 3.7 96 179 9 0 0 13 S HYDROLASE lipase a (bacillus subtilis) bacteria expr 229: 3027-A 1di0-A 2.1 3.3 84 148 7 0 0 12 S TRANSFERASE lumazine synthase (brucella abortus) bact 230: 3027-A 1d4o-A 2.0 3.9 103 177 8 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE nadp(h) transhydrogenase fragment (bos
- ALIGNMENTS 1 - 30
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L Dh . . . . . . . 2 3 A D - 0 0 0 19 D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A Ah . . . . . Sh . 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 Qs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L Lh . . . . Ne Fh . 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 Ts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S Lh Lh . . . D Vh . 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 Ah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Th Nh . . . A Yh . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 Lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Rh Ah . . . Rg . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 Ah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dh Rh Ah . . . Tg . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 Th . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ah Rh Ih . . . Rg . . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Hh Dh Dh . . . Eg . . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 Ih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fh Gt Lt . . . Lg . . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 Kh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . E Nt . . . Eg . . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gt . . 13 14 A L H X S+ 0 0 0 17 Lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ls . . . . . . 14 15 A I H X S+ 0 0 0 13 Ih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . P . . . . . . 15 16 A K H < S+ 0 0 0 22 Kh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ag . . . . . . 16 17 A A H < S+ 0 0 0 25 Ah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sg . . . . . . 17 18 A A H < S- 0 0 0 25 Ah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tg . . . . . . 18 19 A G < 0 0 0 24 G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Q . . . . . . 19 20 A P 0 0 0 20 P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . H . . . . . . 20 22 A P >> 0 0 0 22 P Es . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ph . . . . . . 21 23 A V T 34 + 0 0 0 23 Vt D . Qt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nh . . . . . . 22 24 A W T 34 S+ 0 0 0 24 Wt Eh . Kt . . . . Kt . . . . . . . . . . . . . . Rh . . . . . . 23 25 A R T <4 0 0 0 22 Rt Kh . Nt . . . . Nt . . . . . . . . . . . . . . Lh . . . . . . 24 26 A Y < 0 0 0 19 Y Qh . Q Q . . . Q . . . . . . . . . . . . Ch . . . . . . . . 25 28 A E > 0 0 0 13 E Fh . V At . . . V . . . . . . . . . . . . Qh . . . . . . . . 26 29 A L H > + 0 0 0 17 Lh Sh . . Ht . . K . S . . . D . . . . . . . Lh . . . . . . . . 27 30 A C H 4 S+ 0 0 0 20 Ch Kh . L Ys . . L L Lg . . A V . . . . . . . Ih . . . . . . . . 28 31 A L H 4 S+ 0 0 0 21 Lh Ah . T D . . R T Fg . . Vh Rh . . . . . . . Yh . . . . . . . . 29 32 A G H < + 0 0 0 20 Gh Kh . Lh . . . Sh Lh Sg . . Ah Qh . . . . . . . Qh . . . . . . . . 30 33 A H X - 0 0 0 18 H . . Eh . . . . Eh D . . Sh . . . . . . . . Rh . . F . . . . . 31 34 A P T 4 S+ 0 0 0 11 Pt . . . . . . . . Hh . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . 32 35 A E T 4 S+ 0 0 0 13 Et . . . . . . . . Gh . . . . . . . . . . . . . . E . . . . . 33 36 A H T 4 S+ 0 0 0 16 Ht . . . . . . . . Kh . . . . . . . . . . . . . . K . . . . . 34 37 A G X - 0 0 0 18 G Th F . . . . Eh . . . . . Vh R . . . . . . . . . . . . . . . 35 38 A Y T 4 S+ 0 0 0 28 Yt Yh I Dh V . . Fh Eh . . . Ah Lh G . Ns . . . . Fh . . . . . . . . 36 39 A Y T 4 S+ 0 0 0 36 Yt Wh F Wh S . . Yh Wh Yh . . Yh H Dh . P . . . . Ih . . . . . . . . 37 40 A V T 4 S+ 0 0 0 37 Vt Kh D Kh Dh . . Dh Qh Vh . . Qt M Dh . K . . . . Nh . . . . . . Ds . 38 41 A T < 0 0 0 39 T Qt Eh Eh Dh . Gs Rh Dh Eh . . Rt . Fh . Vg . . . . Ah . . . . . . Gs . 39 42 A R 0 0 0 42 R Is Nh Kh Fh . I Ih Kh Sh . . Fb . Yh Et . . . . . Lh . . . . . . Ls N 40 51 A F 0 0 0 44 F Gt Dh I T Y Q . T . . . Rh S . Rs . H . . W . . Vh . . H Y M E 41 52 A T + 0 0 0 57 T Gt Xh St Y Dh Vg . At . . . Nh Fh Y L Y I . . A . . Dh . . At Lg Lg Mh 42 53 A T S >> S- 0 0 0 65 Ts Y Ih Ft Ss Ah Q . Ft . . . Nh Ih Ts I R P Q Ie M L . Vh . . Gt Dg Dg Lh 43 54 A S H 3> S+ 0 0 0 64 Sh Gg Qh H C Lh T . H . . . Yh Qh S . T V V Le N T . Ch . . Ns Qg Qg . 44 55 A P H 34 S+ 0 0 0 50 Ph . . Q . . P . Q . . . . Rh G . P . I K V A . . . Y . Rh Rh . 45 56 A E H <4 S+ 0 0 0 61 Eh Hg . Et Eh Sh Dh Kh Et Qh . . Rt . Eh P . . Y N Gh Ft F Ah Ee Lt . . . Vh 46 57 A I H < S- 0 0 0 60 Ih Ig . . Ah Ch . Lh . Ch . . Gt . Lh T . . Ph . . . Ws Th De Kt . . . Rh 47 58 A S < 0 0 0 80 S Sh Sh . Qh Kh . Yh . Mh I . D . Qh Vh Gh . Kh Ph Dh . Ss Eh Ie Nt . . . Hh 48 59 A Q 0 0 0 82 Q Sh Nh Qt Yh Lh Sh Hh Qt Qh I . Lt . Dh Ph Nh . . Lh Ah . Ls Xh Le Th . . . Ih 49 61 A F > 0 0 0 110 F Dh Ih G Kh Rh Ih Ih G Fh Rs D Kh Vh Kh Lh Ah . Dh Ih Kh . . . Rt Rh Kh Nh Vh Dh 50 62 A G H > + 0 0 0 106 Gh Ih Ih H Vh Th Gh Gh H Mh Q Lt Lh Ih Lh Rh Ah V Ah Ih Gh . . . . . Hh Rh Rh Sh 51 63 A E H > S+ 0 0 0 112 Eh Nh Th Qh Dh Vh Fh Sh Qh Dh Pt At Rh Sh Kh Lh Sh Rh Ah Nh Qh At . . . . Ih Lh Nh Ih 52 64 A L H > S+ 0 0 0 121 Lh Sh Ah Lh Lh Gh Ih Fh Lh Kh Qh Kt Ch Ih Th Nh Eh Eh Qh Sh Ih Ht . . . Yh Th Y Eh Vh 53 65 A L H X S+ 0 0 0 126 Lh Sh Ih Lh Nh Ih Vh Lh Lh Lh Lh L Lh Tt Vh Yh Lh Vh Ih Ih Mh Hh Lh . . Vh Lh . Lh Vh 54 66 A G H X S+ 0 0 0 125 Gh Rh Gh Kh Lh Dh Ah Eh Kh Ph Yh . Ah Kh Ch Ih Lh Ih Vh Ih Dh Fh Vh . . Sh Th . Ih Ag 55 67 A L H X S+ 0 0 0 137 Lh Kh Xh Kh Dh Ah Yh Eh Kh Gh Rh Q Qh Ph Eh Hh Wh Eh Hh Dh Ah Ph Eh T . Fh Rh E Gt Pg 56 68 A W H X S+ 0 0 0 141 Wh Fh Lh Hh Kt Ah Lh Yh Hh Ih Fh It Th Ih Kt Wh Lh Fh Eh At Vh Ih Qh Gt V Lh Lh R St Yg 57 69 A S H X S+ 0 0 0 140 Sh Lh Ah Lh Ls Ih Lh L Lh Is Lh At Fh Th It Vh Ah Lh Gt A Ih Lh Ah Ft V Vh Lh F At L 58 70 A A H X S+ 0 0 0 140 Ah Qh Eh Dh D Lh Eh K Dh Gs Kh A Gs Eh Q Eh Yh K Dt L Rh Ah Lh Et V Nh Ah R Ab Q 59 71 A S H X S+ 0 0 0 122 Sh Rg Rh Th L Eh Kh Ns Th Rs Yh L E Ah . Dh Sh . . R Eh Eh At Gt D Ws Yh . . Gs 60 72 A V H X S+ 0 0 0 102 Vh Fg Fh Fh . Fh Vh . Fh It Ch . Vs Ah . Lh Lt . . . Yh Hh Rt I . K Lh . . . 61 73 A W H <>S+ 0 0 0 98 Wh Lg V Lh . Lh Ih . Lh Gt Nh . S Ih . Ih Gt . . . S Ah Lt . . I Tt . . . 62 74 A K H ><5S+ 0 0 0 71 Kh R . Kt . Vh Qt . Kt Dt Eh . . Th . G . . . . . Rh Pt . . T Ht . . . 63 75 A A H 3<5S+ 0 0 0 42 Ah K . . . . . . . . . . . Ah . H . . . . . . Et . . . . . . . 64 76 A A T 3<5S- 0 0 0 38 At T . . . . . . . . Ss . . Lh . . . . . . . . Q . . . . . . . 65 77 A D T < 5 - 0 0 0 46 Dt . . . . . . . . . Ns . . Ds . . . . . . . Rh . . . . . . . . 66 78 A E < - 0 0 0 69 E . . Gt . Ah Kt . Gt Tt Ls . . Ts . . . . . . . Rs . . . . Ks . . . 67 79 A P - 0 0 0 79 P . T Q . N K . K K D K . Vs K . . . . . . H . . . . Ds . . . 68 80 A Q S S+ 0 0 0 117 Qs . At S . Es Ks . S Ss . Gs . Ts Et T . Dt . . . Gs . . . Ks Ks . . . 69 81 A T S S- 0 0 0 161 Ts T Dt Gs Gt Ks Ne P Gs Es . N G Re Gt L Gt Et Gt Tt . E . . Dt P P Ge . . 70 82 A L E -a 98 0A 0 220 Le Ss S L M Ve Ve C L I Ks E Rs Le E R K K A D Ss Ye Cs Ss D V L Ee K Es 71 83 A R E -ab 99 137A 0 225 Re Ce Ne Re Te Qe Se Re Re Ke Te Ee Te A Ye Re Ve Ie Re Ve Le Re Rs Te De He Fe Re Te Re 72 84 A L E -ab 100 138A 0 225 Le Ae Ve Ve Le Ve Ie Ve Ve Ie Ve Ve Le I Le Ge Ve Ie Ve Ve Ve Ve Ie Le Ie Ie Ye Ae Ve Fe 73 85 A I E -ab 101 139A 0 225 Ie Le Ye Fe Le Ve Le Le Fe Le Le Le Ie Ae Le Ie Ae Le Le Le Le We Le Ve Le Ve Le Le Le Ie 74 86 A E E -ab 102 140A 0 224 Ee De De Fe De Ne De De Fe Se De De De De De De De De Ee Ee Ee Se De De De De Ee De Ne De 75 87 A I E S+a 103 0A 0 215 Ie Ce Le Pt Ie Le Pt Le Pt Ie Ce Ve Ie Le Le Ie Le Ct Ae Ve Le As Le Ve Le Ye Ts Ve Le Ve 76 88 A G - 0 0 0 214 G Gt Gs Lt Gs Gt At Gt Lt Gt Gs At Gs Gs Gt Gs Gt Tt G G G A Gt Gt Gt Gt H Fs Ft Gt 77 89 A P > - 0 0 0 182 P A C C C C C G C G A T S C C T A V A P A A T G C C S S S T 78 90 A G T 3 S- 0 0 0 180 Gt Gt St Gt Gt Gt Gt Gt Gt Gt G Gt Gt S Gt At Gt Gt Gt Gt Yt St Gt Gt Gt Gt Gt Yt Yt Gt 79 91 A R T 3 S- 0 0 0 155 Rt It Rt Kt Wt St Tt Tt Kt At Gs Gt Pt Ss Wt St Tt Et St Tt Ct Tt Tt St Yt Yt Rt At Tt Pt 80 92 A G < 0 0 0 137 G Gt G A Gs D As G A Gs Ds G T Gs Gt Ct G Gs Gs Gs Gs Gt Gs Gs Gs Gt Gs Gt At Gt 81 93 A T 0 0 0 147 T Rh Ah It Th L Nh Kh V Eh Ls Hh V Pt Tt Ih Vh Gh Ah Nt Yh Eh Ah Rh Vh Yh Ie Gh Ah Lt 82 96 A A > 0 0 0 217 A Kh Lh Kh Rh . Th Lh K Lh Sh Nh Yg Lt Ah Lh Yh Rh Lh Vh Vh Yh Lh Eh Ih Lh Yh Lh Vh Ih 83 97 A D H > + 0 0 0 217 Dh Rh Sh Wh Rh . Th Fh Wh Qh Ih Ah Qg Ft Fh Lh Gh Ah Sh Kh Rh Sh Ah Lh Ah Vh Fh Hh Ah Ph 84 98 A A H > S+ 0 0 0 217 Ah Lt Ah Fh Ah Rt Vh Lh Fh Ih Fh Fh Lg Ag Ah Gh Ah Ih Lh Lh Mh Ih Lh Ih Lh L Ah Lh Ah Lh 85 99 A L H > S+ 0 0 0 220 Lh Lt Rh Ah Vh Mh Ih Qh Ah Lh Vh Ag Lt Vg Sh Ah Lh Lh Lh Lh Ah Ah Ah Ih Ag P Ih At Ah Sh 86 100 A R H < S+ 0 0 0 204 Rh . Rh . Eh Lh Nh Et . Sh Eh Pg . Tg Sh Th Lh Eh Rh Eh Rt Ih Sh St Dg . Nh Lt Mh Ih 87 101 A A H >< S+ 0 0 0 180 Ah . Nt . Rh Ph Qh Rt . Kh . . . Et Qh Lh Lt Hh Ah . Lt Th Eh Kt Eg . Qh . Gt Vh 88 102 A L H >< S+ 0 0 0 166 Lh . I . Fh Lh Lh Gt . Vh . . . Ih Yh Nh Gt . Vh . L Lh . Y Vs . Ls . Gt R 89 103 A R T 3< S+ 0 0 0 98 Rt . . . D Lh Eh . . Qh . . . Kh . G . . . . . Ah . Pt . . . . . Pt 90 104 A V T < S+ 0 0 0 61 Vt . . . . Qh Lt . . Ah . . . Th . . . . . . . Dh . . . . . . . . 