FSSP FAMILIES OF STRUCTURALLY SIMILAR PROTEINS, VERSION 1.0 (Apr 1 1995) CREATED Tue May 8 05:21:26 BST 2007 for dali on s030-031.ebi.ac.uk METHOD Dali ver. 2.0: Holm, L., Sander, C. (1993) J.Mol.Biol. 233,123-138 DATABASE 8969 protein chains PDBID 3024-A HEADER COMPND SOURCE AUTHOR SEQLENGTH 230 NALIGN 461 WARNING pairs with Z<2.0 are structurally dissimilar ## SUMMARY: PDB/chain identifiers and structural alignment statistics NR. STRID1 STRID2 Z RMSD LALI LSEQ2 %IDE REVERS PERMUT NFRAG TOPO PROTEIN 1: 3024-A 2f6r-A 40.4 0.0 230 230 100 0 0 1 S TRANSFERASE bifunctional coenzyme a synthase fragment 2: 3024-A 1jjv-A 21.1 2.1 187 194 22 0 0 5 S TRANSFERASE dephospho-coa kinase (dephosphocoenzyme a 3: 3024-A 1tev-A 12.7 2.3 154 194 14 0 0 11 S TRANSFERASE ump-cmp kinase (cytidylate kinase, deoxycy 4: 3024-A 1y63-A 11.9 2.6 143 168 15 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION lmaj004144aaa pr 5: 3024-A 1zin 11.1 2.9 147 217 18 0 0 11 S PHOSPHOTRANSFERASE adenylate kinase (adk) (bacillus s 6: 3024-A 1xrj-A 10.9 3.3 146 211 14 0 0 12 S TRANSFERASE uridine-cytidine kinase 2 (uck 2, uridine 7: 3024-A 5tmp-A 10.7 3.2 154 210 9 0 0 13 S TRANSFERASE thymidylate kinase (escherichia coli) A. 8: 3024-A 1shk-A 10.3 3.0 140 158 12 0 0 9 S TRANSFERASE shikimate kinase biological_unit (erwinia 9: 3024-A 1nks-A 10.1 3.6 149 194 14 0 0 12 S KINASE adenylate kinase (atp:amp phosphotransferase) b 10: 3024-A 2jaq-A 10.0 2.8 108 189 17 0 0 10 S TRANSFERASE deoxyguanosine kinase (deoxyadenosine kina 11: 3024-A 1knq-A 9.6 3.0 141 171 15 0 0 13 S TRANSFERASE gluconate kinase (thermoresistant glucono 12: 3024-A 1gky 9.6 2.3 111 186 13 0 0 11 S TRANSFERASE Guanylate kinase complex with guanosine mo 13: 3024-A 1jag-A 9.5 2.9 152 229 10 0 0 15 S 14: 3024-A 1qhs-A 9.4 3.3 139 178 14 0 0 14 S TRANSFERASE chloramphenicol phosphotransferase (cpt) 15: 3024-A 1via-A 9.1 3.0 132 159 15 0 0 13 S TRANSFERASE shikimate kinase (campylobacter jejuni) b 16: 3024-A 1bif 9.0 3.2 133 432 9 0 0 12 S BIFUNCTIONAL ENZYME 6-phosphofructo-2-kinase fructose- 17: 3024-A 1dek-A 8.9 2.6 110 241 14 0 0 10 S PHOSPHOTRANSFERASE deoxynucleoside monophosphate kinas 18: 3024-A 3tmk-A 8.8 2.8 143 216 6 0 0 15 S KINASE thymidylate kinase biological_unit (saccharomy 19: 3024-A 1cke-A 8.5 3.2 146 212 12 0 0 13 S TRANSFERASE cytidine monophosphate kinase (ck, mssa) 20: 3024-A 1ltq-A 8.2 2.5 115 286 20 0 0 11 S TRANSFERASE polynucleotide kinase (pnk, polynucleotide 21: 3024-A 1g3u-A 8.2 3.1 134 208 11 0 0 14 S TRANSFERASE thymidylate kinase (tmk) (mycobacterium 22: 3024-A 1d6j-A 8.0 3.2 128 177 16 0 0 14 S TRANSFERASE adenosine-5'phosphosulfate kinase (aps kin 23: 3024-A 1yr6-A 7.9 3.2 142 248 11 0 0 14 S HYDROLASE atp(gtp)binding protein fragment (pab0955 ge 24: 3024-A 1esm-A 7.6 2.7 129 311 15 0 0 11 S TRANSFERASE pantothenate kinase (pank) (eschericha c 25: 3024-A 1xjq-B 7.4 3.3 128 590 19 0 0 14 S TRANSFERASE bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'- phosp 26: 3024-A 1t3l-A 7.3 5.2 150 306 14 0 0 17 S TRANSPORT PROTEIN dihydropyridine-sensitive l-type, ca 27: 3024-A 1qhi-A 7.0 3.5 149 300 11 0 0 13 S TRANSFERASE thymidine kinase (tk) biological_unit (he 28: 3024-A 2ov8-A 6.9 3.3 129 241 5 0 0 15 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION stal (streptomy 29: 3024-A 1a7j 6.8 3.9 146 279 9 0 0 14 S TRANSFERASE phosphoribulokinase biological_unit (rhod 30: 3024-A 2ga8-A 6.5 2.8 130 326 15 0 0 15 S UNKNOWN FUNCTION hypothetical 39.9 kda protein (sacch 31: 3024-A 1tex-A 6.3 3.7 135 239 8 0 0 15 S TRANSFERASE stf0 sulfotransferase ec (mycobacterium s 32: 3024-A 1ng1 6.3 3.0 105 294 21 0 0 11 S SIGNAL RECOGNITION signal sequence recognition protein 33: 3024-A 1np6-A 6.2 3.4 109 158 11 0 0 12 S BIOSYNTHETIC PROTEIN molybdopterin-guanine dinucleotid 34: 3024-A 1gvn-B 6.2 3.5 137 272 13 0 0 14 S POSTSEGREGATIONAL KILLING SYSTEM epsilon zeta (strept 35: 3024-A 2hf9-A 6.1 3.3 121 211 17 0 0 11 S HYDROLASE, METAL BINDING PROTEIN probable hydrogenase 36: 3024-A 1lw7-A 6.1 3.3 128 338 14 0 0 14 S TRANSFERASE transcriptional regulator nadr fragment ( 37: 3024-A 1s1m-A 5.9 4.4 135 534 13 0 0 18 S LIGASE ctp synthase (utp--ammonia ligase, ctp syntheta 38: 3024-A 1cp2-A 5.9 3.0 123 269 12 0 0 14 S OXIDOREDUCTASE nitrogenase iron protein (cp2) biologic 39: 3024-A 1aqu-A 5.9 3.7 128 281 10 0 0 14 S TRANSFERASE estrogen sulfotransferase (est) (mus musc 40: 3024-A 1jxm-A 5.8 3.6 108 264 11 0 0 12 S STRUCTURAL PROTEIN postsynaptic density protein fragm 41: 3024-A 1odf-A 5.7 3.7 130 280 12 0 0 13 S YEAST PROTEIN hypothetical 33.3 kda protein in ade3-se 42: 3024-A 1hyq-A 5.7 3.9 120 232 16 0 0 13 S CELL CYCLE cell division inhibitor (mind-1) (mind) ( 43: 3024-A 1nst-A 5.6 3.4 131 282 15 0 0 13 S SULFOTRANSFERASE heparan sulfate n-deacetylaseN-SULFOT 44: 3024-A 2few-B 5.4 3.0 82 96 15 0 0 9 S TRANSFERASE pts system mannitol-specific eiicba compon 45: 3024-A 1byi 5.4 3.7 121 224 11 0 0 18 S LIGASE dethiobiotin synthase biological_unit (escheri 46: 3024-A 1mky-A 5.3 3.7 96 400 17 0 0 10 S LIGAND BINDING PROTEIN probable gtp-binding protein en 47: 3024-A 1dar 5.3 3.4 91 615 11 0 0 8 S TRANSLATIONAL GTPASE elongation factor g (ef-g) (ther 48: 3024-A 2ph1-A 5.2 3.7 119 240 17 0 0 17 S LIGAND BINDING PROTEIN nucleotide-binding protein (ar 49: 3024-A 1w9h-A 5.2 3.2 87 398 7 0 0 9 S NUCLEAR PROTEIN hypothetical protein af1318 (piwi) ex 50: 3024-A 2gi4-A 5.1 2.8 89 156 9 0 0 9 S HYDROLASE possible phosphotyrosine protein phosphatase 51: 3024-A 2bmj-A 5.1 2.8 87 174 20 0 0 11 S HYDROLASE centaurin gamma 1 fragment expression_syste 52: 3024-A 1q44-A 5.1 3.7 123 284 7 0 0 15 S TRANSFERASE steroid sulphotransferase (flavonol sulfot 53: 3024-A 1i3c-A 5.1 2.9 87 144 16 0 0 10 S SIGNALING PROTEIN response regulator rcp1 (synechosy 54: 3024-A 1f48-A 5.1 4.6 128 548 17 0 0 13 S HYDROLASE arsenite-translocating atpase fragment (ars 55: 3024-A 1efc-A 5.1 3.7 104 386 10 0 0 9 S RNA BINDING PROTEIN elongation factor (eftu) biologica 56: 3024-A 1ctq-A 5.1 2.9 90 166 26 0 0 11 S SIGNALING PROTEIN transforming protein p21H-RAS-1 frag 57: 3024-A 1cip-A 5.1 3.6 105 316 13 0 0 11 S HYDROLASE guanine nucleotide-binding protein alpha-1 s 58: 3024-A 1wf3-A 5.0 3.3 91 296 15 0 0 8 S HYDROLASE gtp-binding protein (thermus thermophilus) 59: 3024-A 1hur-A 5.0 3.1 92 180 11 0 0 12 S PROTEIN TRANSPORT human adp-ribosylation factor 1 (har 60: 3024-A 1f6b-A 5.0 2.9 90 176 7 0 0 12 S PROTEIN TRANSPORT sar1 (cricetulus griseus) chinese h 61: 3024-A 1bvy-F 5.0 3.3 89 152 11 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE cytochrome p450 bm-3 fragment cytochrom 62: 3024-A 1tpz-A 4.9 3.0 91 395 18 0 0 9 S SIGNALING PROTEIN interferon-inducible gtpase (iigp1) 63: 3024-A 1iib-A 4.8 3.3 82 103 16 0 0 8 S PHOSPHOTRANSFERASE enzyme iib of the cellobiose-specif 64: 3024-A 1eg7-A 4.8 4.5 148 549 11 0 0 20 S LIGASE formyltetrahydrofolate synthetase (moorella t 65: 3024-A 1e8c-A 4.8 3.1 119 495 12 0 0 14 S LIGASE udp-n-acetylmuramoylalanyl-d-glutamate--2,6- d 66: 3024-A 2cls-A 4.7 3.4 90 179 13 0 0 12 S NUCLEOTIDE BINDING PROTEIN rho-related gtp-binding pro 67: 3024-A 1jfv-A 4.7 2.7 81 131 9 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE arsenate reductase (arsenical pump mod 68: 3024-A 3chy 4.6 3.2 85 128 16 0 0 10 S SIGNAL TRANSDUCTION PROTEIN CheY (escherichia coli) 69: 3024-A 1yco-A 4.6 2.8 79 276 10 0 0 10 S TRANSFERASE branched-chain phosphotransacylase (enter 70: 3024-A 1y80-A 4.6 3.0 85 125 11 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION predicted cobala 71: 3024-A 1g8f-A 4.6 3.2 97 510 9 0 0 10 S TRANSFERASE sulfate adenylyltransferase (atp-sulfuryl 72: 3024-A 1di6-A 4.6 2.9 88 183 14 0 0 11 S UNKNOWN FUNCTION molybdenum cofactor biosythetic enzym 73: 3024-A 1byu-A 4.6 3.3 94 202 16 0 0 12 S TRANSPORT PROTEIN gtp-binding protein ran fragment (tc 74: 3024-A 1di0-A 4.5 4.2 96 148 2 0 0 12 S TRANSFERASE lumazine synthase (brucella abortus) bact 75: 3024-A 1xhe-A 4.4 2.8 83 121 11 0 0 12 S TRANSCRIPTION aerobic respiration control protein arca 76: 3024-A 1fgs 4.4 6.8 128 393 11 0 0 13 S SYNTHETASE folylpolyglutamate synthetase (fpgs) biolog 77: 3024-A 1dcf-A 4.4 3.3 82 133 18 0 0 10 S TRANSFERASE etr1 protein fragment (arabidopsis thalia 78: 3024-A 1cc9-A 4.4 2.8 106 466 7 0 0 16 S 79: 3024-A 2g2c-A 4.3 3.1 87 150 7 0 0 11 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION putative molybde 80: 3024-A 1suw-A 4.3 3.0 78 249 10 0 0 6 S TRANSFERASE probable inorganic polyphosphateATP-NAD KI 81: 3024-A 1req-A 4.3 3.0 85 727 19 0 0 11 S ISOMERASE methylmalonyl-coa mutase (propionibacterium 82: 3024-A 1fui-A 4.3 3.4 94 591 11 0 0 12 S ISOMERASE l-fucose isomerase biological_unit (escheri 83: 3024-A 1dp4-A 4.3 2.8 89 425 3 0 0 10 S HORMONE/GROWTH FACTOR RECEPTOR, LYASE atrial natriuret 84: 3024-A 1bmt-A 4.3 2.9 86 246 5 0 0 10 S METHYLTRANSFERASE Methionine synthase (b12-binding dom 85: 3024-A 4uag-A 4.2 3.0 107 429 16 0 0 14 S LIGASE udp-n-acetylmuramoyl-l-alanine:d-glutamate liga 86: 3024-A 1dbw-A 4.2 3.1 85 123 15 0 0 10 S TRANSCRIPTION transcriptional regulatory protein fixj 87: 3024-A 1amo-A 4.2 2.9 87 601 13 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE nadph-cytochrome p450 reductase fragmen 88: 3024-A 1a2z-A 4.2 4.0 100 220 10 0 0 10 S PEPTIDASE pyrrolidone carboxyl peptidase (pyroglutamyl 89: 3024-A 1y1l-A 4.1 3.2 79 124 11 0 0 8 S TRANSFERASE arsenate reductase (arsc) (archaeoglobus 90: 3024-A 1tlf-A 4.1 3.5 87 296 10 0 0 12 S TRANSCRIPTION REGULATION Tryptic core fragment of the 91: 3024-A 1rtt-A 4.1 3.0 84 174 10 0 0 9 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION conserved hypoth 92: 3024-A 1iow 4.1 3.1 82 306 10 0 0 13 S LIGASE d-ala:d-ala ligase (dd-ligase, ddlb) Mutant (e 93: 3024-A 1bjt 4.1 2.6 82 678 6 0 0 7 S TOPOISOMERASE topoisomerase ii fragment (saccharomyce 94: 3024-A 2phz-A 4.0 3.1 82 270 11 0 0 13 S TRANSPORT PROTEIN iron-uptake system-binding protein 95: 3024-A 1udx-A 4.0 3.9 97 412 14 0 0 12 S PROTEIN BINDING the gtp-binding protein obg (thermus 96: 3024-A 1syw-A 4.0 4.3 104 442 16 0 0 13 S 97: 3024-A 1o1x-A 4.0 2.9 82 142 10 0 0 10 S ISOMERASE ribose-5-phosphate isomerase rpib (thermoto 98: 3024-A 1ega-A 4.0 3.4 85 292 16 0 0 9 S HYDROLASE gtp-binding protein era biological_unit (es 99: 3024-A 1s8n-A 3.9 3.4 82 190 18 0 0 9 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION putative antiter 100: 3024-A 1rcf 3.9 2.9 81 169 9 0 0 9 S ELECTRON TRANSFER(FLAVOPROTEIN) Flavodoxin complexed w 101: 3024-A 1qgu-A 3.9 2.6 80 478 8 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE nitrogenase molybdenum iron protein (ni 102: 3024-A 1kk1-A 3.9 3.5 99 397 15 0 0 12 S TRANSLATION eif2gamma Mutant (pyrococcus abyssi) arch 103: 3024-A 2hna-A 3.8 3.7 83 147 11 0 0 9 S ELECTRON TRANSPORT protein mioc (flavodoxin) (escheri 104: 3024-A 2fcj-A 3.8 3.1 79 114 15 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION small toprim dom 105: 3024-A 2dri 3.8 3.0 84 271 10 0 0 10 S SUGAR TRANSPORT D-ribose-binding protein complexed wit 106: 3024-A 1kgs-A 3.8 3.0 83 219 8 0 0 9 S DNA BINDING PROTEIN DNA binding response regulator d 107: 3024-A 1i9y-A 3.8 2.5 46 336 9 0 0 3 S HYDROLASE phosphatidylinositol phosphate phosphatase 108: 3024-A 1d2n-A 3.8 3.5 103 246 13 0 0 9 S HEXAMERIZATION DOMAIN n-ethylmaleimide-sensitive fusio 109: 3024-A 1b93-A 3.8 3.1 88 148 6 0 0 10 S LYASE protein (methylglyoxal synthase) (escherichia c 110: 3024-A 2iya-A 3.7 3.1 87 392 11 0 0 9 S TRANSFERASE oleandomycin glycosyltransferase (olei) e 111: 3024-A 1tvm-A 3.7 3.3 77 113 13 0 0 9 S TRANSFERASE pts system, galactitol-specific iib compon 112: 3024-A 1qf6-A 3.7 2.8 72 641 13 0 0 10 S LIGASE/RNA threonyl-trna synthetase (thrrs) threonine 113: 3024-A 1nvm-B 3.7 3.1 88 312 13 0 0 11 S LYASE/OXIDOREDUCTASE 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase 114: 3024-A 1g29-1 3.7 2.9 83 372 12 0 0 8 S SUGAR BINDING PROTEIN maltose transport protein malk 115: 3024-A 1ex1-A 3.7 5.0 89 602 11 0 0 13 S HYDROLASE beta-d-glucan exohydrolase isoenzyme exo1 (e 116: 3024-A 1e5d-A 3.7 3.2 98 401 10 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE rubredoxin:oxygen oxidoreductase (des 117: 3024-A 1dxy 3.7 2.9 78 330 9 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE d-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase (d 118: 3024-A 1cex 3.7 3.0 89 197 8 0 0 11 S SERINE ESTERASE cutinase (fusarium solani pisi) S.Lo 119: 3024-A 1a8i 3.7 2.9 87 813 3 0 0 8 S GLYCOGEN PHOSPHORYLASE glycogen phosphorylase b biolog 120: 3024-A 2amj-A 3.6 3.1 81 174 6 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE modulator of drug activity b (escheric 121: 3024-A 1gg4-A 3.6 2.9 90 439 13 0 0 9 S LIGASE udp-n-acetylmuramoylalanyl-d-glutamyl-2,6- dia 122: 3024-A 1gca 3.6 3.0 85 309 11 0 0 10 S GALACTOSE-BINDING PROTEIN GlucoseGALACTOSE-BINDING PRO 123: 3024-A 1f0k-A 3.6 3.0 84 351 14 0 0 11 S TRANSFERASE udp-n-acetylglucosamine-n-acetylmuramyl- 124: 3024-A 1cfz-A 3.6 3.7 92 162 8 0 0 10 S HYDROGENASE hydrogenase 2 maturation protease (escher 125: 3024-A 1cf9-A 3.6 3.3 84 727 10 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE catalase hpii Mutant (escherichia coli 126: 3024-A 1an9-A 3.6 2.6 84 340 12 0 0 9 S OXIDOREDUCTASE d-amino acid oxidase biological_unit ( 127: 3024-A 1ade-A 3.6 5.0 136 431 12 0 0 24 S LIGASE (SYNTHETASE) adenylosuccinate synthetase (esch 128: 3024-A 1a04-A 3.6 3.2 88 205 13 0 0 11 S SIGNAL TRANSDUCTION PROTEIN nitrateNITRITE RESPONSE RE 129: 3024-A 3pfk 3.5 2.9 87 319 11 0 0 11 S TRANSFERASE(PHOSPHOTRANSFERASE) Phosphofructokinase ( 130: 3024-A 2i2x-B 3.5 3.4 86 258 8 0 0 12 S TRANSFERASE methyltransferase 1 (mtab) methyltransfera 131: 3024-A 1u0r-A 3.5 3.0 76 281 7 0 0 7 S SIGNALING PROTEIN, TRANSFERASE inorganic polyphosphate 132: 3024-A 1sqs-A 3.5 3.3 91 228 8 0 0 11 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION conserved hypoth 133: 3024-A 1qo0-D 3.5 3.6 83 189 13 0 0 8 S BINDING PROTEIN amic fragment amir fragment (pseudom 134: 3024-A 1qgo-A 3.5 3.3 84 257 8 0 0 10 S METAL BINDING PROTEIN anaerobic cobalamine biosyntheti 135: 3024-A 1jwq-A 3.5 3.1 87 179 8 0 0 10 S HYDROLASE n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase cwlv frag 136: 3024-A 1jeq-A 3.5 5.4 89 548 9 0 0 9 S DNA BINDING PROTEIN ku70 (homo sapiens thyroid autoan 137: 3024-A 1j9j-A 3.5 2.8 79 247 14 0 0 12 S UNKNOWN FUNCTION stationary phase survival protein ( 138: 3024-A 1ido 3.5 4.2 82 184 5 0 0 9 S CELL ADHESION PROTEIN integrin fragment (a-domain) (h 139: 3024-A 1hi9-A 3.5 3.4 84 274 8 0 0 9 S HYDROLASE (PROTEASE) dipeptide transport protein dppa 140: 3024-A 1gpm-A 3.5 3.2 82 501 13 0 0 10 S TRANSFERASE (GLUTAMINE AMIDOTRANSFERASE) gmp synthetas 141: 3024-A 1dg3-A 3.5 3.1 90 540 11 0 0 11 S SIGNALING PROTEIN interferon-induced guanylate-binding 142: 3024-A 1cr1-A 3.5 2.9 90 245 18 0 0 11 S TRANSFERASE DNA primaseHELICASE fragment (bacteriopha 143: 3024-A 1c9k-B 3.5 4.2 97 180 15 0 0 11 S TRANSFERASE adenosylcobinamide kinase (cobu) (salmone 144: 3024-A 1yzf-A 3.4 4.3 98 195 11 0 0 13 S HYDROLASE lipaseACYLHYDROLASE (enterococcus faecalis) 145: 3024-A 1ys6-A 3.4 3.1 83 225 17 0 0 9 S TRANSCRIPTION REGULATOR transcriptional regulatory pro 146: 3024-A 1w78-A 3.4 4.9 115 413 9 0 0 16 S SYNTHASE folc bifunctional protein (folylpolyglutamate 147: 3024-A 1w25-A 3.4 2.9 83 454 4 0 0 11 S RESPONSE REGULATOR stalked-cell differentiation contro 148: 3024-A 1qcz-A 3.4 3.3 81 162 7 0 0 10 S LYASE n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide mutase ( 149: 3024-A 1pj5-A 3.4 2.9 79 827 14 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE n,N-dimethylglycine oxidase (arthrobac 150: 3024-A 1moq 3.4 3.9 88 366 10 0 0 11 S GLUTAMINE AMIDOTRANSFERASE glucosamine 6-phosphate syn 151: 3024-A 1gth-A 3.4 3.5 90 1019 11 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE dihydropyrimidine dehydrogenase (dpd, d 152: 3024-A 1gdh-A 3.4 2.7 74 320 12 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE(CHOH (D)-NAD(P)+ (A)) D-glycerate dehyd 153: 3024-A 1adj-A 3.4 2.9 71 420 10 0 0 8 S COMPLEX (TRNA SYNTHETASE/PEPTIDE) histidyl-trna synthe 154: 3024-A 2fqw-A 3.3 2.8 78 316 13 0 0 11 S TRANSPORT PROTEIN membrane lipoprotein tmpc fragment ( 155: 3024-A 2b4a-A 3.3 2.9 76 116 13 0 0 9 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION bh3024 (bacillu 156: 3024-A 1wab 3.3 3.2 87 212 18 0 0 11 S PLATELET FACTOR platelet-activating factor acetylhydro 157: 3024-A 1qdl-B 3.3 3.2 82 195 10 0 0 9 S LYASE anthranilate synthase (trpe-subunit) fragment an 158: 3024-A 1jjy-A 3.3 3.8 83 633 5 0 0 10 S 159: 3024-A 1gth-D 3.3 3.2 87 1019 13 0 0 13 S OXIDOREDUCTASE dihydropyrimidine dehydrogenase (dpd, d 160: 3024-A 1gcu-A 3.3 3.2 82 292 10 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE biliverdin reductase a (rattus norveg 161: 3024-A 1g7r-A 3.3 4.0 87 559 11 0 0 11 S TRANSLATION translation initiation factor if2EIF5B fr 162: 3024-A 1f8x-A 3.3 3.0 82 156 11 0 0 11 S TRANSFERASE nucleoside 2-deoxyribosyltransferase (lac 163: 3024-A 1cnz-A 3.3 2.7 90 363 8 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE 3-isopropylmalate dehydrogenase (ipmdh, 164: 3024-A 2pth 3.2 3.8 92 193 7 0 0 12 S HYDROLASE peptidyl-trna hydrolase biological_unit (es 165: 3024-A 2fzv-A 3.2 3.1 84 235 7 0 0 9 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION putative arsenic 166: 3024-A 2d2e-A 3.2 3.3 81 239 15 0 0 9 S PROTEIN BINDING sufc protein (atp-binding protein) (t 167: 3024-A 1y8q-B 3.2 2.7 80 510 10 0 0 9 S LIGASE ubiquitin-like 1 activating enzyme e1a (sumo-1 168: 3024-A 1trk-A 3.2 3.5 86 678 9 0 0 9 S TRANSFERASE(KETONE RESIDUES) Transketolase Baker's ye 169: 3024-A 1sxg-A 3.2 3.9 78 275 13 0 0 11 S TRANSCRIPTION glucose-resistance amylase regulator (ca 