91 105 A L S <> S- 0 0 0 55 Ls . . . . Mh Kt . . Ys . . . Vh . . . . . . . Ah . . . . . . . . 92 106 A P H > S+ 0 0 0 48 Ph . . . . . Gs . . Pt . . . Eh . . . . . . . Lh . . . . . . . . 93 107 A I H 4 S+ 0 0 0 49 Ih . . . . . Ds . . Gt . . . Eh . . . . . . . G . . . . . . . . 94 108 A L H >4 S+ 0 0 0 61 Lh . N . . . V . . V . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95 109 A Y H >< S+ 0 0 0 108 Yh Pt Q Dh . F . . Dh . . . Sg . . . . a G . Q . R . . P R . . . 96 110 A Q T 3< S+ 0 0 0 116 Qt Lt Ps Rt . Pt . . Rt . Dt . Hg P . . . Pt Pt . Pt Gt Pt . . Et St . . . 97 111 A S T < S+ 0 0 0 144 St F Ns Gt . Ht De . Gt . Gt Vs F Ee G . . Gt At . Gt Rs Dt Lt . Gt Qt . . Et 98 112 A L E < -a 70 0A 0 206 Le Rs V H V Le Ve F H I Y Ks Es Ye A W Ks a Gs Ks A We Cs Is Ks S Ds Re Ms As 99 113 A S E -a 71 0A 0 218 Se Ee Ke Te Ne Ae He Ee Se Ne Ke Ke De Qe Ke Ye Ee Re Qe Ke Re Ke E Ke Se Ke Re Ee Ae He 100 114 A V E -ac 72 123A 0 222 Ve Ve Ie Ve Ve Ye Ae Ve Ve Ne Te Ve Ie Ie Ve Fe Ve Ie Ve Ve Le Ve Ie Ge Te Ye Le Ve Te Fe 101 115 A H E -ac 73 124A 0 222 He De Ie Ve Ie Ve Se Ve Ve Ee Ye Ve Te Fe Te Le Ie Ie Ie Ve Le Fe Ie Ie Te Te Ye Ve Te Te 102 116 A L E -ac 74 125A 0 221 Le Me Ge Ge Ge De Ge Le Ge Ve Ge Ae Me Le Ge Ae Ce Ge Se Ae Te Ae Ae Ne Xe Ge Le Ae Se Le 103 117 A V E +ac 75 126A 0 219 Ve Ve Ie Ve Le Ie Ve Ve Ve Ve Ie Fe Te Ne Ie Te Ve Ie Ye Ce Me Se Ve Fe Ae Ie Ce Ve Ve Le 104 118 A E - 0 0 0 216 E De D E Te De De De E E Ee De D De T Ee Ee De E Ee Ee De De De De De E De De De 105 119 A I + 0 0 0 197 I Is Ns Is Ls Y Vs Ps Is Ps I Ls Fs L Ls Vs Vs Vs Qs Ls Ms Is Rs L Is S L Ss Ls Ss 106 120 A N > - 0 0 0 180 N T S S S Nh D S S S S T L Pt G D D D R D N D Ms Ph N G Hs S A L 107 121 A P H > S+ 0 0 0 165 Ph Eh Qh Eh Kh Eh Dh K Eh Ah Dh Eh Eh Gt Kh Dh Kh Sh Ah Ph Ph Th Ph Qh Rh Eh Ph Ah Kt Gh 108 122 A V H > S+ 0 0 0 147 Vh Dh Ph Ih Nh . Lh E Lh Eh Lh Dh Vh . Nh Mh Eh Eh Dh Rh Dh Eh Dh . Rh Th Th Eh Rt Kh 109 123 A L H > S+ 0 0 0 158 Lh Fh Xh Gh Qh Sh Lh . Gh Qh Qh Ih Nh D Qh Ch Ah Vh Hh Lh Yh Vh Ah Vh Ah Lh Eh Ah Sh Rh 110 124 A R H X S+ 0 0 0 159 Rh Lh Vh Ih Hh Vh Ih L Ih Ih Lh Lh Rh Fh Th Fh Vh Lh Ah Vh Ah Lh Vh Ih Ih Lh Yh Lh Rh Vh 111 125 A Q H X S+ 0 0 0 158 Qh Vh Eh Rh Ah Eh Sh Eh Qh Ah Kh Kh Qh Nh Kh Nh Dh Rh Eh Ah Ah Eh Sh Et Kh Ah Nh Rh Ah Rh 112 126 A K H X S+ 0 0 0 168 Kh Qh Rh Eh Rh Lh Lh Vh Eh Kh Kh Vh Eh Ah Yh Yh Vh Ih Hh Eh Ih Kh Lh Nt Lh Eh Fh Rh Lh Fh 113 127 A Q H X S+ 0 0 0 163 Qh Ah Ch Fh Ch Kh Ah Ah Fh Yh Ah Ah Lh Ih Gh Ah Lh Ah Ah Lh Th Ah Ah . Ah Ah Lh Ah Sh Lh 114 128 A Q H < S+ 0 0 0 157 Qh Kh Rh Fh Eh Nh Lh Rh Fh Kh Eh Rh Gh Fh Nh Kh Ih Eh Rh Hh Qh Rh Qh A Kh Rh Lt Eh Lh Rh 115 129 A T H < S+ 0 0 0 157 Th Th Qh Ah Qh Sh Vh Eh Th Eh Nh Ah Rh Rt Dh Kh Eh Eh Rh Kh Qh Sh Rh P Eh Eh Kt Eh Ah Qh 116 130 A L H < S+ 0 0 0 153 Lh Yh Hh Eh Vh Ih Gh Kh Eh Lh Fh Fh Wh Lt Kh Nh Nh Kh Nh Rh Mh Gt Nh P Nh Lh . Nh Hh Vh 117 131 A L S >< S+ 0 0 0 159 Ls Lt Ih Qt Lh Lh Ah Gt Qt Vh Sh Ih Lh Pt It Vh Lt Lt Vh Vh Lh Ve Ah L Ih Fh Ls Ah Fh Qh 118 132 A A T 3 S+ 0 0 0 145 At Gg Ah Nt Ah Rh Qh . Nt T Nh Eh Qt It At Eh Gg Kg Sh Qt Nh R Qh . Kh Rh P Rh Eh Hh 119 133 A G T 3 S+ 0 0 0 129 Gt Eg At L St . Rt . L Ss Nt Gt Et Es St Nt Eg Eg P Gt Fh Qh At . Dt Ls H Gt D Kt 120 134 A I < - 0 0 0 149 I Gg Ys St Is Qe Q . St Ns F H Rh N F L Fg Fg P Ag Qt Eh I . Nt Ls Ft L M L 121 135 A R S S+ 0 0 0 144 Rs Kg H Gs Rs Gt K . Gs L K Q Ah Ds Kt St Gt Dt Dt Sg Dt Nt K St Ys Ys Ks G At Es 122 136 A N S S+ 0 0 0 152 Ns Rg P Ss S Rt . . Ns Ke . 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Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297 311 A T H > S+ 0 0 0 44 Th . . . . Sh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298 312 A R H X S+ 0 0 0 40 Rh . . . . Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 299 313 A A H < S+ 0 0 0 39 Ah . . . . Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 300 314 A L H < S+ 0 0 0 31 Lh . . . . Kh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301 315 A S H < 0 0 0 27 Sh . . . . Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 302 316 A L < 0 0 0 24 L . . . . Lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303 318 A A 0 0 0 21 A . . . . Sh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D . . . . 304 319 A K + 0 0 0 19 K . . . . Lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . 305 320 A A S S- 0 0 0 22 As . . . . Qs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . 306 321 A T > - 0 0 0 25 T . . . . F . . . . . . . . . . . . . . . . . . . H . . . . 307 322 A P H > S+ 0 0 0 21 Ph . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . H . . . . 308 323 A Q H > S+ 0 0 0 21 Qh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nh . . . . 309 324 A V H > S+ 0 0 0 22 Vh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dh . . . . 310 325 A S H X S+ 0 0 0 27 Sh . . . . . . Sh . . . . . . . . . . . . . . . . . Kh . . . . 311 326 A E H X S+ 0 0 0 27 Eh . . . . . . Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . Nh . . . . 312 327 A D H X S+ 0 0 0 34 Dh . . . . . . R . . . . . C . . . . . . . . . . . Dh . . . . 313 328 A I H X S+ 0 0 0 27 Ih . . . . . . Eh . . . . . Ts . . . . . . . . . . . Lh . . . . 314 329 A A H X S+ 0 0 0 28 Ah . . . . . . Eh . . . . . Ks . . . . . . . . . . . Yh . . . . 315 330 A G H X S+ 0 0 0 29 Gh . . . . . . Th . . . . . D . . . . . . . . . . . Qh . . . . 316 331 A A H X S+ 0 0 0 26 Ah . . . . . . Ih . . . . . . . . . S . . . . . . . Sh . P P . 317 332 A L H X S+ 0 0 0 28 Lh . . . . . . Fh . . . . . . . Qe . Eh . . . . . . . Lh . Ft St . 318 333 A Q H X S+ 0 0 0 41 Qh . . . . . Eg Rh . . . . . . . Gt . Eh . Kg . . . . . . . Dt Dt . 319 334 A R H < S+ 0 0 0 47 Rh . . . Ph . Tg Lh . . . . . . Vh Rt . Eh . Ng Yt . . . . . . Hs Fs . 320 335 A L H < S+ 0 0 0 56 Lh Ns . . Hh . Lg Eh . . . . . . Hh Te . Ih . Ng Ms . . . . . . . . V 321 336 A T H < S+ 0 0 0 70 Th L . A Yh . Fs Qh A S . Ke . . Yh . . . . Fe Ks . . . . . . . . P 322 337 A G < - 0 0 0 64 G P . L Ih . K Eh F Te Ve Te M . Sh . . . . . V . . . . . L P A D 323 338 A E + 0 0 0 66 E Dt . E Kh . . Lh E Me Ee Fe P . . . . . . . . . . . . . N V V G 324 339 A G S > S+ 0 0 0 57 Gs . . Eg Eh . . . Eg De Re Ie Ag Es Ah . . . . . . . . . . . P Lb N . 325 340 A R T 3 S- 0 0 0 54 Rt . . Rg Hh . . . . Le Ie Fh Hg K Sh . L . M . . . . . . Ve Ls Lt Vt . 326 341 A G T 3 0 0 0 56 Gt Et . Hg Yh Vh S . Ds Fe Ie Eh Lg T Sh . Ee . R . . . . . . Ye Is . . . 327 342 A A < 0 0 0 50 A Is . . Fh Mh Q . C Ne Ke Re Q Ke Th . Re . G . . . . . . A . Tg . . 328 344 A G 0 0 0 66 G Y Ft L . Qh A As L N Qe Ge . Fe . . Ie Rt H . . . Gs Nt Gt P . H N . 329 345 A S 0 0 0 78 S He Nt Fe De Tt R Ds Fe T Ge Ee Ge Ie Te Me Te St . E Ve . Ds St Gt N Ge Y Y Ee 330 347 A F 0 0 0 81 F Ve Fe Ee Ce Ye Ke He Ee Le Ye Se Ve Ne Ce Re Ve G A Se De . N Le Ye . Ce L L Re 331 348 A K E -EF 228 285A 0 79 Ke Ye Ge Ke Se Ie Se Ie Ke Se Ve Ie Fe Ve Ye We De Re Fe Se Ge . Ee Ge Re K Ge Ke Ke He 332 349 A V E +EF 227 284A 0 80 Ve Se Se Le Le Le Ie Fe Le Fe De L Fe Ie Qe Ae Ie Le Le Ve Le Qt Ve Ve Ve Ie Le Fe Ve Le 333 350 A I E -E 226 0A 0 84 Ie Fe Xe Ye Ve Me Le Fe Ye Ie Ye . Ae Ve Ie Le Ye Re Ve Ve Ee Tt Te Xe Le Te We Ae Fe Ve 334 351 A G E -EF 225 281A 0 83 Ge Ae Ie Le Te Ke Ie Ve Le Ve Ie K We Se Ve Ae Re Ae Ae Re Ke Ve Le Ee Ke Fe Ie Ve Te Ve 335 352 A V E +EF 224 280A 0 84 Ve Le Ae Le Ye Ae Le Le Le Ie Ae Ae Ae Le Le We Fe Ae Te Ie Ae Ye Ge Fe Se Ge Ie Fe Ie Ie 336 353 A S E -EF 223 279A 0 82 Se R Ve Te Le Qe Ee Ke Te Ee Ee Re Qe Ie Re Se Se Ee Re Ee Ie Ae Re Ye Ke Ee Ns Qe Ke Ke 337 354 A D > - 0 0 0 79 D . 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Le . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sh . . . 349 366 A D 0 0 0 23 D . . . . . Ae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . .
- ALIGNMENTS 31 - 60
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 Lh . . . . . . . . . . . . . . . R . . . . . . St . . . . . . 2 3 A D - 0 0 0 19 Eh . . . . . . N . . . . . . . . H . . . . . . Rt . . . . . . 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 Lh Le . . Ne . . Dh . . . . . . . . Le . . . . . . Q . . . . . . 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 Vh Ye . . D . . Lh . . . . . . . Eh Ge . . . . . . N . . Rt . . . 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 Eh G . . A . . Vh . . . . . . . Qh Le . . . . . . F . . Dt . . . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 Kh Ss . . Rt . . Ah . . . . . . . Vh Re . . . . . . Q . . E . . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 Rh . . . Th . . Kh . . . . . . . Vh He . . . . . . . . . Pg . . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 Ah . . . Rh . . Lh . . . . . . . Eh Ts . . . . . . . . . Kg . . . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 St . . . Eh . . Wh . . . . . . . Qh . . . . . . . . . . Lg . . . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 Gt . . . Lh . . Kh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 Y . . . Et . . Lh . . . . . . . . As . . . . . . . . . . . . . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 . . . . Gt . . Ch . . . . . . . . P . . . . . . . . . . . . . 13 14 A L H X S+ 0 0 0 17 . . . . . . . Dh . . . . . . . . L . . . . . . . . . . . . . 14 15 A I H X S+ 0 0 0 13 . . . . . . . Nh . . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . 15 16 A K H < S+ 0 0 0 22 . . . . . . . Lh . . . . . . . . Sh . . . . . . . . . . . . . 16 17 A A H < S+ 0 0 0 25 . . . . . . . Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 18 A A H < S- 0 0 0 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 19 A G < 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 20 A P 0 0 0 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 22 A P >> 0 0 0 22 . . . . . . . Lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 23 A V T 34 + 0 0 0 23 . . . . . . . Vh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 24 A W T 34 S+ 0 0 0 24 . . . . . . . Sh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 25 A R T <4 0 0 0 22 . . . . . . . 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Lg . . . . . . 35 38 A Y T 4 S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . . Lh . . . . . . . Ng . . . . . . 36 39 A Y T 4 S+ 0 0 0 36 . De . . . . . . . . . . . . . Sh . Ge . . . . . Lg . . . . . . 37 40 A V T 4 S+ 0 0 0 37 . Vt . . . . . . . . . . . . . Nh . Qe . . . . . . . . . . Qg . 38 41 A T < 0 0 0 39 . At . . . . . . . . . . . . . Ih Rs S . . . . . Fg . . . . Ag . 39 42 A R 0 0 0 42 . Kt . . . . . . . Qt . . . . . Lh Ds Ds . . . . . Rt . Qt . . Hg . 40 51 A F 0 0 0 44 . S . N A . . . . Qt . . A Pt . . F Ie Y . . . . Gt . A . . Yg . 41 52 A T + 0 0 0 57 . Pg N Pg Y . . . . V . . R Yt . . I Te Tt . . . . Lt . Te . . . . 42 53 A T S >> S- 0 0 0 65 . Ag Fe Rg Lg G F F . P . . P Qh . . Q Me Gt . . . . . . Ie . . . . 43 54 A S H 3> S+ 0 0 0 64 . Ng Le Mg Dg P I T . I . . S Gh . . . Te N . . . . . . S . . . . 44 55 A P H 34 S+ 0 0 0 50 . . N Ah Qg T T P . . . . P Qh . . . . K . . . . M . . . . . . 45 56 A E H <4 S+ 0 0 0 61 Ke . . . Rh A S Rh Ee . R . . Lh . We . . . . . . . L . . 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Ph . 289 303 A F H X S+ 0 0 0 70 . . . . . . . . . . . . . L . . . . . Q Q Q Q As Q . . Lh Hh Ve 290 304 A L H <>S+ 0 0 0 67 . . . . . . . . . . . . . Q . . . . . Pt Pt Pt Pt S Pt . . Th Yh Ds 291 305 A K H ><5S+ 0 0 0 63 . . . . . . . . . . . . . Pt . . . . . Gt Gt Gt Gt St Gt . . Lh Ih S 292 306 A R H 3<5S+ 0 0 0 54 . . . . . . . . . . . . . Ft . . . . . . . . . . . . . Rh Kh Qh 293 307 A L T 3<5S- 0 0 0 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lh . . 294 308 A G T <>5 + 0 0 0 48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N Th . 295 309 A I H ><S+ 0 0 0 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pt Lh . 296 310 A E H > S+ 0 0 0 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Rh . 297 311 A T H > S+ 0 0 0 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kt Ih . 298 312 A R H X S+ 0 0 0 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A Wh . 299 313 A A H < S+ 0 0 0 39 . . . . . . . . . . . . . . R . . . . . . . . . . . . L Gh . 300 314 A L H < S+ 0 0 0 31 . . . . . . . . . . . . . . I . . . . . . . . . . . . T Dh . 301 315 A S H < 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . L . . . . . . . . . . . . . Th . 302 316 A L < 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . . . . V . . . . . . . . . . . . . Lh . 303 318 A A 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sh . 304 319 A K + 0 0 0 19 . . . . . . . . . . . . . . R . . . . . . . . . . . . . Nt . 305 320 A A S S- 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . Et . . . . . . . . . . . . . Kh . 306 321 A T > - 0 0 0 25 . . . . . . . . . . . . . . Gt . . . . . . . . . . . . . Dh . 307 322 A P H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . Eh . 308 323 A Q H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . Eh . 309 324 A V H > S+ 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lh Vh . 310 325 A S H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh Yh . 311 326 A E H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Qh Nh . 312 327 A D H X S+ 0 0 0 34 . . . . . Ae . . . . . . . . R . . . . . . . . . . . . Hh Rh . 313 328 A I H X S+ 0 0 0 27 . . . . . Re . . . . . . . . P . . . . . . . . . . . . . Yh . 314 329 A A H X S+ 0 0 0 28 . . . . . G . . . . . . . . Ag . . . . . . . . . . . . . Mh . 315 330 A G H X S+ 0 0 0 29 . . . . . R . . . . . . . . Sg . . . . . . . . . . . . . Kh . 316 331 A A H X S+ 0 0 0 26 . . . . P . . . . . . . . . Dg . . . . . . . . . . . . . Yh . 317 332 A L H X S+ 0 0 0 28 . . . . Ft . . . . . . . . . Dg At . . . . . . . . . . . . Lh . 318 333 A Q H X S+ 0 0 0 41 . . Pg . Dt V Rt . . . . . . . Ls Et . Tt . . . . . . . . . . Rh . 319 334 A R H < S+ 0 0 0 47 . . Sg . Hs Sb Et Gs . . . . . . T Es . Tt . . . . . . . . . . Gh . 320 335 A L H < S+ 0 0 0 56 . . Ag . . R Ys I . . . . . A H G . Ys . A A A A . A . . . Ch . 321 336 A T H < S+ 0 0 0 70 . Re Fe . . N Fs Fs . . Y H . P . . D Pt . 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- ALIGNMENTS 61 - 90
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . D 2 3 A D - 0 0 0 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gs 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . Ds 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 . . . . . . . . . . Vb . . . . . N . . . . . . . . . Kh . . T 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 . . . . . . . . . . D . . . . . K . . . . . . . . . Lh . . . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 . . . . . . . . . . Vh Pg . . . . Y . . . . . . . . . Eh . . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . Dh Eg . Ft . . . . . . . . . . . . Ah . . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . Ah Vg . Qt . . . . . . . . . . . . . . . . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . Ah L . Nt . . . . . . . . . . . . . . . . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . Th Qe . K . . . . . . . . . . . . Fh . . . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 . . . . . . . . . . Ah . . . . . . . . . . . . . . . Dh . . . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . 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Ve . . . . . . . . . . . Ve . Mh . . . Dh . . Fh . . Fh . 311 326 A E H X S+ 0 0 0 27 . . . . Ie . . . . . . . . . . . Ie . Eh . . . Eh . . Eh . . Qh . 312 327 A D H X S+ 0 0 0 34 . . . . Ge . . . . . Dh . . . . . Ge . Eh . . . Yh . . Sh . . Eh . 313 328 A I H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . Rh . . . . . Re . Yh . . . . . . Gh . . Gh . 314 329 A A H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . Ah . . . . . . . Ah . . . . . . Mh . . Ih . 315 330 A G H X S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . Gh . . . . . . . Rh . . . . . . Rh . . Rh . 316 331 A A H X S+ 0 0 0 26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 317 332 A L H X S+ 0 0 0 28 . . . . Re . . . . Qh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318 333 A Q H X S+ 0 0 0 41 . . . . D . . . . Nh . . . . . . D . . . . . . . . . . . . . 319 334 A R H < S+ 0 0 0 47 . . . . Hs . . . . Ah . . . . . . Hs . . . . . . . . . . . . . 320 335 A L H < S+ 0 0 0 56 . . Ss . L . . . . Gh . . . . . . L . . . . . . . . . . Ds . . 321 336 A T H < S+ 0 0 0 70 . . R . Ds . . Es . . . . . . . . Ds . . . . . . . . . . Gt . . 322 337 A G < - 0 0 0 64 . . Nt . . . . Rt . . . . . . Ee V . . . . . . . . . . . Gt . . 323 338 A E + 0 0 0 66 . . St Ge . . . Ft . Th . . . . Ke L . . . . . . . . . . . Yg . . 324 339 A G S > S+ 0 0 0 57 . Ns . Ne . . . Lh . Eh . . . . He K Se . . . . . . . . . . Sg . . 325 340 A R T 3 S- 0 0 0 54 . Pt . G . . . Ph . Vh . . . . R R Le . . . . . . . . . . Lg . . 326 341 A G T 3 0 0 0 56 . Ft . Gs Ss . . Lh . Vh . . . . Dt . He . . . . . . . . . . T . . 327 342 A A < 0 0 0 50 . N . Sh Ve . . Lh . . . . . . Ft . He . . . . . . . . . . . . . 328 344 A G 0 0 0 66 . . T Fh Ae . . . . . . . . Et Ih . Gs . . . . . . . . . . . . . 329 345 A S 0 0 0 78 L . H Gh S . . . . . . . . Tt Hh . Gt . . . . . . . . . . . . . 330 347 A F 0 0 0 81 Re . E Hh Pt . . . . . . . . E . . Gt . . . . . . . . . . . . . 331 348 A K E -EF 228 285A 0 79 Fe . Me . Nt . . . . . . . . Ve . . Vt . . . . . . . . . . . . . 332 349 A V E +EF 227 284A 0 80 Ae . Ye . Rt . . . . . . . . Le . . . . . . . . . . . . . . . . 333 350 A I E -E 226 0A 0 84 T . We . . . . . . . . . . Fe . . . . . . . . . . . . . . . . 334 351 A G E -EF 225 281A 0 83 . . Ve . . . . . . . . . . Ve . . . . . . . . . . . . . . . . 335 352 A V E +EF 224 280A 0 84 L . St . . . . . . . . . . Fe . . . . . . . . . . . . . . . . 336 353 A S E -EF 223 279A 0 82 Ab . . . . . . . . . . . . Ie . . . . . . . . . . . . . . . . 337 354 A D > - 0 0 0 79 R . . . . . . . . . . . . Ye . . . . . . . . . . . . . . . . 338 355 A P T 3 S+ 0 0 0 67 T . . . . . . . . . . . . D . . . . . . . . . . . . . . . . 339 356 A K T 3 S+ 0 0 0 60 A . . K . . . . . Kt . . . R Gt . . . . . . . . . . . . . . . 340 357 A I < - 0 0 0 39 . . . F . . . . . Nt . . . K K . . . . . S . . . . . . . . . 341 358 A E + 0 0 0 41 . . . D . . . . . Ge . . . . L . . . . . Ph Et . . . . . . . . 342 359 A T - 0 0 0 42 . . . K . . . . . Ve . . . . P . . . . . Ah Vs . . . . . . . . 343 360 A L >>> - 0 0 0 36 . . . Gs . . . . . . . . . . . . . . . . Th S . . Vh . . . . . 344 361 A V T 345S+ 0 0 0 54 . Fe . F . . . . . . . . . . . . . . . . Vh Eh . . Sh . . . . . 345 362 A A T 345S+ 0 0 0 61 . Ve . P . . . . . . . . . . . . . . . Ge Dh Th . . Mt . Gt . . . 346 363 A L T <45S- 0 0 0 65 . Ve A T . . . . . . . . . . Ih . . . . Ve . Dh . . Lt . Pt . . . 347 364 A S T <5S+ 0 0 0 55 . Ne S . . . . . . . . . . . Ih . . . . Ke . Rh . . Lb . Lt . . . 348 365 A D < 0 0 0 37 . . G . . . . . . . . . . . Eh . . . . I . . . . . . Nt . . . 349 366 A D 0 0 0 23 . . N . . . . . . . . . . . Rh . . . . . . . . . . . Ne . . .
- ALIGNMENTS 91 - 120
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 3 A D - 0 0 0 19 . . . . . . . . . Se . . . . . . . . . . K . . . . . . . . . 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . Ie . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 . . . . . . . . . Ee Rh . . . . . . . . . Hs . . . . . . . . . 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 . . . . . . . . . Ee Fh . . . . . . . . . Ts . . . . . . . . . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 . . . . . . . . . . Lh . . . . . Fh . . . Nh . . . . . . . . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . Kt . . . . . Rh . . Kh Hh . . . . . . . . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . Ch Gh . . . . . . . . . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . . . Ve . . Fh Rh . . . . . . . . . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . . . Te . . Yh Nh . . . . . . . . . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Qh Ah . . . . . . . . . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Rh Eh . . . . . . . . . 13 14 A L H X S+ 0 0 0 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mh Yh . . . . . . . . . 14 15 A I H X S+ 0 0 0 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fh Yh . . . . . . . . . 15 16 A K H < S+ 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh Ah . . . . . . . . . 16 17 A A H < S+ 0 0 0 25 . N . . . . . . . . . . . . . . . . . Ah Wh . . . . . . . . . 17 18 A A H < S- 0 0 0 25 . Le . . . . . . . . . . . . . . . . . H Vh . . . . . . . . . 18 19 A G < 0 0 0 24 . Ke . . . . . . . . . . . . . . . . . Pg Qh . . . . . . . . . 19 20 A P 0 0 0 20 . Le . . . . . . . . . . . . . . . . . Eg . . . . . . . . . . 20 22 A P >> 0 0 0 22 . Ge . . . . . . . . . . . . . . . . . Vt Ve . . . . . . . . . 21 23 A V T 34 + 0 0 0 23 . Fe . . . . . . . . . . . . . . . . . Fs Ge . . . . . . . . . 22 24 A W T 34 S+ 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N Fs . . . . . . . . . 23 25 A R T <4 0 0 0 22 . Ke . . . . . . . . . . . . . . . . . M N . . . . . . . . . 24 26 A Y < 0 0 0 19 . Ie . . . . . . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . . . . 25 28 A E > 0 0 0 13 . Ae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 29 A L H > + 0 0 0 17 . V . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 30 A C H 4 S+ 0 0 0 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28 31 A L H 4 S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 32 A G H < + 0 0 0 20 . P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 33 A H X - 0 0 0 18 . Ds . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nh . . 31 34 A P T 4 S+ 0 0 0 11 . Gh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Vh . . 32 35 A E T 4 S+ 0 0 0 13 . Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Vh . . 33 36 A H T 4 S+ 0 0 0 16 . Kh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Yh . . 34 37 A G X - 0 0 0 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nh . . 35 38 A Y T 4 S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ne . . . . . . . . F . . 36 39 A Y T 4 S+ 0 0 0 36 H Ps . . . . . . . . . . . . . . . . W . . . . . . . . D . . 37 40 A V T 4 S+ 0 0 0 37 Yh D . . . . . . . . . . . . . . . . Ts . . . . . . . . G . . 38 41 A T < 0 0 0 39 Gh Pg . . . . . . . . . . . . . . . . Ds . . . . . . . . R . . 39 42 A R 0 0 0 42 Ih Kg . . . . . . . . . . . . . . . . As . . . . . . . . . . . 