170: 3024-A 1sht-X 3.2 4.5 81 177 7 0 0 10 S MEMBRANE PROTEIN anthrax toxin receptor 2 fragment (ca 171: 3024-A 1oth-A 3.2 3.0 82 321 11 0 0 10 S TRANSFERASE ornithine transcarbamoylase biological_uni 172: 3024-A 1m2e-A 3.2 3.1 78 135 15 0 0 11 S CIRCADIAN CLOCK PROTEIN kaia fragment (synechococcus 173: 3024-A 1gnd 3.2 3.0 73 430 7 0 0 9 S GTPASE ACTIVATION guanine nucleotide dissociation inhi 174: 3024-A 1fyv-A 3.2 3.4 83 161 10 0 0 12 S SIGNALING PROTEIN toll-like receptor 1 fragment (hom 175: 3024-A 1db3-A 3.2 3.8 92 335 11 0 0 13 S LYASE gdp-mannose 4,6-dehydratase (escherichia coli) 176: 3024-A 1auv-A 3.2 3.6 80 292 16 0 0 10 S SYNAPSE synapsin ia fragment (bos taurus) bovine L.E 177: 3024-A 2a3n-A 3.1 4.1 87 325 14 0 0 11 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION putative glucosa 178: 3024-A 2a0k-A 3.1 3.4 83 151 7 0 0 10 S TRANSFERASE nucleoside 2-deoxyribosyltransferase (try 179: 3024-A 1to6-A 3.1 3.0 80 371 8 0 0 10 S TRANSFERASE glycerate kinase (neisseria meningitidis 180: 3024-A 1jx2-B 3.1 3.0 88 281 17 0 0 8 S HYDROLASE myosin ii heavy chain fragment dynamin a gt 181: 3024-A 1i8t-A 3.1 3.5 80 367 16 0 0 9 S ISOMERASE udp-galactopyranose mutase (escherichia co 182: 3024-A 1h7w-A 3.1 3.7 91 1016 11 0 0 11 S ELECTRON TRANSFER dihydropyrimidine dehydrogenase (di 183: 3024-A 1h65-A 3.1 4.3 89 257 16 0 0 12 S GTPASE chloroplast outer envelope protein oep34 (toc34 184: 3024-A 1g6u-A 3.1 3.9 44 47 9 0 0 3 S DE NOVO PROTEIN domain swapped dimer N.L.Ogihara G. 185: 3024-A 1g5r-A 3.1 2.9 81 157 9 0 0 7 S TRANSFERASE cob(i)alamin adenosyltransferase (corrino 186: 3024-A 1f6d-A 3.1 2.8 74 376 14 0 0 7 S ISOMERASE udp-n-acetylglucosamine 2-epimerase (udp-gl 187: 3024-A 1ebu-A 3.1 3.1 79 358 9 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE homoserine dehydrogenase (saccharomyce 188: 3024-A 1dap-A 3.1 3.1 82 320 7 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE diaminopimelic acid dehydrogenase (dapd 189: 3024-A 1c3v-A 3.1 3.5 82 245 12 0 0 9 S OXIDOREDUCTASE dihydrodipicolinate reductase (mycobac 190: 3024-A 1b37-B 3.1 2.7 79 462 15 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE polyamine oxidase fragment (zea mays) 191: 3024-A 1atz-A 3.1 3.5 81 184 12 0 0 10 S COLLAGEN-BINDING von willebrand factor fragment (homo 192: 3024-A 8abp 3.0 3.1 83 305 8 0 0 10 S BINDING PROTEINS L-Arabinose-binding protein (mutant w 193: 3024-A 2dhq-A 3.0 3.2 82 136 9 0 0 11 S DEHYDRATASE 3-dehydroquinate dehydratase (dehydroquina 194: 3024-A 2cmd 3.0 4.7 92 312 12 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE(NAD(A)-CHOH(D)) Malate dehydrogenase ( 195: 3024-A 2aml-A 3.0 3.8 89 358 11 0 0 10 S TRANSFERASE sis domain protein (listeria monocytogene 196: 3024-A 1vpl-A 3.0 3.0 82 238 11 0 0 9 S LYASE abc transporter, atp-binding protein (thermotog 197: 3024-A 1tk9-A 3.0 3.6 84 183 10 0 0 10 S ISOMERASE phosphoheptose isomerase 1 (campylobacter j 198: 3024-A 1rlj-A 3.0 3.7 80 135 8 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION nrdi protein (b 199: 3024-A 1p2f-A 3.0 2.9 74 212 12 0 0 8 S TRANSCRIPTION response regulator (response regulator d 200: 3024-A 1gt8-B 3.0 3.3 89 1010 11 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE dihydropyrimidine dehydrogenase (dpd, d 201: 3024-A 1fsz 3.0 2.9 84 334 10 0 0 10 S CELL-DIVISION PROTEIN ftsz (sulb) (methanococcus jann 202: 3024-A 1eiw-A 3.0 2.9 74 111 9 0 0 7 S STRUCTURAL GENOMICS hypothetical protein mth538 (met 203: 3024-A 1ecl 3.0 3.3 73 552 7 0 0 7 S TOPOISOMERASE escherichia coli topoisomerase i (escher 204: 3024-A 1d2m-A 3.0 3.9 87 552 11 0 0 7 S HYDROLASE excinuclease abc subunit b (uvrb) (thermus 205: 3024-A 1chd 3.0 3.2 80 198 5 0 0 12 S CARBOXYL METHYLESTERASE cheb methylesterase (salmonel 206: 3024-A 1cg2-A 3.0 2.9 85 389 11 0 0 10 S METALLOCARBOXYPEPTIDASE carboxypeptidase g2 biological 207: 3024-A 1c3o-B 3.0 3.2 83 379 10 0 0 10 S LIGASE carbamoyl phosphate synthetase ec carbamoyl pho 208: 3024-A 1brm-A 3.0 3.0 81 356 12 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE aspartate-semialdehyde dehydrogenase (a 209: 3024-A 2o6l-A 2.9 3.1 79 155 11 0 0 11 S 210: 3024-A 2fzl-A 2.9 3.8 87 197 7 0 0 11 S DNA BINDING PROTEIN DNA repair protein rad25, xpb frag 211: 3024-A 1wdt-A 2.9 3.5 91 660 18 0 0 8 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION elongation facto 212: 3024-A 1vjg-A 2.9 4.3 96 200 10 0 0 17 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION putative lipase 213: 3024-A 1srq-A 2.9 4.3 90 330 9 0 0 12 S SIGNALING PROTEIN gtpase-activating protein 1 fragment 214: 3024-A 1req-B 2.9 3.7 87 619 7 0 0 10 S ISOMERASE methylmalonyl-coa mutase (propionibacterium 215: 3024-A 1pea 2.9 3.5 90 368 8 0 0 14 S BINDING PROTEIN amidase operon fragment (pseudomonas 216: 3024-A 1ord-A 2.9 3.1 74 730 3 0 0 8 S CARBOXY-LYASE ornithine decarboxylase (lactobacillus 217: 3024-A 1ngv-A 2.9 2.9 81 529 10 0 0 9 S 218: 3024-A 1kee-C 2.9 3.0 74 1058 5 0 0 9 S LIGASE carbamoyl-phosphate synthetase large chain (ca 219: 3024-A 1k9v-F 2.9 3.7 88 200 10 0 0 9 S TRANSFERASE amidotransferase hish (thermotoga mariti 220: 3024-A 1ivn-A 2.9 3.4 84 178 10 0 0 13 S HYDROLASE thioesterase i (acyl-coa thioesterase i, pro 221: 3024-A 1iir-A 2.9 2.8 82 382 15 0 0 10 S TRANSFERASE glycosyltransferase gtfb (udp-glycosyltra 222: 3024-A 1gaj-A 2.9 2.9 81 253 12 0 0 8 S TRANSPORT PROTEIN high-affinity branched chain amino 223: 3024-A 1esc 2.9 5.2 102 302 11 0 0 13 S HYDROLASE (SERINE ESTERASE) esterase (streptomyces sc 224: 3024-A 1em8-B 2.9 3.9 78 110 12 0 0 9 S GENE REGULATION DNA polymerase iii chi subunit fragmen 225: 3024-A 1drw 2.9 3.3 83 272 8 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE dihydrodipicolinate reductase (dhpr, da 226: 3024-A 1d7y-A 2.9 3.9 93 401 9 0 0 14 S OXIDOREDUCTASE ferredoxin reductase (pseudomonas sp. 227: 3024-A 1bkc-A 2.9 3.5 82 256 6 0 0 10 S ZN-ENDOPEPTIDASE tumor necrosis factor-alpha-convertin 228: 3024-A 1atl-A 2.9 4.1 82 200 5 0 0 10 S METALLOENDOPEPTIDASE atrolysin c (hemorrhagic toxin c, 229: 3024-A 3csu-A 2.8 3.6 79 288 5 0 0 7 S TRANSFERASE (CARBAMOYL-P, ASPARTATE) aspartate carbamo 230: 3024-A 2oyy-A 2.8 3.4 58 71 12 0 0 4 S UNKNOWN FUNCTION hexameric cytochrome (silicibacter p 231: 3024-A 2gyy-A 2.8 2.8 79 352 13 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE aspartate beta-semialdehyde dehydrogena 232: 3024-A 1yke-B 2.8 17.4 73 119 8 0 0 6 S GENE REGULATION RNA polymerase ii mediator complex pro 233: 3024-A 1xg8-A 2.8 2.8 68 108 7 0 0 7 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 234: 3024-A 1tlt-A 2.8 3.5 82 304 13 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE putative oxidoreductase (virulence fact 235: 3024-A 1tjy-A 2.8 3.3 84 316 6 0 0 10 S SIGNALING PROTEIN sugar transport protein (salmonella 236: 3024-A 1rvv-1 2.8 4.3 91 154 7 0 0 14 S RIBOFLAVIN SYNTHASE riboflavin synthase (bacillus sub 237: 3024-A 1psd-A 2.8 3.0 73 404 8 0 0 9 S OXIDOREDUCTASE (NAD(A)) D-3-phosphoglycerate dehydroge 238: 3024-A 1kzh-A 2.8 2.9 87 550 11 0 0 12 S TRANSFERASE phosphofructokinase (pyrophosphate--fructo 239: 3024-A 1kee-A 2.8 3.2 78 1058 5 0 0 10 S LIGASE carbamoyl-phosphate synthetase large chain (ca 240: 3024-A 1jw9-B 2.8 2.8 82 240 15 0 0 9 S LIGASE molybdopterin biosynthesis moeb protein molybd 241: 3024-A 1j7n-B 2.8 3.1 70 736 10 0 0 8 S TOXIN lethal factor precursor (anthrax toxin lethal f 242: 3024-A 1j6u-A 2.8 3.9 98 422 9 0 0 16 S LIGASE udp-n-acetylmuramate-alanine ligase murc (udp-n 243: 3024-A 1he2-A 2.8 3.0 82 205 9 0 0 12 S BILIVERDIN-IX BETA REDUCTASE biliverdin ix beta reduc 244: 3024-A 1gm5-A 2.8 3.4 71 729 6 0 0 9 S HELICASE recg DNA (5'-(CpApGpCpTpCpCpApTpGpApTp* cpAp 245: 3024-A 1fuk-A 2.8 3.7 85 157 7 0 0 10 S TRANSLATION eukaryotic initiation factor 4a fragment 246: 3024-A 1fmt-A 2.8 3.1 75 308 11 0 0 8 S FORMYLTRANSFERASE methionyl-trna fmet formyltransferas 247: 3024-A 1e20-A 2.8 2.8 76 185 5 0 0 9 S FLAVOPROTEIN halotolerance protein hal3 (hal3) (arab 248: 3024-A 1dik 2.8 3.2 48 869 2 0 0 5 S PHOSPHOTRANSFERASE pyruvate phosphate dikinase (ppdk) 249: 3024-A 1d4a-A 2.8 3.7 87 273 6 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE quinone reductase (dt-diaphorase) (hom 250: 3024-A 1cjc-A 2.8 3.3 91 455 13 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE adrenodoxin reductase (adr, nadph (bos 251: 3024-A 1b0u-A 2.8 3.5 81 257 17 0 0 8 S TRANSPORT PROTEIN histidine permease fragment (abc tra 252: 3024-A 2scu-A 2.7 2.7 70 286 7 0 0 9 S LIGASE succinyl-coa ligase (scs) biological_unit succi 253: 3024-A 2reb 2.7 3.4 91 303 9 0 0 11 S DNA BINDING PROTEIN Reca protein (escherichia coli) 254: 3024-A 2p2s-A 2.7 3.2 76 329 13 0 0 9 S OXIDOREDUCTASE putative oxidoreductase (erwinia carot 255: 3024-A 2i8l-A 2.7 4.0 84 156 13 0 0 10 S HYDROLASE hydrogenase 3 maturation protease (endopepti 256: 3024-A 2gn4-A 2.7 4.4 92 329 9 0 0 16 S LYASE