40 51 A F 0 0 0 44 Th . . . . . . . . I St . . . . . . . . Ie . . . . . . . I . . 41 52 A T + 0 0 0 57 Vh . . . . . . . . C At . . . . . . . Re Te . . . . . . . Rs . . 42 53 A T S >> S- 0 0 0 65 Rh Le . . . . . . . Rh Vb . . . . . . . Ae Se . . . . . . . P Ye . 43 54 A S H 3> S+ 0 0 0 64 Th A . . . . . . Kt Sh Lt . . . . . . . Ye Fe . . . . . . . Hb Te . 44 55 A P H 34 S+ 0 0 0 50 Lh Ah . . . . . . Gt . E . . . . . . . Se . . . . . . . . . I . 45 56 A E H <4 S+ 0 0 0 61 . Th . . . . Rt . Qs . Ds . . . . . Lt . Y . . . . Ts . . . . R S 46 57 A I H < S- 0 0 0 60 . . . . . . It . Ps Ct I . . . . . Lt . . . . . . Gs . . . . Qe Vt 47 58 A S < 0 0 0 80 . . . . . . L . . Gh G . . . Ps . Vt . . S . . . Ss . . . . Qe Dt 48 59 A Q 0 0 0 82 . Kh . . . . E . . Fh . . . . Gs . Sh . . Ds . . . Gs . . . . . Qt 49 61 A F > 0 0 0 110 Ah Ih . . . . Ah . Ds Sh Dh . . Vh Gh . Th . . M . . . Kh Gh . Gh E . L 50 62 A G H > + 0 0 0 106 Ih Gh . . . . Gh . Hg Gh Qh . . Vh Ah . Ah . . P . . . Th Sh . Ah Lh . E 51 63 A E H > S+ 0 0 0 112 Ih Eh . . . . Ih . Sg Yh Qh Lh . Ph Ih . Yh . . . . . . Ah Vh . Ah Kh . Lh 52 64 A L H > S+ 0 0 0 121 Qh Rh . . . . Sh . Mg Gh Gh Fh . Ah Sh . Ih . F . . . . Sh Ah . Ah Lh . Ah 53 65 A L H X S+ 0 0 0 126 Nt Qh . . . . Vh . Ah Sh Th Sh . Vh Nh . Sh . F . . . . Fh Vh . Vh Fh . Gh 54 66 A G H X S+ 0 0 0 125 Kh Gh . . . . Vh . Ih Ah Ah Ih . Fh Mh . Lh . Vs . . . . Ah Eh . Ah Rh . Lh 55 67 A L H X S+ 0 0 0 137 Dh Qh . . . . Lh . Gh Kt Vh Qh . Nh Yh . Eh . Lg . . . . Ih Vh L Nh Nh . Sh 56 68 A W H X S+ 0 0 0 141 Lh Eh . . . . A . Sh Vt Vh Fh . Ah Sh . Lh . . F . . . Ph Ah N Sh Lt L Ch 57 69 A S H X S+ 0 0 0 140 Fh Lh . . . . . . Ih At Vh Lh . Vh Ih . Gt . . Hs . . . Lh Mh F Ih Nt I Ah 58 70 A A H X S+ 0 0 0 140 Kt Yh . . . . E . Sh K Sh Yh . Rh Mh . G . Dg I . . . Ih Kh St Lh . N Th 59 71 A S H X S+ 0 0 0 122 . Kh . . . . Et . Gh . Ah Nh . Eh Ah . . . Eg D . . . Eh Mh . At . Fs Ah 60 72 A V H X S+ 0 0 0 102 . Eh . . . . Et . Hh . Ah Gh . Fh Ah . . . Vs . . . . Lh Ah . Ft . . Ih 61 73 A W H <>S+ 0 0 0 98 . Mh . . . . Lt . Ah . Fh Ih . T Rh . . . P . . Lh . Vs Lh . I . . Ah 62 74 A K H ><5S+ 0 0 0 71 . Qh . . . . Gs . Rh . Lh Ih . . Yh . . . . . . Fh . N Qh . . . . Kh 63 75 A A H 3<5S+ 0 0 0 42 . Kh . . . . . . . . Nh Eh . . Kh . . . . . . Dh V . Yh . . . . Ah 64 76 A A T 3<5S- 0 0 0 38 . Rh . . . . . . . . Ah . . . Yh . . . . . . Kh R . Wh . . . . Ys 65 77 A D T < 5 - 0 0 0 46 . Gt . . . . N . . . Lh Fh . . F . . . . . . Kh L . Dh . . . . P 66 78 A E < - 0 0 0 69 . W . . . . L . Vh . . D . . Pt . . . H A K Dh D Es . . . . Es Pt 67 79 A P - 0 0 0 79 . D . . . . St M H . . E . K . . . . C K Et Gs Kt Ns E . E . As . 68 80 A Q S S+ 0 0 0 117 . Vg . . I . Dt T Pt . V P . Pt P S . . Es Ts Qt P Nt Ns A . Qt . Ds Ps 69 81 A T S S- 0 0 0 161 . Eg . Gt K . Y N Dt Gt Ke . S Gt K K Gt . Te P Q . Ds Gs R Gt Gt . We P 70 82 A L E -a 98 0A 0 220 K Se Q L Te Q Re Ie L S Ve Ge K D Le Ye K L Le Ie Ne Lb Ae I D L D . Fe Te 71 83 A R E -ab 99 137A 0 225 Ie Ae Te Ve Le Ne Fe Re Ce Te Ve Ve Ve Ge Ve Ie Ke Re We Ve Le K Ae E Re Re He . Le Ve 72 84 A L E -ab 100 138A 0 225 Ve Ve Ie Ae Ve Ve Le Ve Ve Ce Ve Fe Ae Ve Le . 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Ns . . . . . . 311 326 A E H X S+ 0 0 0 27 . . Lh . Kh . . T . . . . Eh . . . . . . . . . . Ce . . . . . . 312 327 A D H X S+ 0 0 0 34 . . Kt . Nh . . G . . . . Mh . . . . . . . . . . Ve . . . . . . 313 328 A I H X S+ 0 0 0 27 . . Lt . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314 329 A A H X S+ 0 0 0 28 . . L . . . . . . . . . . Nt . . . . . . . Lg . Rh . . . . . . 315 330 A G H X S+ 0 0 0 29 . . . . . . . M . . . . . I . . . . . . . Lg . Is . . . . . . 316 331 A A H X S+ 0 0 0 26 . . . . . . Gs P . . . . . Ag . . . . . . . Es . Gt . . . Ve . . 317 332 A L H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . H He . . . . . Gg . . . . . . . St . Rt . . . Ve . . 318 333 A Q H X S+ 0 0 0 41 . Ee . . . . P Ge . . . . . Mg L . . . . . . Gt . . Ts . . Ve . . 319 334 A R H < S+ 0 0 0 47 . Ve . . . . Vh . . . . . . G Ls . . . . . . Fh . . Ms . Kt Es . . 320 335 A L H < S+ 0 0 0 56 . T . . . . . . . . . . . M Q . . . . . . Ah . . T . Yt . . . 321 336 A T H < S+ 0 0 0 70 . D . Gt . . . . . . . . . Se C . . . . . . Dh . . L Ds Lt . . . 322 337 A G < - 0 0 0 64 . . . At . Fh Ih Ge . . . . . . . . . . . . . Ih . . . At Vt Ke . . 323 338 A E + 0 0 0 66 . . . I . Gh Nt He . . . . . . . . . . . . . Sh . Ih . Gt Hs Ve . . 324 339 A G S > S+ 0 0 0 57 . . . R . Vh St Ve . . . . . . . . . Rh . . . Fh . Eh . Yg Ss Gt . . 325 340 A R T 3 S- 0 0 0 54 . . . . . Vh I Ie . . . . . . . . . Yh . . . Ls . Rh . Lg Ds Dt . . 326 341 A G T 3 0 0 0 56 . . . . . St N . . . . . . . . . . Eh . . . As . Ah . Ag A Se . . 327 342 A A < 0 0 0 50 . . . . . Hh . . . . . . . . . . . Eh . . . . . Xh . . . De . . 328 344 A G 0 0 0 66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . V . Kb 329 345 A S 0 0 0 78 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . E . Kg 330 347 A F 0 0 0 81 De . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . F . Sg 331 348 A K E -EF 228 285A 0 79 Ie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . We . Ag 332 349 A V E +EF 227 284A 0 80 Ve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fe . . 333 350 A I E -E 226 0A 0 84 F . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ae . . 334 351 A G E -EF 225 281A 0 83 P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ve . . 335 352 A V E +EF 224 280A 0 84 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Re . . 336 353 A S E -EF 223 279A 0 82 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wh . . . . . . Ke . . 337 354 A D > - 0 0 0 79 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ah . . . . . . Dt . . 338 355 A P T 3 S+ 0 0 0 67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . . . . . Gt . . 339 356 A K T 3 S+ 0 0 0 60 . . . . . . . Qt . . Eb . . . . . . . . . Nh . . . . . Rt . . . 340 357 A I < - 0 0 0 39 . . . . . . . Gt . . Pt . . . . . . . . . . . . . . . Ct . . Gs 341 358 A E + 0 0 0 41 . . . . . . . Q . . Et . . . . . . . . . . . . . . . Wh . . Rs 342 359 A T - 0 0 0 42 . . . . . . . S . . Rb . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . Ye 343 360 A L >>> - 0 0 0 36 A . . . . . . . . . Is . . . . . . . . . . . . . . . Qh . . He 344 361 A V T 345S+ 0 0 0 54 P . . . Nt . . . . . Is . . . Le . . . . . . . . . . . Lh . . Ye 345 362 A A T 345S+ 0 0 0 61 Kt Ie . . Fs . . Vg . . P . . I Ve . . . . . . . . . Le . Rh . . Le 346 363 A L T <45S- 0 0 0 65 Gt Te . . Ab . . Lg . . E . . K Ks . . . . . . . . . Te . . . . Ye 347 364 A S T <5S+ 0 0 0 55 . Rt . . D . . Eg . . . . . N Es . . . . . . . . . Te . . . . Re 348 365 A D < 0 0 0 37 . Dt . . . . . Vs . . . . . Ph Kt . . . . . . . . . Rh . . . . L 349 366 A D 0 0 0 23 . Nt . . . . . A . . . . . Dh Gt . . . . . . . . . . . . . . Q
- ALIGNMENTS 121 - 150
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 . . . . . Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 3 A D - 0 0 0 19 . . . . . Dh . St . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 . . . . . Lh . Mt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Qs . . 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 . . . . . Ih . Tt . . . . . . . Lh . . . . . . . . . . . H . . 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 . . . . . Sh . Gt . . . . . . . Dh . . . . . . . . . . . Gs . . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 . . . . . Qh . Ae . . . . . . . Eh . . . . . . . . . . . E . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 . . . . . Ch . . . . . . . . . Yh . . . . . . . . . . . Ph . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 . . . . . Vh . . . . . . . . . Dh . . . . . . . . . . . Kh . . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 . . . . . Dh . . . . . . . . . Gh . . . . . . . . . . . Dh . . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 . . . . . Eh . . . . . . . . . Yh . . . . . . . . . . . Vh . . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 . . . . . Sh . . . . . . . . . Lh . . . . . . . . . . . L . . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 . . . . . Lh . . . . . . . . . Rh . . . . . . . . . . Le Fe . . 13 14 A L H X S+ 0 0 0 17 . . . . . Kh . . . . . . . . . Vh . . . . . . . . . . Ee . . . 14 15 A I H X S+ 0 0 0 13 . . . . . . . . . . . . . . . Nh . . . . . . . . . . Q . . . 15 16 A K H < S+ 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . Ts . . Ah . . . . . . . . . . Q . . . 16 17 A A H < S+ 0 0 0 25 . . . . . . . . . . . . Ht . . Lh . . . . . . . . . . . . . . 17 18 A A H < S- 0 0 0 25 . . . . . . . . . . . . Qt . . Lh . . . . . . . . . . . . . . 18 19 A G < 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . . C . . Ah . . . . . . . . . . . . . . 19 20 A P 0 0 0 20 . . . . . Ah . . . . . . L . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 22 A P >> 0 0 0 22 . . . . . Eh . Lh . . . . . . . Ie . . . . . . . . . . Gt . . . 21 23 A V T 34 + 0 0 0 23 . . . . . N . Ah . . . . . . . He . . . . . . . . . . K . . . 22 24 A W T 34 S+ 0 0 0 24 . . . . . I . Dh . . . . . . . Ds . . . . . . . . . . Gs . . . 23 25 A R T <4 0 0 0 22 . . . . . . . Ah . . . . . . . Yg . . . . . . . . . . Ks . . . 24 26 A Y < 0 0 0 19 . . . . . . . Lh . . . . . . . Hg . . . . . . . . . . . . . . 25 28 A E > 0 0 0 13 . . . . . Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 29 A L H > + 0 0 0 17 . . . . . Ih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 30 A C H 4 S+ 0 0 0 20 . . . . . Hh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28 31 A L H 4 S+ 0 0 0 21 . . . . . Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 32 A G H < + 0 0 0 20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 33 A H X - 0 0 0 18 . . . . . Vh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31 34 A P T 4 S+ 0 0 0 11 . . . . . Yh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32 35 A E T 4 S+ 0 0 0 13 . . . . . Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33 36 A H T 4 S+ 0 0 0 16 . . . . . Ih . Ps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34 37 A G X - 0 0 0 18 . . . . . . . As . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 38 A Y T 4 S+ 0 0 0 28 . . . . . . . P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 39 A Y T 4 S+ 0 0 0 36 . . . . . Es . Rt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 40 A V T 4 S+ 0 0 0 37 . . . . . D . Ht . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 41 A T < 0 0 0 39 . . . . . Pt . St . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39 42 A R 0 0 0 42 . . . G . Yt . Is . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40 51 A F 0 0 0 44 . . . R . Ah . G . . . . . . . . . . . H . . . . . . . . . . 41 52 A T + 0 0 0 57 . . Tt F . . . Pb . . . . . . . . . . . P . Tt . . . . . . . . 42 53 A T S >> S- 0 0 0 65 . . Gt S . . . D . . . . . . . . . . . Gh . Gt . . . . . . . . 43 54 A S H 3> S+ 0 0 0 64 . . Ls L . Vh . Vt . . . . . . . . . . . Ah . Es . . . . . . . . 44 55 A P H 34 S+ 0 0 0 50 . . G Et . Gg . . . . . . . . . . . . . Ph . G . . . . . . . . 45 56 A E H <4 S+ 0 0 0 61 . . . . . Ng . . . . . . . . . . Gs . . Lh . . . . . . Ih . . . 46 57 A I H < S- 0 0 0 60 . . . . . Ng . . . . . . Ah . . . Gt . . . . . Fs . . . Gh Vt . . 47 58 A S < 0 0 0 80 . . . . . F . . . . . . Eh . . . At . . . . . Cb . . . Th Nh . . 48 59 A Q 0 0 0 82 . . . . . . . . . . . . Fh . . . G . . . . . It . . . Ah Ph . . 49 61 A F > 0 0 0 110 . . Kh At . . . Ah . . Th . Lh . . . Kh . . Mh . Kh Vt . . . Th Lh . . 50 62 A G H > + 0 0 0 106 . . Th Lh . . . Fh . . Sh . . . . . Sh . . Ah . Th . . . . Ah Ah . . 51 63 A E H > S+ 0 0 0 112 . . Lh Ih . . . Th . . Sh Dh Hh . . . Mh . . Ph . Lh . . . . Mh Yh . . 52 64 A L H > S+ 0 0 0 121 . . Ih Ph . . . Th . . Ah Fh Qh . . . Lh . . Ah . Th . . . . Lh Lh . . 53 65 A L H X S+ 0 0 0 126 . . Ah Mh . . . Ah . . Ih Vh Vh . . . Ah . . Ah . Sh A . . . Ch Mh . . 54 66 A G H X S+ 0 0 0 125 . . Mh Lh . . . Vh . . Lh Vh Ih . . . Lh . . Hh . Th Yt . . . Vh Lh . . 55 67 A L H X S+ 0 0 0 137 . . Mh Kh . Eh . Gh . . Ah Eh Dh . . . Qh . . Vh . Lh Et . . . Mh Th . . 56 68 A W H X S+ 0 0 0 141 . . Ih Eh . Rh . Vh . . Th Kh S . . . Lh . . Lh . Ph Dh . . . Ah Hs . . 57 69 A S H X S+ 0 0 0 140 . . Ah Mh . Ih . Fh . . Ih Ih N . . . Ah . . Wh . Vh Ah . . . Lh . . . 58 70 A A H X S+ 0 0 0 140 . . Eh Ih . Kh . Eh . . Lh Rh T . . . Ah . . Sh . Yh Qh . . . Eh . . . 59 71 A S H X S+ 0 0 0 122 . . Yh Rh . Eh . Ah . . Ah Th V . . . Qh . . Qh . Lh Lh . . . Dh Ys . . 60 72 A V H X S+ 0 0 0 102 . . Rh Hh . Lh . Mh . . Lh Kh . . . . Ih . . . . Nh . . . . At Vs . . 61 73 A W H <>S+ 0 0 0 98 . . Lh Ah . St . Kh . . K Mh . . . . Ah . . . . Ah . . . . Gt K . . 62 74 A K H ><5S+ 0 0 0 71 . . Th . . . . Ah . . . Eh . . . . Gt . . . . . . . . . . L . . 63 75 A A H 3<5S+ 0 0 0 42 . . Kh . . . Ls Th . . . Kh . . . . L . . . . . . . . . . . . . 64 76 A A T 3<5S- 0 0 0 38 . . Ys . . . M Vh . . . Lh . . . . P . . . . . . . . . . . . . 65 77 A D T < 5 - 0 0 0 46 . . . St . . P G . . . Eh . . . Eh T . . . . . . . . . . . . . 66 78 A E < - 0 0 0 69 . . . Gt . . H S . . . Eh E . . Lt G . . . . Lt . . . E . T . . 67 79 A P - 0 0 0 79 . . . T . . Yt Ls . . . K Pt . . Kt . . . . . Tt . . . T . Pt . . 68 80 A Q S S+ 0 0 0 117 . . . R . . Gs Dt . . . Ds Gt . . Nt . K . Nt R Gt . . . P Qg Gt . . 69 81 A T S S- 0 0 0 161 . . G Ee T Gs K L N . . K E . . Vs P I St R A Kt . . V Re Dg Kt . . 70 82 A L E -a 98 0A 0 220 M K Gs Ve Gs Ke Te Te Q . Ks Ie G M M Qe Ve Re A D Fe G Ds . Ke Le G D S E 71 83 A R E -ab 99 137A 0 225 Le Re K Ve Te Ve Ae Ve R . Ke Fe Te Ve Ne Ne Ie Fe He Re De Ve Ve Ne Se Le Ee We Re K 72 84 A L E -ab 100 138A 0 225 Ve Ie Ve Le Ve Ve Fe Le Ve . Ve Ve Ie Le Ie Ie Ye Ae Ve Fe Le He Ie Ie Fe Fe Ie Fe Ve Ve 73 85 A I E -ab 101 139A 0 225 Ge Le Le Ge Le Ye Le Ve Ae . Ie Ve Ve Te Le Fe Le Ae Ce Ve Ye Ve We Ie L Ve Ve Ie Le Ae 74 86 A E E -ab 102 140A 0 224 Le Ie Me M Ve Le Ce Qe Ie . He Le Se Ve Le Se Pe Ie Le Le Fe Ve Se Le L He Ve Qe Ie Fe 75 87 A I E S+a 103 0A 0 215 Ie Te Le A Te T Ve G Le . Ye A D Te Fe Ve . G Ie Ss Ve Te Ie Ke Gb . Ts Ns Ve Ie 76 88 A G - 0 0 0 214 G Gt A Hs Gt D D . L . L G Is Ns G E As L Ns Ns Le Vs Gs Ie Qs . 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Sg . . Ah . . . . Qh Ns . . . Ls . . W . . L . 347 364 A S T <5S+ 0 0 0 55 . . . . . . . Rh . Dg . . Lh . . . . Sh . . . . Y . . Eb . . M . 348 365 A D < 0 0 0 37 . . . . . . . Th . . . . Rh . . . . Hh . . . . Tt . . Ts . . R . 349 366 A D 0 0 0 23 . . . . . . . Lh . . . . . . . . . . . . . . Et . . . . . N .
- ALIGNMENTS 151 - 180
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 . . . . . . . . M D . . . . . . . . . . . . . Sh . . . . . . 2 3 A D - 0 0 0 19 G . . . . . . . R Pt . . . . . . . . . . . . . Rh . . . . . . 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 S . . . . . . . Ve Rt . . . . . . . K . . . . . Lh . . . . . . 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 Ah . . . . . . . Ye K . . . . . . . Ts . . . . . Xh . . . . . . 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 Vh . . . . . . . . . . . . . . . . Hh . . . . . Hh . . . . . . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 Dh . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . . . . Fh . . . . . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 Vh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ah . . . . . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 Qh . . . . Qh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 Hh . . . . Ah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 Eh . . . . Ih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 Lh . . . . Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 Ah . . . . Th . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 14 A L H X S+ 0 0 0 17 Gh . . . . Yh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 15 A I H X S+ 0 0 0 13 Lh . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 16 A K H < S+ 0 0 0 22 Vh . . . . Pt . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T 16 17 A A H < S+ 0 0 0 25 Dh . . . . Dt . . . . . . . . L . . . . . . A . . . . . . . L 17 18 A A H < S- 0 0 0 25 Qt . . . . Hs . . . . . Gt . . Ns . . . . . . P . . . . . . . Ns 18 19 A G < 0 0 0 24 Gt . . . . . . . . . . Y . . P . . . . . . L . . . . . . . P 19 20 A P 0 0 0 20 A . . . . . . . . . . Ne . . G . . . . . . R . . . . . . . G 20 22 A P >> 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . Le . . . . . . . . . H . . . . . . . . 21 23 A V T 34 + 0 0 0 23 . . . . . . . . . . . Ve . . . . . . . . . V . . . . . . . . 22 24 A W T 34 S+ 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . Ve . . . . . . . . . P . . . . . . . . 23 25 A R T <4 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . E . . . . . . . . 24 26 A Y < 0 0 0 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 28 A E > 0 0 0 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 29 A L H > + 0 0 0 17 . . . . . . . . . . . Le . . . . . . Se . . . . . . . . . . . 27 30 A C H 4 S+ 0 0 0 20 . . . . . . . . . . . De . . . . . . Ne . . . . . . . . . . . 28 31 A L H 4 S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . S . . . . . . S . . . . . . . . . . . 29 32 A G H < + 0 0 0 20 . . . . . . . . . . . Qt . . . . . . Dt . . . . Kt . . . . . . 30 33 A H X - 0 0 0 18 . . . . . Lg . . . . . . . . . . . . . . . . . Kt . . . . . . 31 34 A P T 4 S+ 0 0 0 11 . . . . . Kg . . . . . . . . . . . . . . . . . K . . . . . . 32 35 A E T 4 S+ 0 0 0 13 . . . . . Y . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . 33 36 A H T 4 S+ 0 0 0 16 . . . . . Kb . . . . . . . . . . . Hh . . . . . . . . . . . . 34 37 A G X - 0 0 0 18 . . . . . . . . . . . . . . . . . Ah . . . . . Le Dt . . . . . 35 38 A Y T 4 S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . . . . Ih . . . . . Se Dt . . . . . 36 39 A Y T 4 S+ 0 0 0 36 . . . . . . . . . . . Nt . . . . . Kh Qt . . . . Se As . . . . . 37 40 A V T 4 S+ 0 0 0 37 . . . . . . . . . . . N . . . . . E N . . . . Ne Ps . . . . . 38 41 A T < 0 0 0 39 . . . . . . . . . . . Ph . . . . . I Qh . . . . . Gs . . . . . 39 42 A R 0 0 0 42 . . . . . . . . . L . Ah . . . . . V Dh . . . . . E . . . . . 40 51 A F 0 0 0 44 . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . Y . Re . . . . . . 41 52 A T + 0 0 0 57 . . . . . . . . . Vs . . . . . . . . Le . . X Gs I Le . . . . . 42 53 A T S >> S- 0 0 0 65 . . . . . . . . . G . . . . . . . . Ae . . Q Sh P Ye . . . . . 43 54 A S H 3> S+ 0 0 0 64 S . . . . . . . . . . . . . . . . . As . . S Sh S Se . . . . . 44 55 A P H 34 S+ 0 0 0 50 Rs . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . Eh K I . . . . . 45 56 A E H <4 S+ 0 0 0 61 D Tt . . . . . . . . . . . . . . . Ih I . Nt . . . . . . . . . 46 57 A I H < S- 0 0 0 60 H Gt Gt . . . Ys . . . . . . . . . . Eh E . Ct . . . Se . . . . . 47 58 A S < 0 0 0 80 . Ss Ss . . . Cb . . . . . . . . . . Vh . . Ts Lt . . Ve . . . . . 48 59 A Q 0 0 0 82 . G G . . . St . . . . . . . . . . Nh . . G Gt . . Se . . . . . 49 61 A F > 0 0 0 110 Ts Kh Kh . . . Vt . . . . D . . . . . Ih D . . Et . . Le . . . . . 50 62 A G H > + 0 0 0 106 Ph Th Th . . . . . . Th . Nh . . . . . Gh Yh . . Eh . . . . . Th . . 51 63 A E H > S+ 0 0 0 112 Dh Ah Hh . . . . Lh . Gh . Vh . . . . . Kh Eh . . . Mh . . . . Ah . . 52 64 A L H > S+ 0 0 0 121 Ah Ah Vh . . . . Dh Sh Ah . Lh . . Ve . . Nh Qh . . Ah Lh Yh . . . Eh . . 53 65 A L H X S+ 0 0 0 126 Lh Fh Ah . . . H Th Ih Lh . Gh . . S . . Gh Ah . E Ih Gh Ih . . . Lh . S 54 66 A G H X S+ 0 0 0 125 Eh Lh Mh . . . Wt Lh Nh Rh . Gh . . Vh . . Ah Ah . Sg Gh Gh Kh . . . Ih . Vh 55 67 A L H X S+ 0 0 0 137 Kh Lh Ah . . . Vg Ah Wh Ih . Kh . . Ah . . Qt Fh . Ag Sh Mh Sh . . A Rh . Ah 56 68 A W H X S+ 0 0 0 141 Ah Ph Ah . . . Dg Kt Ih Gh . Ih . . Qh . . Lt Dh . Dg Gh Ah Ih L . D Rh . Qh 57 69 A S H X S+ 0 0 0 140 Lh Ih Ih . . . Ig Ls Lh Ah . Ah . . Ih . . Is Ah . Wg Qh Mh Xg M . Y Lh . Ih 58 70 A A H X S+ 0 0 0 140 Qh Lh Nh . . . Kg P Kh Eh . Gh . . Eh . . K Vh . Yg Ah Kh Eg Pb . Qt Hh . Eh 59 71 A S H X S+ 0 0 0 122 Ah Sh Eh . . . Ng . Th Fh . Dh . . Nh Sb . . Qh . Ng Lh Wh Fg Ks . . Rh . Nh 60 72 A V H X S+ 0 0 0 102 Ah Qh Lh . . . . . Vh Lh . Yh . . Sh V . . Sh . . Ah Rh Is . . . Lh . Sh 61 73 A W H <>S+ 0 0 0 98 Rh Ih S . . . . . Ah Ah . Ih . . Lt P . . Lh . . Ls Wh . . . . Eh . Lt 62 74 A K H ><5S+ 0 0 0 71 Lh Dh . . . . . . Eh Wh . Ah . . Tt At . . Ih . . N Rh . . . . Yh . Tt 63 75 A A H 3<5S+ 0 0 0 42 Ht . . . . . . . Tt Ys . Kh . . . . . . Dt . . . Kh . . . . . . . 64 76 A A T 3<5S- 0 0 0 38 C . . . . . . . Ft Ns . Kh . . . . . . St . . . Rh . . . . . . . 65 77 A D T < 5 - 0 0 0 46 As . . . . . . . . Gs . Ah . . . . . . Gt . . . 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K . . . . . T Te . . . . . . Th K 262 276 A A - 0 0 0 71 . . . . . . . . Is . . . Sh . Ps . . . . Nh V Fe . . . . . Es Sh Ps 263 277 A H - 0 0 0 83 . . . . . . . . P Eh . . Rh . L A . . . Sh G Qg . . . . . Pb Ah L 264 278 A V E -k 230 0D 0 100 . . . Is . . . Pt F Kh . . . . P G . . . Kh S . . . . . . F Rh P 265 279 A D E > -k 231 0D 0 151 . Eh Rg Eh . . . Vh S Dh . . . . Q L . . . Gh . . . Eh . Fh . Gt Ah Q 266 280 A F H > S+ 0 0 0 163 . Ih Hg Rh . . . Fh L At I T . . Ab T . . . Ah . . . Ah . Th . Ih Ch Ab 267 281 A D H > S+ 0 0 0 175 . Qh Eg Sh . Dg . Kh Et . D Ph Gh . Gt Dh Lh . . Eh . T I Fh . Eh . Ah Th Gt 268 282 A A H > S+ 0 0 0 178 . Mh Is Ih . Kg . Eh Kt Wh H Dh Qh . At Dh Rh . Rg Lh . Fs V Ih . Rh . Kh Lh At 269 283 A L H X S+ 0 0 0 187 . Lh Lh Lh . Q . Yh Lt Ah as Gh Vh . Ft Eh Dh . Lg Vh . At W Rh . Hh . Lh Ah Ft 270 284 A G H X S+ 0 0 0 190 . Ah Kh Hh . Ib . Yh E Ih G Eh Lg . Gs Kh Ah . Sg Th . Gh Ds Lh . Lh . Fh Nh Gs 271 285 A R H X S+ 0 0 0 169 . Rh Eh Dh . . . Qh . Rh Vs Kh Pg . . Th Eh . Tg Sh . . Ft Ah . Lh . Th Ah . 272 286 A A H X S+ 0 0 0 161 . Dh . Vh . . . Kh . Yh . Ah Kg . . Yh Rh . Ms Sh . Rh Rt Nh . Sh . Yh Lh . 273 287 A A H ><>S+ 0 0 0 154 . Fh . Vh . . . Qh . Fh . Vh . . . Ys Lh . Vs Yh . Gh Ls . . Lh . A Sh . 274 288 A E H ><5S+ 0 0 0 121 . . . Eh . . . Lh . Vh . Nh . . . . Vh . Rs Rh . Vh . Lh . Dh . . Kh . 275 289 A S H 3<5S+ 0 0 0 92 . . . Vh . . . Th . Sh . Dt . . . . . . . Nh . Gh . Ih Gt . . . Eh . 276 290 A I T <<5S- 0 0 0 100 Gt . . Ah . . . Fh . Et . . . . . . . . . Sh . Ct . Eh I Eh . . Lh . 277 291 A G T < 5S+ 0 0 0 105 Vs . . Gt . . . L . Gt . . . . . . Eh . . Fh . Gt . Gh D Lh . . Gg . 278 292 A A < - 0 0 0 120 I . . L . . . . . F . Gt . . . . Lh . Ps Fs . I Pt Fh Wh Gt . . Eg . 279 293 A R E -F 336 0A 0 137 A Ds . Te . . . . . E . Ks . . . . Ah . Q N . Ae Rt Lh Ih I . Ds Yg . 280 294 A A E -F 335 0A 0 138 Rs Es G Se . . . . . . . Ls Ls I . . Ah . L . . Se Ve I Eh . . 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Nt . . . . . . . . 291 305 A K H ><5S+ 0 0 0 63 . . . . . . . . . . G . G . . . Rg . . Kh . D . . . . . . . . 292 306 A R H 3<5S+ 0 0 0 54 . . . . . . . . . . Es . P . . . Rg . . Lh . Fh . . . . Ch . . . 293 307 A L T 3<5S- 0 0 0 37 . . . . . . . . . . . . . . . . Fg . . G . Vh . . . . Rt . . . 294 308 A G T <>5 + 0 0 0 48 . . . . . . T . . . . . . . . . A . . W . Ph . . . . Et . . . 295 309 A I H ><S+ 0 0 0 47 . . . . . . Lt . . . . . . . . . Ph . . H . Ih . . . . A . . . 296 310 A E H > S+ 0 0 0 47 . . . . . . Gt . . . . . Rh . . . Lh . . . . Ah . . . . Q . . . 297 311 A T H > S+ 0 0 0 44 . . . . . . Wb . . . . . Ah . . . Yh . . P . Rh . . . . As . . . 298 312 A R H X S+ 0 0 0 40 . . . . . . . . . . . . Vt . . . Mt . . R . Lh . . . . . . . . 299 313 A A H < S+ 0 0 0 39 . . . . . . . . . . . . Gs . . . Rt . . W . Kh . . . . . . . . 300 314 A L H < S+ 0 0 0 31 . . . . . . . . . . . . Pt . . . Ee . . N . Qh . . . . . . . . 301 315 A S H < 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . Kt . . . We . . . . Hh . . . . . . . . 302 316 A L < 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . Lh . . . . . . . . 303 318 A A 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ih . . . . . . . . 304 319 A K + 0 0 0 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Hs . . . . . . . . 305 320 A A S S- 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . W . . . . . . . . 306 321 A T > - 0 0 0 25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . S . . . . . . . . 307 322 A P H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . . . Kh . . . 308 323 A Q H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . . . Ah . . . 309 324 A V H > S+ 0 0 0 22 . . . . . . . . . . S . . . . . . . . . . Eh . . . . At . . . 310 325 A S H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . Dh V . . . . I . V Lh . Hh . . . . Gt . . . 311 326 A E H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . Th Q . . . . P . Ds Nh . Qh . . . . V . . . 312 327 A D H X S+ 0 0 0 34 . . . . . . . . . . Vh As . . . . Gt . S Th . . . . . . N . . . 313 328 A I H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . Kh Ke . . . . Wt . Ss Th . . . . . . . . . . 