udp-glcnac c6 dehydratase (flaa1 protein) (heli 257: 3024-A 2gar 2.7 3.4 76 188 8 0 0 9 S PURINE BIOSYNTHESIS glycinamide ribonucleotide transfo 258: 3024-A 1z7e-A 2.7 3.1 74 639 7 0 0 8 S HYDROLASE protein arna (hypothetical protein yfbg) (e 259: 3024-A 1y8q-A 2.7 2.9 80 313 10 0 0 9 S LIGASE ubiquitin-like 1 activating enzyme e1a (sumo-1 260: 3024-A 1xel 2.7 4.3 90 338 14 0 0 13 S ISOMERASE udp-galactose 4-epimerase (escherichia coli 261: 3024-A 1thx 2.7 2.7 65 108 9 0 0 8 S ELECTRON TRANSPORT thioredoxin (thioredoxin 2) (anaba 262: 3024-A 1qv9-A 2.7 2.7 85 266 12 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE f420-dependent methylenetetrahydrometha 263: 3024-A 1qpz-A 2.7 3.6 78 339 17 0 0 11 S TRANSCRIPTION/DNA purine nucleotide synthesis represso 264: 3024-A 1qp8-A 2.7 2.9 69 301 13 0 0 9 S OXIDOREDUCTASE formate dehydrogenase biological_unit 265: 3024-A 1lu9-A 2.7 3.2 72 287 8 0 0 7 S OXIDOREDUCTASE methylene tetrahydromethanopterin dehyd 266: 3024-A 1fcd-A 2.7 3.5 95 401 14 0 0 14 S ELECTRON TRANSPORT(FLAVOCYTOCHROME) Flavocytochrome c 267: 3024-A 1enp 2.7 4.0 102 297 13 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE enoyl acyl carrier protein reductase Mu 268: 3024-A 1byk-A 2.7 3.6 82 255 7 0 0 12 S GENE REGULATION trehalose operon repressor fragment ( 269: 3024-A 1auo-A 2.7 2.8 82 218 9 0 0 11 S HYDROLASE carboxylesterase biological_unit (pseudomon 270: 3024-A 1ati-A 2.7 3.6 70 437 13 0 0 10 S PROTEIN BIOSYNTHESIS glycyl-trna synthetase (glycine-t 271: 3024-A 2liv 2.6 2.9 85 344 7 0 0 9 S PERIPLASMIC BINDING PROTEIN Leucine/Isoleucine/Valine- 272: 3024-A 2chu-A 2.6 2.8 73 283 7 0 0 11 S BINDING PROTEIN enterochelin uptake periplasmic bindin 273: 3024-A 2bon-A 2.6 3.2 74 287 9 0 0 10 S TRANSFERASE lipid kinase expression_system_vector (es 274: 3024-A 1y0r-A 2.6 3.0 82 333 11 0 0 10 S HYDROLASE frv operon protein frvx (pyrococcus horikos 275: 3024-A 1ufo-A 2.6 3.1 80 234 8 0 0 10 S HYDROLASE hypothetical protein tt1662 (thermus thermo 276: 3024-A 1toa-A 2.6 2.9 84 277 14 0 0 10 S BINDING PROTEIN periplasmic binding protein troa fragm 277: 3024-A 1pbe 2.6 2.8 79 391 9 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE P-hydroxybenzoate hydroxylase (phbh) co 278: 3024-A 1n0v-C 2.6 3.6 91 825 13 0 0 8 S TRANSLATION elongation factor 2 (ef-2) (saccharomyces 279: 3024-A 1knx-A 2.6 3.3 72 303 19 0 0 6 S TRANSFERASE/HYDROLASE probable hpr(ser) kinasePHOSPHAT 280: 3024-A 1khb-A 2.6 4.0 82 603 11 0 0 11 S LYASE phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic (g 281: 3024-A 1jvn-A 2.6 3.5 80 537 9 0 0 8 S TRANSFERASE bifunctional histidine biosynthesis prote 282: 3024-A 1jeq-B 2.6 3.9 83 520 5 0 0 12 S DNA BINDING PROTEIN ku70 (homo sapiens thyroid autoan 283: 3024-A 1jb1-A 2.6 3.3 72 161 18 0 0 6 S TRANSFERASE/HYDROLASE hprk protein fragment (lactoba 284: 3024-A 1i6w-A 2.6 3.2 79 179 9 0 0 11 S HYDROLASE lipase a (bacillus subtilis) bacteria expr 285: 3024-A 1gte-D 2.6 3.5 90 1014 10 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE dihydropyrimidine dehydrogenase (dpd, d 286: 3024-A 1dss-G 2.6 3.2 77 333 9 0 0 11 S ACTIVE-SITE CARBOXYMETHYLATION d-glyceraldehyde-3-phos 287: 3024-A 1ceq-A 2.6 5.7 55 304 7 0 0 5 S OXIDOREDUCTASE l-lactate dehydrogenase (plasmodium fa 288: 3024-A 1bxk-A 2.6 4.1 93 341 9 0 0 14 S LYASE dtdp-glucose 4,6-dehydratase (escherichia coli) 289: 3024-A 1a4i-A 2.6 3.3 87 285 8 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE methylenetetrahydrofolate dehydrogenase 290: 3024-A 2g1u-A 2.5 3.8 67 135 12 0 0 7 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 291: 3024-A 2e0k-A 2.5 3.6 83 241 8 0 0 13 S TRANSFERASE precorrin-2 c20-methyltransferase (chloro 292: 3024-A 2dbc-A 2.5 3.4 73 135 12 0 0 8 S SIGNALING PROTEIN unnamed protein product fragment (pd 293: 3024-A 2am7-A 2.5 3.1 83 489 5 0 0 12 S 294: 3024-A 2ahy-A 2.5 3.5 49 104 12 0 0 3 S TRANSPORT PROTEIN potassium channel protein (bacillus 295: 3024-A 1vsr-A 2.5 4.9 83 134 7 0 0 10 S HYDROLASE vsr endonuclease fragment (patch repair prot 296: 3024-A 1tik-A 2.5 5.1 97 201 5 0 0 9 S HYDROLASE acyl carrier protein phosphodiesterase (acp 297: 3024-A 1tf7-A 2.5 3.2 90 484 14 0 0 12 S CIRCADIAN CLOCK PROTEIN kaic (synechococcus sp.) expr 298: 3024-A 1t0b-A 2.5 3.4 85 240 11 0 0 8 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION thua-like protei 299: 3024-A 1sxj-A 2.5 3.0 79 441 13 0 0 8 S REPLICATION activator 1 95 kda subunit (replication fa 300: 3024-A 1sky-E 2.5 4.8 108 470 15 0 0 11 S ATP SYNTHASE f1-atpase (f1-atp synthase) (bacillus ps 301: 3024-A 1r72-A 2.5 3.1 69 205 13 0 0 10 S 302: 3024-A 1n2z-A 2.5 3.5 77 245 12 0 0 8 S TRANSPORT PROTEIN vitamin b12 transport protein btuf 303: 3024-A 1mug-A 2.5 3.4 81 165 9 0 0 14 S HYDROLASE g:tU SPECIFIC DNA GLYCOSYLASE (escherichia 304: 3024-A 1lvl 2.5 3.2 76 458 7 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE Dihydrolipoamide dehydrogenase complex 305: 3024-A 1k3f-A 2.5 6.6 95 253 7 0 0 12 S TRANSFERASE uridine phosphorylase (upase, udrpase) ( 306: 3024-A 1jr2-A 2.5 3.5 71 260 10 0 0 9 S LYASE uroporphyrinogen-iii synthase (uro'gen iii synt 307: 3024-A 1gc5-A 2.5 3.9 96 467 7 0 0 11 S TRANSFERASE adp-dependent glucokinase (thermococcus 308: 3024-A 1g2i-A 2.5 3.0 78 166 13 0 0 10 S HYDROLASE protease i (pyrococcus horikoshii) archaea 309: 3024-A 1fno-A 2.5 2.9 85 408 15 0 0 8 S HYDROLASE peptidase t (aminotripeptidase, tripeptidase 310: 3024-A 1fjh-B 2.5 4.1 100 236 8 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE 3alpha-hydroxysteroid dehydrogenaseCARB 311: 3024-A 1ff9-A 2.5 2.7 78 447 12 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE saccharopine reductase (magnaporthe g 312: 3024-A 1efd-N 2.5 2.5 75 262 11 0 0 9 S METAL TRANSPORT ferrichrome-binding periplasmic protei 313: 3024-A 1e1d-A 2.5 3.5 45 553 4 0 0 3 S HYBRID CLUSTER hybrid cluster protein (prismane protei 314: 3024-A 1deo-A 2.5 3.8 92 233 13 0 0 16 S HYDROLASE rhamnogalacturonan acetylesterase (aspergil 315: 3024-A 1b78-A 2.5 4.1 71 184 8 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS pyrophosphatase (methanococcus ja 316: 3024-A 2glx-A 2.4 3.5 82 332 10 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE 1,5-anhydro-d-fructose reductase (1,5-a 317: 3024-A 2fa8-A 2.4 2.2 55 85 9 0 0 7 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 318: 3024-A 2f9i-B 2.4 4.9 114 260 8 0 0 11 S TRANSFERASE acetyl-coenzyme a carboxylase carboxyl tra 319: 3024-A 2eyq-A 2.4 3.3 71 1146 6 0 0 9 S HYDROLASE transcription-repair coupling factor (trcf) 320: 3024-A 2a9v-A 2.4 3.4 81 197 5 0 0 10 S LIGASE gmp synthase (glutamine amidotransferase) (the 321: 3024-A 1z3e-A 2.4 3.1 52 119 6 0 0 6 S TRANSCRIPTION regulatory protein spx fragment DNA-dire 322: 3024-A 1vl6-A 2.4 3.1 77 371 5 0 0 13 S OXIDOREDUCTASE malate oxidoreductase (thermotoga mari 323: 3024-A 1vhv-A 2.4 3.6 88 245 6 0 0 11 S TRANSFERASE diphthine synthase (diphthamide biosynthes 324: 3024-A 1t4y-A 2.4 3.4 68 105 13 0 0 7 S TRANSFERASE adaptive-response sensory-kinase sasa frag 325: 3024-A 1s7o-A 2.4 3.7 50 106 4 0 0 5 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical upf 326: 3024-A 1ox2-A 2.4 3.1 65 105 6 0 0 6 S 327: 3024-A 1ofg-A 2.4 3.6 85 381 5 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE glucose-fructose oxidoreductase (zymom 328: 3024-A 1ngv-B 2.4 2.5 79 398 8 0 0 9 S 329: 3024-A 1mh9-A 2.4 2.9 75 194 8 0 0 11 S HYDROLASE deoxyribonucleotidase (mitochondrial 5'(3')- 330: 3024-A 1lvk 2.4 3.3 63 743 17 0 0 6 S CONTRACTILE PROTEIN myosin fragment Mutant (dictyoste 331: 3024-A 1l7v-C 2.4 3.1 78 231 18 0 0 8 S TRANSPORT PROTEIN/HYDROLASE vitamin b12 transport syst 332: 3024-A 1kee-G 2.4 3.3 79 1058 6 0 0 10 S LIGASE carbamoyl-phosphate synthetase large chain (ca 333: 3024-A 1kee-E 2.4 3.1 74 1058 7 0 0 10 S LIGASE carbamoyl-phosphate synthetase large chain (ca 334: 3024-A 1k34-A 2.4 6.8 51 60 4 0 0 3 S VIRUS/VIRAL PROTEIN transmembrane glycoprotein gp41 f 335: 3024-A 1jx6-A 2.4 3.1 86 338 5 0 0 11 S SIGNALING PROTEIN luxp protein (vibrio harveyi) bact 336: 3024-A 1i5p-A 2.4 3.9 42 625 5 0 0 2 S TOXIN pesticidial crystal protein cry2aa (bacillus t 337: 3024-A 1h75-A 2.4 3.3 56 76 7 0 0 8 S ELECTRON TRANSPORT glutaredoxin-like protein nrdh (e 338: 3024-A 1g8m-A 2.4 3.7 85 590 14 0 0 10 S TRANSFERASE, HYDROLASE aicar transformylase-imp cyclo 339: 3024-A 1f37-A 2.4 2.8 59 109 10 0 0 6 S ELECTRON TRANSPORT ferredoxin [2fe-2s] (aquifex aeoli 340: 3024-A 1ewk-A 2.4 3.4 88 448 7 0 0 8 S SIGNALING PROTEIN metabotropic glutamate receptor sub 341: 3024-A 1e4f-T 2.4 2.9 58 378 10 0 0 6 S BACTERIAL CELL DIVISION cell division protein ftsa ( 342: 3024-A 1d3y-A 2.4 3.4 78 289 13 0 0 12 S ISOMERASE DNA topoisomerase vi a subunit fragment Muta 343: 3024-A 1bs9 2.4 3.2 78 207 12 0 0 12 S SERINE HYDROLASE acetyl xylan esterase (penicillium p 344: 3024-A 1bdb 2.4 3.7 103 267 10 0 0 13 S