314 329 A A H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . Ah . . . . . Q . . Lh . . . . . . . . . . 315 330 A G H X S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . Kh . . . . . . . . Eh . . . . . . . Et . . 316 331 A A H X S+ 0 0 0 26 . . . . . . . . . L Yh . . . . . S . . Yh . . . . . . . Ft . . 317 332 A L H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . Yg . . . . . . Th . . . . . . . . . . Ye . . 318 333 A Q H X S+ 0 0 0 41 . . . . . . . . . Ng E Ye . . . . Lh . Ie . . . . Ht . . Ge Se . . 319 334 A R H < S+ 0 0 0 47 . . . . . . . . . Eg P Pe . . . . Eh . Ve . . . . Ht . Lt Ve Ae . . 320 335 A L H < S+ 0 0 0 56 . . . . . . . . . R V Ve . . . . Qh . Qe . . . . Ks . At Ge . . . 321 336 A T H < S+ 0 0 0 70 . . F . . . . . . Ve I D . . . . Rt . Le . . . . Q . C Ge . As . 322 337 A G < - 0 0 0 64 . . Ph . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . Ve Gt . 323 338 A E + 0 0 0 66 . . Dh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . L . . Ds . C Gt . 324 339 A G S > S+ 0 0 0 57 . . Sh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . Rg F . 325 340 A R T 3 S- 0 0 0 54 . . Lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . P . . . . Hg P . 326 341 A G T 3 0 0 0 56 . . At . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ls . . . . . M . 327 342 A A < 0 0 0 50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gs . . . Ve . . . 328 344 A G 0 0 0 66 . . . Ds . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . Le . . . 329 345 A S 0 0 0 78 . . . Ds . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G Ee . . . 330 347 A F 0 0 0 81 . . . C Lt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N L . . . 331 348 A K E -EF 228 285A 0 79 . . . R Ve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G Qh . . . 332 349 A V E +EF 227 284A 0 80 . . . Ye Ge Pt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ab Lh . . . 333 350 A I E -E 226 0A 0 84 . . . Ve Ye Dt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . E 334 351 A G E -EF 225 281A 0 83 . . . Me Me Wt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tt . . Ee 335 352 A V E +EF 224 280A 0 84 . . . Ie Re Fe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ve 336 353 A S E -EF 223 279A 0 82 . . . Fe Ie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ie 337 354 A D > - 0 0 0 79 . . . K Ie . . . . . . . . Rh . . . . . . . . . . Kh . . . . . 338 355 A P T 3 S+ 0 0 0 67 . . . Ks I . . Ye . . . . . Eh . . . . . . . . . . Rh . . . . . 339 356 A K T 3 S+ 0 0 0 60 . . . Et Ks . . Ee . . . . . Nh . . . . . . . . . . Qh . . . . . 340 357 A I < - 0 0 0 39 . . . Ft . . . Ie . . . . . Ch . . Qt . . . . . . . Lh . . . . . 341 358 A E + 0 0 0 41 . . . A Ns . . Ve Gt . . . . . . . T . . . . . . . Kh . . . . . 342 359 A T - 0 0 0 42 . . . P Ns . . Ee Vs . Gt . . . . . V . . . . . . . Kh . . . . . 343 360 A L >>> - 0 0 0 36 . . . S Te . . G P . V . . . . . P . . . . . . . At . . . . . 344 361 A V T 345S+ 0 0 0 54 . . . Dh Ye . Rs Ag I . Ge Le . . . . . . Re . . . . . Et . S . . . 345 362 A A T 345S+ 0 0 0 61 . . . . Se . Vs Ag . Te Te Ve . . . . Qt Ie Ie . . . We Fe . . S . . . 346 363 A L T <45S- 0 0 0 65 . . . . Ae . Lt Ng . Ve Ie V . . . . Tt R Ee . . . Rs Ye . . L . . . 347 364 A S T <5S+ 0 0 0 55 . . . . Te . Yt . . Ve . K . . . . As Ps F . . . Ds Ie . . Q . . . 348 365 A D < 0 0 0 37 . . . . Fe . Ng . . A . . . . . . Gg Ps . . . . Eg K . . . . . . 349 366 A D 0 0 0 23 . . . . . . Rg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
- ALIGNMENTS 181 - 210
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 3 A D - 0 0 0 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . Fe . . . . . . . P . . . . . . . . . 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 . . . . . . . . . . . . V . . . . . . . Yb . . . . . . . . . 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 . . . . . . . . . . E . E . . . . . . . S . . . . . . . . . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 . . . . . . . . . . G . Le . . . . . . . F . . . . . . . . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . Eh . Ke . . . . . . . . . . . . . . . Pg . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . Lh P Dt . . . S . . . . . . . . . . . Vg . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . Rh L Nt . . . P S . . . . . . . . . . Lg . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 . . . . . . . . . . Lh Th Re . . . S P . . . . . . . . . . Sg . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . Kh Qh . . . . 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Se . . . . . . Se R . . . . Ie . . . . . G T . As . Dh . . N 287 301 A G H > S+ 0 0 0 116 . . T . . . . . . At Vh . . . Ie Rg . . . . . Hs Gt . Q . Th . . Te 288 302 A A H > S+ 0 0 0 67 . . . . . . . . . Tt Eh . . . Gs Gg . . . . . Ds . . . . Fh . . . 289 303 A F H X S+ 0 0 0 70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nt . . . . . Th . . . 290 304 A L H <>S+ 0 0 0 67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ah . . . . . Ah . . . 291 305 A K H ><5S+ 0 0 0 63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Rh . . . . . Lh . . . 292 306 A R H 3<5S+ 0 0 0 54 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Hh . . . . . Ah . . . 293 307 A L T 3<5S- 0 0 0 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gt . . . 294 308 A G T <>5 + 0 0 0 48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lh . . . . . . . . . 295 309 A I H ><S+ 0 0 0 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ih . . . . . . . . . 296 310 A E H > S+ 0 0 0 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kh . . . . . . . . . 297 311 A T H > S+ 0 0 0 44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Qh . . . . . . . . . 298 312 A R H X S+ 0 0 0 40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Rt . . . . . . . . . 299 313 A A H < S+ 0 0 0 39 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gt . . . . . . . . . 300 314 A L H < S+ 0 0 0 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301 315 A S H < 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 302 316 A L < 0 0 0 24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303 318 A A 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304 319 A K + 0 0 0 19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 305 320 A A S S- 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306 321 A T > - 0 0 0 25 . . . . . . . . . . . . . . Dt . . . . . . . . . . . . . . . 307 322 A P H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . Gt . . . . . . . . . . . . . . . 308 323 A Q H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . . Te . . . . . . . . . . . . . . . 309 324 A V H > S+ 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310 325 A S H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 311 326 A E H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 312 327 A D H X S+ 0 0 0 34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ih . . . 313 328 A I H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Yh . . . 314 329 A A H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . Ts . . . . . . . . . . . Lh . . . 315 330 A G H X S+ 0 0 0 29 . . . . . . . . . . . . . . Gs . . . . . . . . . . . Fh . . . 316 331 A A H X S+ 0 0 0 26 . . . . . . . . . . . . . . R . . . . . . . . . . . . . . . 317 332 A L H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . . . . . . . . . Vt . . . . . . . . . . . . . . . 318 333 A Q H X S+ 0 0 0 41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gt . 319 334 A R H < S+ 0 0 0 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . At . . . . . I . 320 335 A L H < S+ 0 0 0 56 . . . . . . . . . . Dh . . . . . . . . . . . Ns . Le . . . Ge . 321 336 A T H < S+ 0 0 0 70 . . Ht . . . . . . It Vh V . . . . . . . . . . Ts . I . . . Ie . 322 337 A G < - 0 0 0 64 . . Lt . . . . . . At Dh K . . . . . . . . . . At . G . . . . . 323 338 A E + 0 0 0 66 . . Ht . . . . . . G Rh D . . Ih . . . . . Lh . Ds . Es . . . . . 324 339 A G S > S+ 0 0 0 57 . . Nt . . . . . . Hs Qh Nh . . Lh . . . . . Gh . Gt . . . Sh . . . 325 340 A R T 3 S- 0 0 0 54 . . Ft . . . . . . Ss Rh Ah . . Eh . . . . . Ih . At . . . Sh . . . 326 341 A G T 3 0 0 0 56 . . Lt . . . . . . D G Rh . . . . . . . . Qh . Ds . . . Ah . . . 327 342 A A < 0 0 0 50 . . Gs . . . . . . V Y Ag . . . . . . . . Fh . R . Ss . Ih . . Qt 328 344 A G 0 0 0 66 . . Ts . . . Ft . . . . Gs . . . Gg . . . . . . Gs . Vs . . . . Gt 329 345 A S 0 0 0 78 . . Fb . . . Ke . . . . Q . . . Tt . . . . . . . . K . . . . Ke 330 347 A F 0 0 0 81 . . Ht . . . Ge . . . . K . . . Ae . . . . . . . . T . Ah . . Pe 331 348 A K E -EF 228 285A 0 79 . . . . . . Ne . . . . . . . . Se . . . . . . . . Q . Kh . . . 332 349 A V E +EF 227 284A 0 80 . Ys . . . . Ae . . . . . . . . Me . . . . . . . . F . Sh . . . 333 350 A I E -E 226 0A 0 84 E S . . . T Re . . . . . . . . Ce E . . . . . . . Ne . L . . . 334 351 A G E -EF 225 281A 0 83 Ee Le . Ie . L Ve . . . . . . . . Ve Ee . . . . . . . Ye . . . . . 335 352 A V E +EF 224 280A 0 84 Ve Ie . He . Vb Ie . . . . . . . . Fe Ve . . . . . . . Fe . . . . . 336 353 A S E -EF 223 279A 0 82 Ie . . Ee . C L . . . . . . . . Re Ie . . . . . . . Ke . . . . . 337 354 A D > - 0 0 0 79 . . . Ve . N Pt . . . Vh . . . . H . . . . . . . . Ke . . . . . 338 355 A P T 3 S+ 0 0 0 67 . . . . . . Gt . . . Ih . . . . L . . . . . . . P Ie . . . . . 339 356 A K T 3 S+ 0 0 0 60 . . . . . . Mt . . . Rh . . . . Ss . . . . . . . Ve Ie . . . . . 340 357 A I < - 0 0 0 39 . . Hh . . . Ts . . Gs Nh . . . . . . . . . . Lh . Ae Q . . . . . 341 358 A E + 0 0 0 41 . . Hs . . . A . . Eh . . . . . . . . . . . Ah . Se Q . . . Eh . 342 359 A T - 0 0 0 42 . . Ds . N . . . . Kh . . . . . . . . . . . Sh . Ge L . . . Ah . 343 360 A L >>> - 0 0 0 36 . . Pt . Lt . . . . Lh . . . . . . . . . . . Mh . Ne . . . Hh Lh . 344 361 A V T 345S+ 0 0 0 54 . . Q . Lt . I . . Eh . Te . . . . . . . . . V . . . . . Ft Lh . 345 362 A A T 345S+ 0 0 0 61 . . W . Et . P . . Vh . Ie . . . . . . . . . Y . . . . . Dt Qt . 346 363 A L T <45S- 0 0 0 65 . . D . Ht . L . . Yh . Ke . . . . . . . . . R . . P . . F Et . 347 364 A S T <5S+ 0 0 0 55 . . Q . H . N . . Fh . K . . . . . . . . . P . . E . . . . . 348 365 A D < 0 0 0 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . 349 366 A D 0 0 0 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Yb . . . . .