OXIDOREDUCTASE cis-biphenyl-2,3-dihydrodiol-2,3-dehydr 345: 3024-A 1aqt 2.4 6.2 45 135 7 0 0 3 S HYDROLASE atp synthase fragment Mutant (escherichia c 346: 3024-A 2pgi 2.3 3.7 90 442 11 0 0 11 S ISOMERASE phosphoglucose isomerase (glucose-6-phosphat 347: 3024-A 2dst-A 2.3 3.0 67 122 6 0 0 9 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 348: 3024-A 1ybv-A 2.3 4.2 104 270 5 0 0 14 S OXIDOREDUCTASE trihydroxynaphthalene reductase (naphth 349: 3024-A 1xq6-A 2.3 2.8 81 253 11 0 0 12 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION unknown protein 350: 3024-A 1xea-A 2.3 3.5 78 304 12 0 0 16 S OXIDOREDUCTASE oxidoreductase, gfoIDHmoca family (gfoI 351: 3024-A 1wjk-A 2.3 3.2 64 100 13 0 0 9 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION c330018d20rik pr 352: 3024-A 1ve6-A 2.3 4.1 109 574 7 0 0 14 S HYDROLASE acylamino-acid-releasing enzyme (aare, acyl- 353: 3024-A 1ttz-A 2.3 3.4 59 74 7 0 0 7 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION conserved hypoth 354: 3024-A 1tc1-A 2.3 2.7 68 175 21 0 0 10 S TRANSFERASE hypoxanthine phosphoribosyltransferase bio 355: 3024-A 1rsg-A 2.3 3.1 79 470 11 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE fms1 protein (saccharomyces cerevisiae 356: 3024-A 1qs0-B 2.3 3.3 81 338 14 0 0 13 S OXIDOREDUCTASE 2-oxoisovalerate dehydrogenase alpha-su 357: 3024-A 1qfm-A 2.3 3.8 110 710 4 0 0 12 S HYDROLASE prolyl oligopeptidase (prolyl endopeptidase, 358: 3024-A 1ps1-A 2.3 7.0 53 304 4 0 0 4 S ANTIBIOTIC BIOSYNTHESIS pentalenene synthase biologica 359: 3024-A 1nui-A 2.3 3.2 73 242 7 0 0 8 S REPLICATION DNA primaseHELICASE fragment Mutant (bact 360: 3024-A 1msl-A 2.3 3.6 53 109 8 0 0 4 S 361: 3024-A 1l8q-A 2.3 3.9 85 317 9 0 0 8 S DNA BINDING PROTEIN chromosomal replication initiator 362: 3024-A 1kzy-C 2.3 2.9 68 232 12 0 0 9 S DNA BINDING PROTEIN, PROTEIN BINDING cellular tumor an 363: 3024-A 1id1-A 2.3 2.9 66 153 9 0 0 9 S MEMBRANE PROTEIN putative potassium channel protein f 364: 3024-A 1hfc 2.3 3.7 77 157 8 0 0 10 S METALLOPROTEASE Fibroblast collagenase Human (homo sa 365: 3024-A 1fez-A 2.3 2.8 71 256 4 0 0 11 S HYDROLASE phosphonoacetaldehyde hydrolase (bacillus c 366: 3024-A 1f5s-A 2.3 2.9 73 210 5 0 0 10 S HYDROLASE phosphoserine phosphatase (psp) (methanoco 367: 3024-A 1ee9-A 2.3 3.6 87 317 8 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE 5,10-methylenetetrahydrofolate dehydro 368: 3024-A 1dz3-A 2.3 3.2 68 123 13 0 0 12 S RESPONSE REGULATOR stage 0 sporulation protein a fragm 369: 3024-A 1be3-H 2.3 3.5 49 64 2 0 0 3 S ELECTRON TRANSPORT cytochrome bc1 complex (ubiquinol c 370: 3024-A 1b3q-A 2.3 6.5 50 368 8 0 0 3 S TRANSFERASE chemotaxis protein chea fragment Mutant ( 371: 3024-A 1a3c 2.3 3.4 63 166 11 0 0 10 S TRANSCRIPTION REGULATION pyrimidine operon regulatory 372: 3024-A 3ldh 2.2 5.1 93 329 9 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE, CHOH DONOR, NAD ACCEPTR Lactate dehydr 373: 3024-A 2nzw-A 2.2 5.0 86 349 5 0 0 10 S TRANSFERASE alpha1,3-fucosyltransferase fragment (hel 374: 3024-A 2h94-A 2.2 3.1 78 647 9 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE lysine-specific histone demethylase 1 ( 375: 3024-A 2g0u-A 2.2 2.9 53 92 8 0 0 4 S UNKNOWN FUNCTION type iii secretion system needle prot 376: 3024-A 1z6n-A 2.2 3.3 74 166 8 0 0 8 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 377: 3024-A 1y7p-A 2.2 3.5 82 212 12 0 0 11 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION hypothetical pro 378: 3024-A 1xmb-A 2.2 3.5 90 375 7 0 0 9 S HYDROLASE iaa-amino acid hydrolase homolog 2 (arabido 379: 3024-A 1w99-A 2.2 6.3 45 558 4 0 0 3 S TOXIN pesticidial crystal protein cry4ba (delta-endoto 380: 3024-A 1vhq-A 2.2 4.6 83 209 12 0 0 12 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION enhancing lycope 381: 3024-A 1v95-A 2.2 2.9 64 130 9 0 0 7 S RNA BINDING PROTEIN nuclear receptor coactivator 5 fra 382: 3024-A 1rli-A 2.2 3.8 81 156 10 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS, PROTEIN BINDING trp repressor bin 383: 3024-A 1rkd 2.2 2.7 77 306 13 0 0 8 S CARBOHYDRATE KINASE ribokinase biological_unit (esche 384: 3024-A 1qr6-A 2.2 3.3 83 551 2 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE malic enzyme 2 Mutant (homo sapiens) h 385: 3024-A 1qlw-A 2.2 4.0 114 318 7 0 0 18 S HYDROLASE(CARBOXYLIC ESTERASE) esterase (alcaligenes 386: 3024-A 1kuh 2.2 2.8 68 132 7 0 0 8 S HYDROLASE zinc protease (neutral protease) (streptomy 387: 3024-A 1kf6-C 2.2 11.0 61 130 2 0 0 7 S OXIDOREDUCTASE fumarate reductase flavoprotein fumarat 388: 3024-A 1k75-A 2.2 3.0 76 431 13 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE l-histidinol dehydrogenase fragment ( 389: 3024-A 1k5h-A 2.2 3.4 43 398 9 0 0 4 S OXIDOREDUCTASE 1-deoxy-d-xylulose-5-phosphate reducto 390: 3024-A 1jqj-C 2.2 3.9 84 328 10 0 0 9 S TRANSFERASE DNA polymerase iii, beta chain Mutant DNA 391: 3024-A 1jpx-A 2.2 2.9 40 59 5 0 0 2 S VIRUS/VIRAL PROTEIN gp41 envelope protein fragment (en 392: 3024-A 1jmk-C 2.2 3.1 82 222 4 0 0 10 S HYDROLASE surfactin synthetase fragment (srfte) (bac 393: 3024-A 1ibj-A 2.2 3.5 75 380 8 0 0 11 S LYASE cystathionine beta-lyase (cbl) (arabidopsis th 394: 3024-A 1hyh-A 2.2 3.5 82 297 17 0 0 8 S OXIDOREDUCTASE (CHOH(D)-NAD+(A)) l-2-hydroxyisocaproat 395: 3024-A 1hv8-A 2.2 3.8 85 363 6 0 0 9 S RNA BINDING PROTEIN putative atp-dependent RNA helica 396: 3024-A 1hry-A 2.2 3.9 50 73 10 0 0 3 S COMPLEX (DNA-BINDING PROTEIN/DNA) human sry DNA (homo 397: 3024-A 1gyz-A 2.2 2.4 43 60 9 0 0 3 S RIBOSOMAL PROTEIN 50s ribosomal protein l20 fragment 398: 3024-A 1g4y-B 2.2 6.4 49 81 6 0 0 3 S SIGNALING PROTEIN calcium-activated potassium channel 399: 3024-A 1faf-A 2.2 5.1 53 79 11 0 0 3 S VIRUS/VIRAL PROTEIN large t antigen fragment (murine 400: 3024-A 1ex2-A 2.2 3.5 65 185 11 0 0 9 S STRUCTURAL GENOMICS protein maf (bacillus subtilis) b 401: 3024-A 1ecp-A 2.2 4.0 87 237 7 0 0 12 S PENTOSYLTRANSFERASE purine nucleoside phosphorylase ( 402: 3024-A 1do0-A 2.2 3.8 97 406 14 0 0 10 S CHAPERONE heat shock locus u (escherichia coli) bacte 403: 3024-A 1dd9-A 2.2 3.5 73 310 10 0 0 10 S TRANSFERASE DNA primase fragment (dnag) (escherichia 404: 3024-A 1d3v-A 2.2 2.8 85 308 8 0 0 11 S HYDROLASE arginase (rattus norvegicus) rat expression 405: 3024-A 1crz-A 2.2 2.5 64 403 19 0 0 6 S TOXIN BINDING PROTEIN tolb protein (escherichia coli 406: 3024-A 1bpw-A 2.2 3.1 77 502 12 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE aldehyde dehydrogenase (aldh) (gadus c 407: 3024-A 1bmd-A 2.2 4.6 96 327 5 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE(CHOH(D)-NAD+(A)) Malate dehydrogenase ( 408: 3024-A 1ble 2.2 4.0 91 161 8 0 0 15 S PHOSPHOTRANSFERASE fructose permease (fructose transpo 409: 3024-A 1b7g-O 2.2 3.2 84 340 12 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenas 410: 3024-A 2scu-B 2.1 3.4 73 385 11 0 0 8 S LIGASE succinyl-coa ligase (scs) biological_unit succi 411: 3024-A 2oer-A 2.1 2.7 44 178 9 0 0 4 S TRANSCRIPTION probable transcriptional regulator (pse 412: 3024-A 2o09-A 2.1 3.0 47 182 11 0 0 5 S SIGNALING PROTEIN alr2278 protein (anabaena sp.) bact 413: 3024-A 2iak-A 2.1 3.6 38 197 13 0 0 3 S CELL ADHESION bullous pemphigoid antigen 1, isoform 5 414: 3024-A 2gfh-A 2.1 3.8 84 246 10 0 0 11 S HYDROLASE haloacid dehalogenase-like hydrolase domain 415: 3024-A 2g31-A 2.1 6.7 48 60 4 0 0 3 S SIGNALING PROTEIN reticulon-4 fragment (nogo_a, neurit 416: 3024-A 2e0g-A 2.1 7.6 63 107 6 0 0 7 S 417: 3024-A 2bhr-A 2.1 3.4 78 431 12 0 0 12 S HELICASE RNA helicase fragment expression_system_ (de 418: 3024-A 2aop 2.1 3.3 70 456 11 0 0 9 S OXIDOREDUCTASE sulfite reductase hemoprotein (sirhp) b 419: 3024-A 1ytf-D 2.1 3.9 44 100 5 0 0 3 S COMPLEX (TRANSCRIPTION REGULATION/DNA) yeast tata-box 420: 3024-A 1w4x-A 2.1 3.1 83 533 8 0 0 12 S OXYGENASE phenylacetone monooxygenase (thermobifida f 421: 3024-A 1sig 2.1 3.6 45 305 0 0 0 4 S TRANSCRIPTION REGULATION RNA polymerase primary sigma 422: 3024-A 1r1d-A 2.1 3.6 96 234 6 0 0 14 S HYDROLASE carboxylesterase (bacillus stearothermophil 423: 3024-A 1q3k-A 2.1 2.7 82 259 6 0 0 11 S HYDROLASE creatininase fragment (creatinine amidohydro 424: 3024-A 1p3y-1 2.1 3.4 71 171 11 0 0 10 S OXIDOREDUCTASE mrsd protein (bacillus sp. hil-y855472 425: 3024-A 1nhp 2.1 3.9 89 447 9 0 0 13 S OXIDOREDUCTASE (H2O2(A)) Nadh peroxidase (npx) mutant 426: 3024-A 1lnz-A 2.1 4.4 91 332 10 0 0 10 S CELL CYCLE spo0b-associated gtp-binding protein fragme 427: 3024-A 1lam 2.1 4.9 91 484 9 0 0 12 S HYDROLASE (ALPHA-AMINOACYLPEPTIDE) leucine aminopeptid 428: 3024-A 1jb0-A 2.1 7.9 55 740 9 0 0 5 S PHOTOSYNTHESIS photosystem i p700 chlorophyll a apopr 429: 3024-A 1jad-A 2.1 4.4 53 242 13 0 0 3 S HYDROLASE phospholipase c beta fragment (plc-beta) Mu 430: 3024-A 1iso 2.1 4.0 88 413 7 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE isocitrate dehydrogenase (oxalosuccinat 431: 3024-A 1i4d-A 2.1 6.1 49 188 0 0 0 3 S SIGNALING PROTEIN arfaptin 2 fragment (partner of rac 432: 3024-A 1gnw-A 2.1 3.5 62 210 8 0 0 7 S TRANSFERASE glutathione s-transferase biological_unit 433: 3024-A 1g5q-A 2.1 3.4 72 174 10 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE epidermin modifying enzyme epid Mutant 434: 3024-A 1g5a-A 2.1 6.6 49 628 0 0 0 3 S TRANSFERASE amylosucrase (neisseria polysaccharea) e 435: 3024-A 1ekj-B 2.1 3.7 72 213 7 0 0 10 S LYASE beta-carbonic anhydrase (pisum sativum) pea M. 436: 3024-A 1dku-A 2.1 3.3 83 295 5 0 0 11 S TRANSFERASE phosphoribosyl pyrophosphate synthetase (r 437: 3024-A 1b9y-C 2.1 3.5 69 167 14 0 0 8 S SIGNALING PROTEIN transducin fragment (gt beta) transd 438: 3024-A 1aye 2.1 3.2 86 401 5 0 0 11 S SERINE PROTEASE procarboxypeptidase a2 (pcpa2) biologi 439: 3024-A 2ixa-A 2.0 2.5 79 426 6 0 0 10 S HYDROLASE alpha-n-acetylgalactosaminidase expression_ 440: 3024-A 2ho3-A 2.0 3.8 81 302 7 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE oxidoreductase, gfoIDHmoca family (str 441: 3024-A 2hcv-A 2.0 3.9 82 421 11 0 0 8 S ISOMERASE, METAL-BINDING PROTEIN l-rhamnose isomerase 442: 3024-A 2gul-A 2.0 3.0 64 345 11 0 0 8 S 443: 3024-A 2g0i-A 2.0 3.2 50 106 0 0 0 5 S UNKNOWN FUNCTION hypothetical protein smu.848 (strept 444: 3024-A 1zh8-A 2.0 3.6 83 319 18 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE oxidoreductase (thermotoga maritima ms 445: 3024-A 1w44-A 2.0 3.7 89 304 15 0 0 11 S HYDROLASE ntpase p4 (p4 packaging atpase from bacterio 446: 3024-A 1vi1-A 2.0 2.6 76 315 7 0 0 10 S STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION fatty acidPHOSPH 447: 3024-A 1t8r-A 2.0 6.1 93 459 5 0 0 14 S HYDROLASE amp nucleosidase (escherichia coli) bacteri 448: 3024-A 1qyc-A 2.0 3.4 74 307 15 0 0 11 S PLANT PROTEIN phenylcoumaran benzylic ether reductase 449: 3024-A 1qrv-B 2.0 3.2 51 71 10 0 0 4 S GENE REGULATION/DNA DNA (5'-d(GpCpGpApTpApTpCpGpC)-3' 450: 3024-A 1n57-A 2.0 3.6 91 272 12 0 0 12 S CHAPERONE chaperone hsp31 (protein yedu) (escherichia 451: 3024-A 1ks9-A 2.0 3.2 68 291 10 0 0 9 S OXIDOREDUCTASE 2-dehydropantoate 2-reductase (ketopan 452: 3024-A 1kdg-A 2.0 2.7 76 541 13 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE cellobiose dehydrogenase fragment (cdh) 453: 3024-A 1juv-A 2.0 5.2 97 193 6 0 0 15 S OXIDOREDUCTASE dihydrofolate reductase (dhfr) (bacter 454: 3024-A 1jkf-A 2.0 3.2 83 466 10 0 0 10 S ISOMERASE myo-inositol-1-phosphate synthase (saccharo 455: 3024-A 1hei-A 2.0 3.4 79 443 14 0 0 9 S HELICASE hcv helicase (hepatitis c virus (isolate 1)) 456: 3024-A 1g55-A 2.0 3.1 75 313 8 0 0 9 S TRANSFERASE DNA cytosine methyltransferase dnmt2 Mutan 457: 3024-A 1d8b-A 2.0 4.0 53 81 8 0 0 5 S DNA BINDING PROTEIN sgs1 recq helicase fragment (sacc 458: 3024-A 1chu-A 2.0 2.4 82 478 10 0 0 13 S FLAVOENZYME l-aspartate oxidase biological_unit (esch 459: 3024-A 1bsv-A 2.0 4.1 85 317 7 0 0 11 S OXIDOREDUCTASE gdp-fucose synthetase (wcag, gdp-4-keto 460: 3024-A 1auq 2.0 3.2 76 208 7 0 0 10 S WILLEBRAND a1 domain of von willebrand factor fragment 461: 3024-A 1aoe-A 2.0 5.1 93 192 11 0 0 12 S OXIDOREDUCTASE dihydrofolate reductase (dhfr) biologic ## ALIGNMENTS 1 - 30 SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : 1 16 A A 0 0 0 1 A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 17 A L + 0 0 0 1 L . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 18 A Y - 0 0 0 1 Y . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 19 A Q - 0 0 0 1 Q . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 20 A I - 0 0 0 1 I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 21 A Q - 0 0 0 2 Q . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 22 A L E -A 13 0A 0 2 Le . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 23 A L E +A 12 0A 0 2 Le . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 24 A K 0 0 0 2 K . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 25 A D 0 0 0 1 D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 43 A Q 0 0 0 1 Q . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 44 A R E -A 8 0A 0 1 Re . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 45 A I E > -A 7 0A 0 1 Ie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 46 A L T 3 S+ 0 0 0 1 Lt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 47 A G T 3 S+ 0 0 0 1 Gt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 48 A N S < S- 0 0 0 2 Ns . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 49 A L - 0 0 0 2 L . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 50 A L + 0 0 0 3 L . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 51 A Q S S- 0 0 0 3 Qs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 52 A P - 0 0 0 2 P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 53 A P - 0 0 0 2 P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 54 A N - 0 0 0 1 N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 55 A E - 0 0 0 1 E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 56 A R > + 0 0 0 3 R . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 57 A P T 3 S+ 0 0 0 5 Pt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 58 A E T 3 S+ 0 0 0 5 Et . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 59 A L S < S- 0 0 0 6 Ls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28 60 A P > - 0 0 0 7 P . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 61 A S T 3 S+ 0 0 0 12 St . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . M . . . . . . N 30 62 A G T 3 S+ 0 0 0 183 Gt M . Ks . . R . . . Dt . G . . C . R I . . . A I . Ss . . Kt Ys 31 63 A L < - 0 0 0 308 L T P Gs . P S T M . Hs S P . . P M G As K . G S P G Ms Le . Hs R 32 64 A Y E -b 139 0B 0 376 Ye Ye Le I M Fe K E Ke M He R Re R K Te Ke K P Ke M Le Me Ye Ce R Le M P Ve 33 65 A V E -b 140 0B 0 403 Ve Ie Ve Ne Ne Le Ye P Ie Ke Ie P Re Me N Le Le Le Ve Ie Le Te Ie Ie Te P Re Me Ie Ce 34 66 A L E -bc 141 158B 0 404 Le Ve Ve Ie Le Ie Ie Ie Ge Ie Ye Ie Le Ie Ie Ie Ie Ie Ie Ie Ie Ie Ve Ie Ve Ve Ve Ce Ie Ve 35 67 A G E -bc 142 159B 0 405 Ge Ge Fe Le Ve Ge Ve Fe Ie Ae Ve Ve Se Ie Ve Ve Fe Le Te Le Ae We Ve Se We Ve Ye We Se Ie 36 68 A L E +bc 143 160B 0 404 Le Le Ve Ie Le Ve Ie Me Ve Ie Le Ie Ie Le Fe Me Le Ie Ie Te Ie Le Fe Ie Le Le Ie Ie Ve Le 37 69 A T E + c 0 161B 0 402 Te Te Le Te Me Se Ee Ve Te Fe Me Se Ee Ne Ie Ve Se Ee De Ie Ee Te Ve Ae Te Ve D Ae Te Ve 38 70 A G E - c 0 162B 0 376 Ge G G G G G Ge G Ge G G G Ge G G G G Ge G G G Gs G Ge G G Gs Se Gs G 39 71 A I > - 0 0 0 296 I Gs G Ts Ls Gs Ls A I T Vs P N G F L V L P C Vs L T S Ls Ps Ps Y . S 40 72 A S T 3 S+ 0 0 0 268 St It Pt Pt Pt Tt Et Rt Pt Vt St St It St . 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It E Lh Vh Ph Vg Nh 194 226 A G H > S+ 0 0 0 311 Gh Qh . Ct . Lg Rh Eh Ih Yh . Lh Hh Yt Lh . . Fh . . Gh . . Lg . Ah Yh Ih . . 195 227 A Q H > S+ 0 0 0 327 Qh Qh Kh . Kt Pg Ah Ah Nh Eh . Ah Eh . Sh . . Mh . R Ah . Fh . . Qh Gh Rh . . 196 228 A Q H > S+ 0 0 0 343 Qh Eh Ph Ih Ph . Rh Lh Fh Eh Q Yh Ah Vt Kh E . Kh L Et Vh . Fh Pg . Cs Lh Sh Pg . 197 229 A L H >< S+ 0 0 0 344 Lh Rh Ih Ch Lh Tg Yh Yh Ah Fh E Ah Wh Vt Yh S P Lh V Yt Yh A Ah Tg K P Lh Wh Qg . 198 230 A V H >< S+ 0 0 0 339 Vh Lh Ih Eh Vh Kg Lh Qh Rh Yh P Et Lh Ht Eh L I Lh P Lt Ah P Lh Rg P Pg Ah Tt Fg . 199 231 A E H 3< S+ 0 0 0 337 Eh Kh Dh Eh Dh Kg Eh Dh Yh Kh G Gt It Et Qh D R Dh A Gt Eh As Lh Eg Es Eg Nh Dt Sg Dt 200 232 A Q T << S+ 0 0 0 286 Qt Wh Lh Eh Fh Yg Lh Vh Ah . . A . E Kh . Dt . At . Lh Ns Ih Rg As Lg . St Qt Nt 201 233 A S < - 0 0 0 163 S A Yh Ah Yh A Ah A Ah . . Hs . Y A . Gt . Dt . Ah P Dh As P F . . T Ie 202 234 A N S S+ 0 0 0 395 Ns Ds Ve Ve Le Ds Ie Hs Ve Fe Ve Ds Ve Ds Ns Ye D Ie A . 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Rh . . . . . . . . . . . . Kh . . . . . . . . . . . . 25 57 A P T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . Kh . . . . . . . . . . . . Eh . . . . . . . . . . . . 26 58 A E T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . Lh . . . . . . . . . . . . Rh . . . . . . . . . . . . 27 59 A L S < S- 0 0 0 6 . . . . Lh . . . . . . . . . . . . Lh . . . . . . . . . . . . 28 60 A P > - 0 0 0 7 . . . . Nh . . . . . . . . . . . . Gt . . . . . . . . . . . . 29 61 A S T 3 S+ 0 0 0 12 . . . . Ht . . . . . . . . S . . . Kt . . . . . . . . . . . . 30 62 A G T 3 S+ 0 0 0 183 . Ds M Ss Gt Ft T . R Ys Cs . Dt H . . Rg I Ks . P K P . P Te R . Ks . 31 63 A L < - 0 0 0 308 . Rs I P V A T M Pt A P V Rt V S . 