- ALIGNMENTS 211 - 230
SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . :
1 2 A I 0 0 0 12 . Ps . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 3 A D - 0 0 0 19 . Ys . . . . Pg . . . . . . . . . . . . . 3 4 A Q S S+ 0 0 0 28 . Lb . . . . Sg . . . . . . . . . Ss . . . 4 5 A T S > S- 0 0 0 36 . G . . . . Lg . . . Kh . . . . . Ph . . . 5 6 A A H > S+ 0 0 0 33 . Gs . . . . Lt . . . Eh . . . . . Eh . . . 6 7 A L H > S+ 0 0 0 32 . Ks . . . . . . . . Rh . . . . . Ah . . . 7 8 A A H > S+ 0 0 0 29 . Db . . . . Gt . . . Lh . . . . . Ah . . . 8 9 A T H X S+ 0 0 0 29 . Y . . . . Ht . . . Eh . . . . . Rh . . . 9 10 A E H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . Le . . . Sh . . . . . . . . . 10 11 A I H X S+ 0 0 0 28 . . . . . . Re . . . Ft . . . . . . . . . 11 12 A K H X S+ 0 0 0 24 . . . . . . . . . . H . . . . . . . . . 12 13 A R H X S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . Y . . . . . . . . . 13 14 A L H X S+ 0 0 0 17 . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 15 A I H X S+ 0 0 0 13 . Qe . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 16 A K H < S+ 0 0 0 22 . Fe . Kh . . . . . . . . . . . . . . . . 16 17 A A H < S+ 0 0 0 25 . G . At . . . . . . Pt . . . . . . . . . 17 18 A A H < S- 0 0 0 25 . Ve . Gt . . . . . . Dt . . . . . . . . . 18 19 A G < 0 0 0 24 . Se . Q . . . . . . K . . . . . . . . . 19 20 A P 0 0 0 20 . Fh . . . . . . . . P . . . . . . . . . 20 22 A P >> 0 0 0 22 . Lh . Qh . . . . . . Ah . . . . . . . . . 21 23 A V T 34 + 0 0 0 23 . Gh . Kh . . . . . . Ih . . . . . . . . . 22 24 A W T 34 S+ 0 0 0 24 I Mt . Ah . . . . . . Ah . . . . . . . . . 23 25 A R T <4 0 0 0 22 T Gt . Ih . . . . . . Qh . . . . . . . . . 24 26 A Y < 0 0 0 19 Lg L . Eh . . . . . . Dh . . . . . . . . . 25 28 A E > 0 0 0 13 Rg . . . . . . . . . Qh . . . . . . . . . 26 29 A L H > + 0 0 0 17 Rg . . . . . Re . . . Yh . . . . . . . . . 27 30 A C H 4 S+ 0 0 0 20 At . . . . . Ce . . . Ch . . . . . . . . . 28 31 A L H 4 S+ 0 0 0 21 Et . . . . . Fs . . . Vh . . . . . . . . . 29 32 A G H < + 0 0 0 20 Dh . . . . . Fs . . . Dh . . . . . . . . . 30 33 A H X - 0 0 0 18 . . . . . . . . . . Kh . . . . . . . . . 31 34 A P T 4 S+ 0 0 0 11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32 35 A E T 4 S+ 0 0 0 13 . . . . . . . . . . . . . . . . Ae . . . 33 36 A H T 4 S+ 0 0 0 16 . . . . . . . . . . . . . . . . Ge . . . 34 37 A G X - 0 0 0 18 Fh . . . . . . . . . Vh . . . . . Ie . . . 35 38 A Y T 4 S+ 0 0 0 28 Nh . . . . . G . . . Hh . . . . . Ge . . . 36 39 A Y T 4 S+ 0 0 0 36 Kh . . . . . G . . . Sh Rt . . . . . . . . 37 40 A V T 4 S+ 0 0 0 37 Ih . . . . . Vt . . . Dh Nt . . . . . . . . 38 41 A T < 0 0 0 39 Vh . . . . . Pt . . . Gs It . . . . . . . . 39 42 A R 0 0 0 42 Mh . . . . . Tt . . . Th Ys . . . . . . . . 40 51 A F 0 0 0 44 Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 52 A T + 0 0 0 57 Ah . . . . . . . . . . . . P . . Ke . . . 42 53 A T S >> S- 0 0 0 65 Rh . . . . . . . . . . . . Pt . . Pe . . . 43 54 A S H 3> S+ 0 0 0 64 Rh . . . . . . . . . . . . Gt . . Ie . . . 44 55 A P H 34 S+ 0 0 0 50 Ih . . . . . . . . . . . . Ts . . Se . . . 45 56 A E H <4 S+ 0 0 0 61 . . . . . . A . . . Ie . . . C . . . . . 46 57 A I H < S- 0 0 0 60 . . . . . . T . . . R . . . Ph . . . . . 47 58 A S < 0 0 0 80 . . . . . . G . . . E . . . Dh . Rh . . . 48 59 A Q 0 0 0 82 . . . . . . D . . . Kh . . . Ih . Fh . . . 49 61 A F > 0 0 0 110 Nt . . . . . Ih . . . Eh . . Kh Lh . Ah . . . 50 62 A G H > + 0 0 0 106 S . . . . . Gh . . . Vh . . Th Gh . Th . . . 51 63 A E H > S+ 0 0 0 112 Kh . . . . . Qh . . . . . . Lh Yh . Rh . . . 52 64 A L H > S+ 0 0 0 121 Nh . . . . . Hh . . . . . . Ih Rh . Rh . . . 53 65 A L H X S+ 0 0 0 126 Kh . . . . . Vh . . . . . . Ah Ih . Lh . . . 54 66 A G H X S+ 0 0 0 125 Ih . . . . . Ah . . . . . . Rh Ah . Mh . . . 55 67 A L H X S+ 0 0 0 137 Rh . . . . . Eh . Kh . . . . Ah Qh . Eh . . . 56 68 A W H X S+ 0 0 0 141 Kh . . . . . Lh . Sh . . . . Vh Lh . Rh . . Nh 57 69 A S H X S+ 0 0 0 140 Lh . . . . . V . Lh . . . . Ah Ah . Ah . . 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Qh Ih Lh Nh Sh Kh Qh . Dh . Ah Sh Kh Mh Wg 215 229 A S H X S+ 0 0 0 221 Rh Yh Nh . Ah Rh Rh Sh Kh Lh Dh Th Lh Gt . Kh Ah Ls Qh Kg 216 230 A R H X>S+ 0 0 0 218 Lh Ah Fh . Vh Lh Gh Nt Fh Vh Ch Fh Ah L . Fh . Ds Vh Ss 217 231 A V H X5S+ 0 0 0 194 Gh Lh Gt . Lh Ah Ah At . Kh N Ih Hs . . Lh . Gg Qh . 218 232 A R H <5S+ 0 0 0 136 Rh Rh . . Eh Rh Gh . . Eh . Ah Ps Q . Lh . Gg Lh . 219 233 A D H <5S+ 0 0 0 163 Ih Yh . . Ms At Lh . . Wh . Kh . Rs Ts Eh . Ng E . 220 234 A Q H <5S- 0 0 0 149 L . . . Ps . Ss . Gt N . Kh . As Qs Ht . Kt V . 221 235 A G << + 0 0 0 184 Ve Gt . . Rt Gt Gt . L Is . Ie Hs H De . . Ve P Ks 222 236 A G E -d 137 0A 0 205 Le C . . G V G . D He Ws Ie N Ve Ie K . Ae Ve Q 223 237 A A E -dE 138 336A 0 224 Ye Ie Se . Ce Ve R V T Le Re Fe T Ie He K . Ne Le Ve 224 238 A A E -dE 139 335A 0 225 Ee Pe Ve . Ie Le S P Ae Ie Te Ie Ie Ve Qe F . Ve Se Ie 225 239 A L E -dE 140 334A 0 225 Le Ve Ae . Ne Ve Ve Me Le Ge Ae Ge Fe Me Fe Le . Ve Ve Ve 226 240 A I E -dE 141 333A 0 223 Ie Ve Re . 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Th . . . . . . . . . . . . . . . . . 240 254 A F + 0 0 0 32 . . Mh . . . . . . . . . . . . . . . . . 241 255 A Q E -L 261 0E 0 25 . . Fh . . . . . . . . . . . . . . . . . 242 256 A A E -LM 260 249E 0 16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . H . 243 257 A I E -LM 259 248E 0 17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . E . 244 258 A A - 0 0 0 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ss . 245 259 A S S S+ 0 0 0 13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kh . 246 260 A H S S+ 0 0 0 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . 247 261 A S S S- 0 0 0 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248 262 A Y E -M 243 0E 0 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 249 263 A A E -M 242 0E 0 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250 264 A D > - 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 251 265 A P T 3 S+ 0 0 0 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 252 266 A L T 3 S+ 0 0 0 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 253 267 A Q S < S- 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254 268 A H S > S- 0 0 0 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 255 269 A P T 3 S+ 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256 270 A G T 3 S+ 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257 271 A R S < S+ 0 0 0 6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258 272 A A S S- 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259 273 A D E -L 243 0E 0 23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260 274 A L E +L 242 0E 0 32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261 275 A T E -L 241 0E 0 48 . . Kh . . . . Is . . . . . . . . . . . At 262 276 A A - 0 0 0 71 . . Ah . Rt . . Ah . . . . . . . . . . . A 263 277 A H - 0 0 0 83 . . Lh . Wt Ag . Eh . . . . . . . . . Lh . V 264 278 A V E -k 230 0D 0 100 . . Rh . Rb bg . Qh . . . . . Sg . . . Sh . D 265 279 A D E > -k 231 0D 0 151 . . . . Gs Lg . . Ah Ih Yh Eh Vh Is . . . R . N 266 280 A F H > S+ 0 0 0 163 . . . . . Ye . . Eh Ah Fh Yh Sh D . . . L . . 267 281 A D H > S+ 0 0 0 175 . . . . Gs . . Eh Th Rh Ah Hh Rh Pg . . . Db . . 268 282 A A H > S+ 0 0 0 178 . . . . Ls . . Rh Kh Kh Yh Dh Nh Ag . . . . . Pg 269 283 A L H X S+ 0 0 0 187 . . E . Ds . Te Ih Ih Sh Qh Mh Ih Lg . . . . . Ig 270 284 A G H X S+ 0 0 0 190 . . E . T . T Vh Kh Lh Vh Lh Eh Rt . . . . . Fg 271 285 A R H X S+ 0 0 0 169 . . Tt . . . Rt Eh Th Ih Dh Kh Qh Rs . . . . . Yg 272 286 A A H X S+ 0 0 0 161 . . Yt Ig . . At . Gt Kh Rh Lh Lh Ft . . . . . . 273 287 A A H ><>S+ 0 0 0 154 . . As Fg . . Ht . I Nh Fh Lh Rh Gt . . . . . . 274 288 A E H ><5S+ 0 0 0 121 . . . Qg . . . . V . . Nt Kh . . . G . . . 275 289 A S H 3<5S+ 0 0 0 92 . . . Fg . . . . . . . . Dh . . . Ig . . . 276 290 A I T <<5S- 0 0 0 100 . . . A . . . . . . . . . . . . Gg . . . 277 291 A G T < 5S+ 0 0 0 105 . . . Ks . . . . . . . . . . . . Mg . . . 278 292 A A < - 0 0 0 120 . . . Ks . . . . . Qt . . . . . . A . . . 279 293 A R E -F 336 0A 0 137 . Th . Fe . . . . . A . Vb . . . . Ae . . . 280 294 A A E -F 335 0A 0 138 . V . Ve Gs . V . . Ds . S . Fs . . Ge . . . 281 295 A H E -F 334 0A 0 142 . I . Ve D . H . . Le . S . D . . Me As . . 282 296 A G E - 0 0 0 117 . Db . Ye Me . Ye . . . . P . Re . . Ne Re . . 283 297 A P E + 0 0 0 104 . . . Ee Le . Ie . . . . . . Ee . . . Ne . . 284 298 A V E -F 332 0A 0 112 . . . Ve Ye Ve . . . . . . . Ve . . . Ve . . 285 299 A T E > -F 331 0A 0 121 . . . L Ke Ge . . . De . Gt . De . . . Qe . . 286 300 A Q H > S+ 0 0 0 119 . . . Rh Le Ae Te . . Lg . Qt . I . . . . . . 287 301 A G H > S+ 0 0 0 116 . . . Eh Se Te Et . . Tg . Ms . G . . . . . . 288 302 A A H > S+ 0 0 0 67 . . . Dh . . Yt . . Qg . A . . . . . . . . 289 303 A F H X S+ 0 0 0 70 . . . Eh . . Ge . . . . . . . . . Me . . . 290 304 A L H <>S+ 0 0 0 67 . . . F . . . . . . . . . . . . G . . . 291 305 A K H ><5S+ 0 0 0 63 . . . . . . . . . . . . . . . . Ds . . . 292 306 A R H 3<5S+ 0 0 0 54 . . . . . . . . . . . . . . . . Gs . . . 293 307 A L T 3<5S- 0 0 0 37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294 308 A G T <>5 + 0 0 0 48 . . . Ah . . . . . . . . . . . . . . . . 295 309 A I H ><S+ 0 0 0 47 . . . Lh . N . . . . . . . Gh . . . . . . 296 310 A E H > S+ 0 0 0 47 . . . Mh . At . . . . . . . Rh . . . . . . 297 311 A T H > S+ 0 0 0 44 . . . Sh . Qt . . . . . . . Lh . . . . . . 298 312 A R H X S+ 0 0 0 40 . . . Lh . Ds . . . . . . . Eh . . . . . . 299 313 A A H < S+ 0 0 0 39 . . . Hh . . . . . . . . . Ih . . . . . . 300 314 A L H < S+ 0 0 0 31 . . . Hh . . . . . . . . . Lh . . . . . . 301 315 A S H < 0 0 0 27 . . . Ch . . . . . . . . . Qh . . . . . . 302 316 A L < 0 0 0 24 . . . Wh . . . . . . . . . Ih . . . . . . 303 318 A A 0 0 0 21 . . . Lh . . . . . . . . . Tt . . . . . . 304 319 A K + 0 0 0 19 . . . Nh . . . . . . . . . Kt . . . . . . 305 320 A A S S- 0 0 0 22 . . . At . . . . . . . . . Nt . . . . . . 306 321 A T > - 0 0 0 25 . . . Gt . . . . . . . . . Ms Ph . . . . . 307 322 A P H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . K Rh . . . . . 308 323 A Q H > S+ 0 0 0 21 . . . . . . . . . . . . . Lb Eh . . . . . 309 324 A V H > S+ 0 0 0 22 . . . . . . . . . . . . . . Rh . . . . . 310 325 A S H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . Qh . . . . . 311 326 A E H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . Nh . . . . . 312 327 A D H X S+ 0 0 0 34 . . . . . . . . . . . . . . Kh . . . . . 313 328 A I H X S+ 0 0 0 27 . . . . . . . . . . . . . . Vh . . . . . 314 329 A A H X S+ 0 0 0 28 . . . I . . . . . . . . . . Lh . . . . . 315 330 A G H X S+ 0 0 0 29 . . . Q . . . . . . . . . H Eh . . . . . 316 331 A A H X S+ 0 0 0 26 . . . Ce . . . . . S . . . V Gh . . . . . 317 332 A L H X S+ 0 0 0 28 . . . Ee . . . . . As . . . Gh Vh . . . . . 318 333 A Q H X S+ 0 0 0 41 . . . . . . . . . Ds . . . Ah Qh . . . . . 319 334 A R H < S+ 0 0 0 47 . . . . . . . . . Q . . . Dh Yh . . . . . 320 335 A L H < S+ 0 0 0 56 . . . . . Pb . . . Hb . . Vb . Vh . . Ie . . 321 336 A T H < S+ 0 0 0 70 . . . . Ce V . . . R . . E . Lh . . H . . 322 337 A G < - 0 0 0 64 . . . . Pe Te . . . . . D I . Th . . Gs . . 323 338 A E + 0 0 0 66 . . . . I Le . . . . . Pt M . . . . V . . 324 339 A G S > S+ 0 0 0 57 . . . . T Gt . . . . . Tt . . . . . . . . 325 340 A R T 3 S- 0 0 0 54 . . . . At . . . . . . Tt . . . . . . . . 326 341 A G T 3 0 0 0 56 . . . . Et Tt . . . . . N . . . . . . . . 327 342 A A < 0 0 0 50 . . . . D Le . . . . . . . . . . . . . . 328 344 A G 0 0 0 66 . . . . . Ge . . . . . P . . Ls . . . . . 329 345 A S 0 0 0 78 . . . . . T . . . . . Eb . . E . . . . . 330 347 A F 0 0 0 81 . . . . . N . . . . . Y . . Eh . . . . . 331 348 A K E -EF 228 285A 0 79 . . . . . . . . . . . L . . Sh I . . . . 332 349 A V E +EF 227 284A 0 80 . . . . . . . . . . . De . . Ce Gs . . . . 333 350 A I E -E 226 0A 0 84 . . . . . . . . . . . Ye . . He Gs . . . Pt 334 351 A G E -EF 225 281A 0 83 . . . . . . . . . . . . . . Ye Tb . . . Nt 335 352 A V E +EF 224 280A 0 84 . . . . . . . . P . . Fe . . De Le . . . Te 336 353 A S E -EF 223 279A 0 82 . . . . . . . . Ts . . Ve . . Ke Fe . . . Ae 337 354 A D > - 0 0 0 79 . . . . . . . . He . . Eb . . Ie E . . . . 338 355 A P T 3 S+ 0 0 0 67 . . . . . T . . Ie . . Nt . . Pe . . . . . 339 356 A K T 3 S+ 0 0 0 60 . . . . . Lh . . . . . Gt . . . . . . . . 340 357 A I < - 0 0 0 39 . . . . . Ah . . . . . Hs . . . . . . . . 341 358 A E + 0 0 0 41 . . . . . Eh . . . . . A . . . . . . . . 342 359 A T - 0 0 0 42 . . . . . Lh . Sh . . . S Kh . . . . . . . 343 360 A L >>> - 0 0 0 36 . . . . . Rh . D . . . We Gh . . . . Gt . . 344 361 A V T 345S+ 0 0 0 54 . . . . A Qh Ae Ph . . Y He F . . . . Gt . . 345 362 A A T 345S+ 0 0 0 61 . . . . K . Ae Gh . . Fb Ne K . . . . G . . 346 363 A L T <45S- 0 0 0 65 . A . . P Lh Ne Vh . E R . . . . . Lh Qb . . 347 364 A S T <5S+ 0 0 0 55 . N . . Eb Ih L . . Ks A . . . . . Lh N . . 348 365 A D < 0 0 0 37 . Hh . . . Hh . . . Ns N . . . . . Ih T . . 349 366 A D 0 0 0 23 . Ah . . . Fh . . . Q R . . . . . Gh . . .