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Rh ## ALIGNMENTS 181 - 210 SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : 1 16 A A 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 17 A L + 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 18 A Y - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 19 A Q - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 20 A I - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 21 A Q - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 22 A L E -A 13 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 23 A L E +A 12 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 24 A K 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 25 A D 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 43 A Q 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 44 A R E -A 8 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 45 A I E > -A 7 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 46 A L T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 47 A G T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 48 A N S < S- 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ye 17 49 A L - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Te 18 50 A L + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ie 19 51 A Q S S- 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ke 20 52 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 53 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 54 A N - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 55 A E - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 56 A R > + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 57 A P T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 58 A E T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 59 A L S < S- 0 0 0 6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28 60 A P > - 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 61 A S T 3 S+ 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Gt . 30 62 A G T 3 S+ 0 0 0 183 . . N . . Dt Ks T . . Q . . . G . Kt As . . Ks A . Rt Ss . . . Et . 31 63 A L < - 0 0 0 308 . Sg Se . G Ks Ve N . . P N . . A Gt Gt M . 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P . . . 101 133 A S H 3< S+ 0 0 0 43 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Eh . . . 102 134 A R H << S+ 0 0 0 46 . . . . . . . Lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dh . . . 103 135 A V H >< S+ 0 0 0 44 . . . . . . . S . . . . . . . . . . . . . . . . . . Vh . . . 104 136 A F T 3< S+ 0 0 0 40 . . . . . . . D . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kh . . . 105 137 A G T 3 S+ 0 0 0 35 . . . . . . . Ss . . . . . . . . . . . . . . . . . . At . . . 106 138 A N <> - 0 0 0 31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ns . . . 107 139 A K H > S+ 0 0 0 36 . . . . . . . Vh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108 140 A K H > S+ 0 0 0 40 . . . . . . . Eh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 141 A Q H > S+ 0 0 0 50 . . . . . . . Ah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 142 A M H X S+ 0 0 0 60 . . . . . . . Rh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111 143 A K H X S+ 0 0 0 63 . . . . . . . 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R ## ALIGNMENTS 271 - 300 SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : 1 16 A A 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 17 A L + 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 18 A Y - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 19 A Q - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 20 A I - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 21 A Q - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 22 A L E -A 13 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 23 A L E +A 12 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 24 A K 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 25 A D 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 43 A Q 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 44 A R E -A 8 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 45 A I E > -A 7 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 46 A L T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 47 A G T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 48 A N S < S- 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 49 A L - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 50 A L + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 51 A Q S S- 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 52 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 53 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 54 A N - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 55 A E - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 56 A R > + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 57 A P T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 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P . . ## ALIGNMENTS 301 - 330 SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : 1 16 A A 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 17 A L + 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 18 A Y - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 19 A Q - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 20 A I - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 21 A Q - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 22 A L E -A 13 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 23 A L E +A 12 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 24 A K 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 25 A D 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 43 A Q 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 44 A R E -A 8 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 45 A I E > -A 7 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 46 A L T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 47 A G T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 48 A N S < S- 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 49 A L - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 50 A L + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 51 A Q S S- 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 52 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 53 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 54 A N - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 55 A E - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 56 A R > + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 57 A P T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 58 A E T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 59 A L S < S- 0 0 0 6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28 60 A P > - 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 61 A S T 3 S+ 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 62 A G T 3 S+ 0 0 0 183 Rs . 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At . . . . ## ALIGNMENTS 391 - 420 SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : . . . . : 1 16 A A 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 17 A L + 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 18 A Y - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 19 A Q - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 20 A I - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 21 A Q - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 22 A L E -A 13 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 23 A L E +A 12 0A 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 24 A K 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 25 A D 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 43 A Q 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 44 A R E -A 8 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 45 A I E > -A 7 0A 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 46 A L T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 47 A G T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 48 A N S < S- 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 49 A L - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 50 A L + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 51 A Q S S- 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 52 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 53 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 54 A N - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 55 A E - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 56 A R > + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 57 A P T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 58 A E T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 59 A L S < S- 0 0 0 6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28 60 A P > - 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 61 A S T 3 S+ 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 62 A G T 3 S+ 0 0 0 183 . . Nt . . . . . . M . T P K . . A M . . . . . . . . . . . . 31 63 A L < - 0 0 0 308 . Es Gt A Et . . . . T . P Ns P . . P Ne M Ds . . . . . . Ks N . . 32 64 A Y E -b 139 0B 0 376 . Qe E R F . . . . K Ve K R Ie Re Gs Ve Ie Ve G . . . . . . Gs D . . 