- EQUIVALENCES: ranges of aligned residues
NR. STRID1 STRID2 STRID1 <=> STRID2 STRID1 <=> STRID2 1: 3027-A 1zkd-A 1 - 349 <=> 1 - 349 (ILE A 2 - ASP A 366 <=> ILE A 2 - ASP A 366) 2: 3027-A 2ex4-A 20 - 25 <=> 9 - 14 (PRO A 22 - GLU A 28 <=> GLU A 7 - PHE A 12) 2: 3027-A 2ex4-A 26 - 29 <=> 16 - 19 (LEU A 29 - GLY A 32 <=> SER A 14 - LYS A 17) 2: 3027-A 2ex4-A 34 - 39 <=> 20 - 25 (GLY A 37 - ARG A 42 <=> THR A 18 - ILE A 23) 2: 3027-A 2ex4-A 40 - 43 <=> 34 - 37 (PHE A 51 - SER A 54 <=> GLY A 32 - GLY A 35) 2: 3027-A 2ex4-A 45 - 48 <=> 38 - 41 (GLU A 56 - GLN A 59 <=> HIS A 36 - SER A 39) 2: 3027-A 2ex4-A 49 - 64 <=> 43 - 58 (PHE A 61 - ALA A 76 <=> ASP A 41 - THR A 61) 2: 3027-A 2ex4-A 69 - 81 <=> 60 - 72 (THR A 81 - THR A 93 <=> THR A 63 - ARG A 75) 2: 3027-A 2ex4-A 82 - 85 <=> 75 - 78 (ALA A 96 - LEU A 99 <=> LYS A 78 - LEU A 81) 2: 3027-A 2ex4-A 95 - 119 <=> 80 - 104 (TYR A 109 - GLY A 133 <=> PRO A 83 - GLU A 107) 2: 3027-A 2ex4-A 120 - 123 <=> 106 - 109 (ILE A 134 - ILE A 137 <=> GLY A 109 - VAL A 112) 2: 3027-A 2ex4-A 124 - 127 <=> 111 - 114 (HIS A 138 - ASP A 141 <=> ASN A 114 - CYS A 117) 2: 3027-A 2ex4-A 128 - 131 <=> 120 - 123 (SER A 142 - ASP A 145 <=> PHE A 123 - GLU A 126) 2: 3027-A 2ex4-A 134 - 148 <=> 125 - 139 (GLU A 148 - LEU A 162 <=> ASP A 128 - LEU A 142) 2: 3027-A 2ex4-A 204 - 207 <=> 140 - 143 (TRP A 218 - ASP A 221 <=> THR A 143 - HIS A 146) 2: 3027-A 2ex4-A 208 - 217 <=> 146 - 155 (THR A 222 - VAL A 231 <=> GLU A 149 - LEU A 158) 2: 3027-A 2ex4-A 219 - 231 <=> 156 - 168 (ASP A 233 - HIS A 245 <=> ARG A 159 - ALA A 171) 2: 3027-A 2ex4-A 236 - 243 <=> 170 - 177 (VAL A 250 - ILE A 257 <=> GLU A 173 - VAL A 180) 2: 3027-A 2ex4-A 259 - 264 <=> 178 - 183 (ASP A 273 - VAL A 278 <=> ASP A 181 - ARG A 186) 2: 3027-A 2ex4-A 265 - 274 <=> 187 - 196 (ASP A 279 - GLU A 288 <=> VAL A 190 - GLY A 199) 2: 3027-A 2ex4-A 278 - 287 <=> 197 - 206 (ALA A 292 - GLY A 301 <=> LEU A 200 - GLU A 209) 2: 3027-A 2ex4-A 320 - 323 <=> 207 - 210 (LEU A 335 - GLU A 338 <=> ASN A 210 - ASP A 213) 2: 3027-A 2ex4-A 326 - 336 <=> 211 - 221 (GLY A 341 - SER A 353 <=> GLU A 214 - ARG A 224) 3: 3027-A 1im8-A 34 - 39 <=> 1 - 6 (GLY A 37 - ARG A 42 <=> PHE A 17 - ASN A 22) 3: 3027-A 1im8-A 40 - 43 <=> 13 - 16 (PHE A 51 - SER A 54 <=> ASP A 29 - GLN A 32) 3: 3027-A 1im8-A 47 - 61 <=> 23 - 37 (SER A 58 - TRP A 73 <=> SER A 39 - VAL A 53) 3: 3027-A 1im8-A 67 - 81 <=> 38 - 52 (PRO A 79 - THR A 93 <=> THR A 54 - ALA A 68) 3: 3027-A 1im8-A 82 - 88 <=> 55 - 61 (ALA A 96 - LEU A 102 <=> LEU A 71 - ILE A 77) 3: 3027-A 1im8-A 94 - 121 <=> 62 - 89 (LEU A 108 - ARG A 135 <=> ASN A 78 - HIS A 105) 3: 3027-A 1im8-A 122 - 126 <=> 93 - 97 (ASN A 136 - HIS A 140 <=> PRO A 109 - LEU A 113) 3: 3027-A 1im8-A 127 - 130 <=> 99 - 102 (ASP A 141 - GLU A 144 <=> ASN A 115 - ARG A 118) 3: 3027-A 1im8-A 131 - 149 <=> 104 - 122 (ASP A 145 - PRO A 163 <=> VAL A 120 - PRO A 138) 3: 3027-A 1im8-A 206 - 209 <=> 123 - 126 (PRO A 220 - GLU A 223 <=> PRO A 139 - ARG A 142) 3: 3027-A 1im8-A 211 - 221 <=> 127 - 137 (LEU A 225 - GLY A 235 <=> ILE A 143 - LEU A 153) 3: 3027-A 1im8-A 222 - 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ARG A 285 <=> PRO A 153 - TYR A 156) 230: 3027-A 1d4o-A 333 - 336 <=> 154 - 157 (ILE A 350 - SER A 353 <=> PRO A 158 - ALA A 161)
- MATRICES: UX+T is the least-squares superimposition of STRID2 (X) onto STRID1
NR. STRID1 STRID2 U(.,1) U(.,2) U(.,3) T(.) 1: 3027-A 1zkd-A U(1,.) 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1: 3027-A 1zkd-A U(2,.) 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1: 3027-A 1zkd-A U(3,.) 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 2: 3027-A 2ex4-A U(1,.) -0.784130 -0.139142 -0.604797 21.116047 2: 3027-A 2ex4-A U(2,.) -0.225490 0.971815 0.068772 51.964062 2: 3027-A 2ex4-A U(3,.) 0.578182 0.190302 -0.793404 126.083427 3: 3027-A 1im8-A U(1,.) 0.943657 0.245074 -0.222375 9.765998 3: 3027-A 1im8-A U(2,.) -0.197750 0.956411 0.214879 35.624630 3: 3027-A 1im8-A U(3,.) 0.265344 -0.158797 0.950987 119.055443 4: 3027-A 2gb4-A U(1,.) 0.579120 -0.684655 -0.442568 16.985338 4: 3027-A 2gb4-A U(2,.) 0.254496 -0.363911 0.895991 32.173134 4: 3027-A 2gb4-A U(3,.) -0.774501 -0.631519 -0.036506 141.323746 5: 3027-A 2fk7-A U(1,.) 0.768745 -0.433810 -0.469937 11.665185 5: 3027-A 2fk7-A U(2,.) 0.618842 0.319062 0.717798 16.691759 5: 3027-A 2fk7-A U(3,.) -0.161449 -0.842620 0.513737 123.133392 6: 3027-A 2ob1-A U(1,.) 0.271096 -0.731445 0.625696 76.999481 6: 3027-A 2ob1-A U(2,.) 0.076621 0.664374 0.743462 -10.840287 6: 3027-A 2ob1-A U(3,.) -0.959498 -0.153608 0.236154 156.720261 7: 3027-A 2f8l-A U(1,.) -0.870579 0.314934 -0.378032 63.498672 7: 3027-A 2f8l-A U(2,.) 0.150566 0.901976 0.404684 9.007284 7: 3027-A 2f8l-A U(3,.) 0.468424 0.295391 -0.832660 135.844009 8: 3027-A 2avn-A U(1,.) 0.041243 -0.817043 -0.575100 42.543903 8: 3027-A 2avn-A U(2,.) 0.729624 -0.368607 0.576002 26.188889 8: 3027-A 2avn-A U(3,.) -0.682604 -0.443363 0.580931 158.026794 9: 3027-A 2bzg-A U(1,.) 0.377131 0.141632 -0.915266 25.058592 9: 3027-A 2bzg-A U(2,.) -0.926096 0.069273 -0.370874 78.350670 9: 3027-A 2bzg-A U(3,.) 0.010875 0.987493 0.157290 107.296982 10: 3027-A 2aot-A U(1,.) -0.559088 -0.827977 0.043309 41.264484 10: 3027-A 2aot-A U(2,.) -0.080750 0.106365 0.991043 25.158154 10: 3027-A 2aot-A U(3,.) -0.825167 0.550583 -0.126326 166.298248 11: 3027-A 2p8j-A U(1,.) -0.360923 -0.589234 -0.722868 61.593998 11: 3027-A 2p8j-A U(2,.) -0.027678 0.781540 -0.623240 2.743798 11: 3027-A 2p8j-A U(3,.) 0.932185 -0.204934 -0.298385 133.084335 12: 3027-A 1vl5-A U(1,.) -0.465532 0.814603 -0.345980 59.048431 12: 3027-A 1vl5-A U(2,.) -0.141932 -0.454580 -0.879325 130.510757 12: 3027-A 1vl5-A U(3,.) -0.873576 -0.360249 0.327240 143.449814 13: 3027-A 1hnn-A U(1,.) -0.296829 -0.107580 0.948852 14.311723 13: 3027-A 1hnn-A U(2,.) 0.587982 0.762349 0.270373 -9.318488 13: 3027-A 1hnn-A U(3,.) -0.752442 0.638162 -0.163032 112.005180 14: 3027-A 1m6e-X U(1,.) -0.194588 -0.315956 0.928605 4.722201 14: 3027-A 1m6e-X U(2,.) -0.486451 0.853164 0.188352 45.524376 14: 3027-A 1m6e-X U(3,.) -0.851763 -0.415070 -0.319712 185.857941 15: 3027-A 2fay-A U(1,.) -0.063574 -0.840339 0.538321 19.551447 15: 3027-A 2fay-A U(2,.) -0.215315 0.538258 0.814812 47.829224 15: 3027-A 2fay-A U(3,.) -0.974473 -0.064108 -0.215157 121.644478 16: 3027-A 2h00-A U(1,.) -0.461201 -0.884216 0.073858 55.331127 16: 3027-A 2h00-A U(2,.) 0.866106 -0.430543 0.253954 -26.452120 16: 3027-A 2h00-A U(3,.) -0.192752 0.181093 0.964392 139.313904 17: 3027-A 1wy7-A U(1,.) -0.649822 -0.759639 -0.026064 41.062325 17: 3027-A 1wy7-A U(2,.) 0.205460 -0.208565 0.956184 2.538274 17: 3027-A 1wy7-A U(3,.) -0.731790 0.615994 0.291605 138.552017 18: 3027-A 1m6y-A U(1,.) 0.534000 -0.124240 -0.836306 36.937218 18: 3027-A 1m6y-A U(2,.) 0.828859 -0.118267 0.546815 86.792969 18: 3027-A 1m6y-A U(3,.) -0.166844 -0.985179 0.039823 102.308762 19: 3027-A 1i9g-A U(1,.) -0.847686 0.405647 -0.341875 44.238178 19: 3027-A 1i9g-A U(2,.) -0.528706 -0.593076 0.607232 44.801357 19: 3027-A 1i9g-A U(3,.) 0.043564 0.695493 0.717211 114.594696 20: 3027-A 1zq9-A U(1,.) 0.021209 -0.922462 -0.385504 52.923721 20: 3027-A 1zq9-A U(2,.) 0.381585 0.363870 -0.849701 40.540001 20: 3027-A 1zq9-A U(3,.) 0.924091 -0.129081 0.359715 127.121101 21: 3027-A 1vid U(1,.) 0.694278 -0.421224 0.583565 33.212677 21: 3027-A 1vid U(2,.) 0.349966 -0.510932 -0.785157 126.361771 21: 3027-A 1vid U(3,.) 0.628889 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3027-A 1p3y-1 U(2,.) 0.887288 0.439564 -0.139659 24.890274 223: 3027-A 1p3y-1 U(3,.) -0.138592 0.542916 0.828272 55.140446 224: 3027-A 1e32-A U(1,.) -0.943230 0.310961 -0.116707 41.294575 224: 3027-A 1e32-A U(2,.) -0.250185 -0.434072 0.865441 41.500179 224: 3027-A 1e32-A U(3,.) 0.218460 0.845508 0.487228 95.830116 225: 3027-A 2glz-A U(1,.) 0.549768 0.464148 -0.694493 3.929589 225: 3027-A 2glz-A U(2,.) 0.745877 -0.647076 0.157986 25.645922 225: 3027-A 2glz-A U(3,.) -0.376061 -0.604863 -0.701940 162.487793 226: 3027-A 2ako-A U(1,.) -0.517021 0.158561 0.841159 13.550333 226: 3027-A 2ako-A U(2,.) 0.518311 -0.724062 0.455069 40.389725 226: 3027-A 2ako-A U(3,.) 0.681207 0.671262 0.292171 140.415710 227: 3027-A 1tyo-A U(1,.) 0.100842 0.841247 -0.531163 -288.686829 227: 3027-A 1tyo-A U(2,.) 0.109302 -0.540020 -0.834525 -93.693260 227: 3027-A 1tyo-A U(3,.) -0.988880 0.026098 -0.146407 41.297466 228: 3027-A 1i6w-A U(1,.) 0.682835 -0.537266 0.495058 31.980532 228: 3027-A 1i6w-A U(2,.) -0.270578 -0.815423 -0.511735 72.535835 228: 3027-A 1i6w-A U(3,.) 0.678619 0.215479 -0.702171 142.293839 229: 3027-A 1di0-A U(1,.) -0.119284 0.989475 -0.081923 -18.980991 229: 3027-A 1di0-A U(2,.) 0.898509 0.072473 -0.432932 47.122952 229: 3027-A 1di0-A U(3,.) -0.422438 -0.125250 -0.897696 247.414551 230: 3027-A 1d4o-A U(1,.) -0.203868 -0.865599 0.457358 44.370399 230: 3027-A 1d4o-A U(2,.) -0.143285 0.488520 0.860708 30.520973 230: 3027-A 1d4o-A U(3,.) -0.968456 0.109938 -0.223621 134.419189
- FOOTER
References: L. Holm and C. Sander (1996) Mapping the protein universe. Science 273:595-602.
Parameters elastic similarity score, threshold 0.20; sequential alignment
The following notation is used for data columns: STRID1/STRID2 PDB identifiers of search structure and aligned structure with
chain identifier
Z Z-score, i.e., strength of structural similarity in standard
deviations above expexted. The matched structures are sorted
by Z-score. Only matches above a threshold of Z=2 are reported.
RMSD positional root mean square deviation of superimposed CA atoms
in Angstroms
LALI total number of equivalenced residues LSEQ2 length of the entire chain of the equivalenced structure %IDE percentage of sequence identity over equivalenced positions REVERS number of fragments matching in reversed chain direction PERMUT number of topological permutations (loop reconnections between
query and matched structure)
NFRAG total number of equivalenced fragments TOPO 'S' sequential connectivity of equivalenced fragments
'N' non-sequential alignment
PROTEIN COMPND record from the PDB file of the aligned structure SeqNo, PDBNo, AA, STRUCTURE, BP1, BP2, ACC
sequential and PDB residue numbers, amino acid (lower case =
Cys),secondary structure, solvent exposure as in DSSP (Kabsch
and Sander, Biopolymers 22, 2577-2637, 1983). The alignments
block shows the amino acid sequence and DSSP code (in lower
case) of the equivalenced fragments.
OCC number of equivalences spanning this position STRID1 <=> STRID2
sequential residue numbers of equivalenced fragments (PDB
residue numbers in parentheses); any topological permutations
and matches in reverse chain direction are flagged