33 65 A V E -b 140 0B 0 403 . Ie Ee Ke Y . . . . P Ve N Le Ee Pe Ve Re Ve Ne Ns . . . . . . K M . De 34 66 A L E -bc 141 158B 0 404 . Ie Ie Ie Ge . . . . Le Le Ie Le Ie Ie Ce Ve Le Ve Ie . . . . . . Te Nb . Ve 35 67 A G E -bc 142 159B 0 405 . Fe Ve Ge Le . . . . Ie Me Le Ve Ie Ge Ae Ae Ae Ae Ge . . . . . . Ve R . Le 36 68 A L E +bc 143 160B 0 404 . Ae Ae Ie Ve . . . . Le Pe Me Ve Ge Ve Ge Ve Re Ve Ce . . . . . . We V . Ve 37 69 A T E + c 0 161B 0 402 . Fe Ge Ie Fe . . . . A Gs Ie Es A V Ie Ts Ie Ne Me . . . . . . Fe Le . Ve 38 70 A G E - c 0 162B 0 376 . P . G C . . . . . . G . P P L . De G Ve . . . . . . V Ce . G 39 71 A I > - 0 0 0 296 . P . . Ks . . . . . . P . F . A . . . Ns . . . . . . Ps T . . 40 72 A S T 3 S+ 0 0 0 268 . Vt . . 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A ## ALIGNMENTS 451 - 461 SeqNo PDBNo AA STRUCTURE BP1 BP2 ACC OCC . . . . : . . . . : . 1 16 A A 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 2 17 A L + 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 3 18 A Y - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 4 19 A Q - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 5 20 A I - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 6 21 A Q - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . 7 22 A L E -A 13 0A 0 2 . . . . . . . . . . . 8 23 A L E +A 12 0A 0 2 . . . . . . . . . . . 9 24 A K 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . 10 25 A D 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 11 43 A Q 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 12 44 A R E -A 8 0A 0 1 . . . . . . . . . . . 13 45 A I E > -A 7 0A 0 1 . . . . . . . . . . . 14 46 A L T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 15 47 A G T 3 S+ 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 16 48 A N S < S- 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . 17 49 A L - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . 18 50 A L + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . 19 51 A Q S S- 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . 20 52 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . 21 53 A P - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . 22 54 A N - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 23 55 A E - 0 0 0 1 . . . . . . . . . . . 24 56 A R > + 0 0 0 3 . . . . . . . . . . . 25 57 A P T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . 26 58 A E T 3 S+ 0 0 0 5 . . . . . . . . . . . 27 59 A L S < S- 0 0 0 6 . . . . . . . . . . . 28 60 A P > - 0 0 0 7 . . . . . . . . . . . 29 61 A S T 3 S+ 0 0 0 12 . . . . . . . . . . . 30 62 A G T 3 S+ 0 0 0 183 . . . Es . E . . . . Ks 31 63 A L < - 0 0 0 308 . . . Ks Gs P . . K . P 32 64 A Y E -b 139 0B 0 376 M . M Le Gs Le . . Qe Le N 33 65 A V E -b 140 0B 0 403 Ke De Ie Ge Re Re . Ds Re De Ve 34 66 A L E -bc 141 158B 0 404 Ie Ye Ke Ie He Ve . Ve Ve Le Ae 35 67 A G E -bc 142 159B 0 405 Te Ie Le Me Le Le . Le Fe Ve Ie 36 68 A L E +bc 143 160B 0 404 Ve Ie Ve Le Ie Ee . Ie Ie Fe Ie 37 69 A T E + c 0 161B 0 402 Le Ve Fe Ie Fe Le . Ie Ae Le Ve 38 70 A G E - c 0 162B 0 376 G G Re Gt C Yt . . Gt Le Ae 39 71 A I > - 0 0 0 296 . . Ye . Hs . . . . De Ae 40 72 A S T 3 S+ 0 0 0 268 . . . . Ss . . . . G . 41 73 A G T 3 S+ 0 0 0 261 Gs . . . Kh . . . Gs Sb . 42 74 A S S < S- 0 0 0 233 Ah . . . Kh . . . Mh . . 43 75 A G >> + 0 0 0 336 Lh . . . Kh Gt . . Vh . . 44 76 A K H 3> + 0 0 0 374 Gh Gh . Gt Ch Vt . G Gh . . 45 77 A S H 3> S+ 0 0 0 407 Qh Ih Lh Gs Dh G . S Sh Kh Ih 46 78 A S H <> S+ 0 0 0 412 Lh Ih Qh Nh Eh Gh . Gs Ah Ah Rh 47 79 A V H X S+ 0 0 0 409 Wh Ah Nh Nh Lh Mh . 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Pg . . . 174 206 A V H X S+ 0 0 0 57 . . . . . . . . . . . 175 207 A E H < S+ 0 0 0 4 . . . . . . . . . . . 176 208 A R H < S+ 0 0 0 4 . . . . . . . . . . . 177 209 A D H < S- 0 0 0 4 . . . . . . . . . . . 178 210 A G < + 0 0 0 4 . . . . . . . . . . . 179 211 A L - 0 0 0 2 . . . . . . . . . . . 180 212 A S > - 0 0 0 61 . . . . . . . . Ah . Pg 181 213 A E H > S+ 0 0 0 67 . . . . . . . . Nh . Eg 182 214 A A H > S+ 0 0 0 68 . . . . . . . . Nh . Sg 183 215 A A H > S+ 0 0 0 71 . . . . . . . . Th . Is 184 216 A A H X S+ 0 0 0 75 . . N . . . . . Ys . . 185 217 A Q H X S+ 0 0 0 76 . . S . . . . . Ph . E 186 218 A S H X S+ 0 0 0 76 . . Ts . . . . . Ah . M 187 219 A R H < S+ 0 0 0 72 . . Ve . . . . . . . D 188 220 A L H >< S+ 0 0 0 74 . . . . . . . . . . Te 189 221 A Q H 3< S+ 0 0 0 71 . . . . . . . . . . . 190 222 A S T 3< S+ 0 0 0 71 . . Qe . . . . . . . . 191 223 A Q S < S- 0 0 0 80 . . Le . . . . . . . . 192 224 A M - 0 0 0 126 . . D A . N . . . . . 193 225 A S > - 0 0 0 274 Qg . Ah Ph Q Sh . . Qh . . 194 226 A G H > S+ 0 0 0 311 Vh . . Sh Db Fh . . Nh . . 195 227 A Q H > S+ 0 0 0 327 Sh Sh Sh Th Ah Lh . Ih Mh . . 196 228 A Q H > S+ 0 0 0 343 Dh Rh Fh Ih Vh Hh . Ah Mh . F 197 229 A L H >< S+ 0 0 0 344 Ah Ih Lh Fh Sh Ih . Mh Ih . P 198 230 A V H >< S+ 0 0 0 339 Vh Lh Dh Ah Rh Lh . Ah Eh . Lg 199 231 A E H 3< S+ 0 0 0 337 Kh Fh Dh Ah Th Dh . Wh Sh . Eg 200 232 A Q T << S+ 0 0 0 286 Sh . Ih Ah Qh . . . Nh . . 201 233 A S < - 0 0 0 163 . . . . Rh . . . Ih . . 202 234 A N S S+ 0 0 0 395 Ie Le . Ye Ye Ie . Le Le Ve . 203 235 A V E S-e 160 0B 0 388 Le Fe . Ie Re Le . Ye Le Ie . 204 236 A V E +e 161 0B 0 386 Le Ie . Ne Fe Le . Ae Fe Pe . 205 237 A L E -e 162 0B 0 382 Ie V . G Vs Ee . I Le Ve . 206 238 A S E -e 163 0B 0 361 H Ds Te Ss A Ne . Gg G Ge . 207 239 A T + 0 0 0 303 . Ag He . . . . Eg . Ie . 208 240 A L S S+ 0 0 0 282 . Gg We . . . . . . Gs . 209 241 A W S S- 0 0 0 255 Te . Ye . . . . . T Ss . 210 242 A E >> - 0 0 0 247 . Lh . G . R . Sh He Eg P 211 243 A S H 3> S+ 0 0 0 266 . Mh . D . L . Lh Vh Lh Kh 212 244 A H H 3> S+ 0 0 0 282 G Sh . E . . . Lh Dh Eh Sh 213 245 A V H <> S+ 0 0 0 317 I Ah . Dt . N . Eh Dh Qh Eh 214 246 A T H X S+ 0 0 0 334 Te Ah . Sh . Vh . Ch Mh Qh Lh 215 247 A Q H X S+ 0 0 0 341 He Eh . Lh . Hh . Lh Ah Rh Qh 216 248 A S H X S+ 0 0 0 350 . Qh . Lh . Vh . Vh Ah Dh Kh 217 249 A Q H X S+ 0 0 0 370 . Ah . Ah . Vh . Yh Sh Eh Fh 218 250 A V H X S+ 0 0 0 368 . Ah . Th . Ah . Gh Ih Ih Vh 219 251 A E H X S+ 0 0 0 369 Ah Ah . Ph . Kh . Wh Hh Vh Gt 220 252 A K H X S+ 0 0 0 370 Dh Kh . Lh . Lh . Sh Vh Sh Dt 221 253 A A H X S+ 0 0 0 368 Ih Ih . Ih . Ih . Ah Mh Yh . 222 254 A W H X S+ 0 0 0 366 Lh Lh . Ih . Kh . Ah Eh Lh . 223 255 A N H X S+ 0 0 0 361 Qh Ah . Dh . Ih . Eh Ls ah . 224 256 A L H X S+ 0 0 0 351 . Ls . Lh . Lh . Dh . Dh . 225 257 A L H >X S+ 0 0 0 333 . . . Lh . Yh . Ih . Lh . 226 258 A Q H >< S+ 0 0 0 319 . At . Vh . E . Th . As . 227 259 A K H 3< S+ 0 0 0 302 . Gt . Mh . . . Rh . P . 228 260 A R H << S+ 0 0 0 240 . G . Th . . . Rh . . . 229 261 A L << 0 0 0 180 . P . Eh . . . M . . . 230 262 A P 0 0 0 172 . . . Fh . . . . . E . ## EQUIVALENCES: ranges of aligned residues NR. STRID1 STRID2 STRID1 <=> STRID2 STRID1 <=> STRID2 1: 3024-A 2f6r-A 1 - 230 <=> 1 - 230 (ALA A 16 - PRO A 262 <=> ALA A 16 - PRO A 262) 2: 3024-A 1jjv-A 30 - 87 <=> 1 - 58 (GLY A 62 - ILE A 119 <=> MET A 1 - ILE A 58) 2: 3024-A 1jjv-A 94 - 133 <=> 59 - 98 (ILE A 126 - VAL A 165 <=> LEU A 65 - THR A 104) 2: 3024-A 1jjv-A 137 - 174 <=> 99 - 136 (LYS A 169 - VAL A 206 <=> ALA A 105 - ALA A 142) 2: 3024-A 1jjv-A 180 - 209 <=> 137 - 166 (SER A 212 - TRP A 241 <=> ASN A 148 - ALA A 177) 2: 3024-A 1jjv-A 210 - 230 <=> 171 - 191 (GLU A 242 - PRO A 262 <=> ASN A 182 - GLU A 202) 3: 3024-A 1tev-A 31 - 54 <=> 1 - 24 (LEU A 63 - LEU A 86 <=> PRO A 3 - LYS A 26) 3: 3024-A 1tev-A 55 - 72 <=> 26 - 43 (GLY A 87 - GLY A 104 <=> GLY A 28 - PRO A 45) 3: 3024-A 1tev-A 73 - 83 <=> 48 - 58 (GLY A 105 - PHE A 115 <=> GLY A 50 - GLY A 60) 3: 3024-A 1tev-A 112 - 115 <=> 59 - 62 (ILE A 144 - ASP A 147 <=> LYS A 61 - PRO A 64) 3: 3024-A 1tev-A 118 - 133 <=> 63 - 78 (TRP A 150 - VAL A 165 <=> VAL A 65 - MET A 80) 3: 3024-A 1tev-A 137 - 144 <=> 84 - 91 (LYS A 169 - ALA A 176 <=> LYS A 86 - GLY A 93) 3: 3024-A 1tev-A 146 - 153 <=> 92 - 99 (MET A 178 - GLN A 185 <=> PHE A 94 - LEU A 101) 3: 3024-A 1tev-A 156 - 174 <=> 112 - 130 (VAL A 188 - VAL A 206 <=> VAL A 114 - LEU A 132) 3: 3024-A 1tev-A 180 - 193 <=> 142 - 155 (SER A 212 - SER A 225 <=> ASN A 144 - GLN A 157) 3: 3024-A 1tev-A 195 - 201 <=> 158 - 164 (GLN A 227 - SER A 233 <=> LYS A 160 - TYR A 166) 3: 3024-A 1tev-A 202 - 226 <=> 170 - 194 (ASN A 234 - GLN A 258 <=> VAL A 172 - GLY A 196) 4: 3024-A 1y63-A 30 - 55 <=> 4 - 29 (GLY A 62 - GLY A 87 <=> LYS A 9 - LEU A 34) 4: 3024-A 1y63-A 56 - 69 <=> 32 - 45 (ALA A 88 - TYR A 101 <=> PHE A 37 - HIS A 50) 4: 3024-A 1y63-A 113 - 133 <=> 53 - 73 (LEU A 145 - VAL A 165 <=> ILE A 64 - GLY A 84) 4: 3024-A 1y63-A 139 - 148 <=> 74 - 83 (LEU A 171 - LEU A 180 <=> ASN A 85 - GLU A 94) 4: 3024-A 1y63-A 151 - 154 <=> 84 - 87 (GLY A 183 - SER A 186 <=> LEU A 95 - GLU A 98) 4: 3024-A 1y63-A 155 - 174 <=> 89 - 108 (MET A 187 - VAL A 206 <=> TRP A 100 - THR A 119) 4: 3024-A 1y63-A 180 - 194 <=> 113 - 127 (SER A 212 - GLY A 226 <=> SER A 124 - CYS A 138) 4: 3024-A 1y63-A 196 - 201 <=> 128 - 133 (GLN A 228 - SER A 233 <=> ILE A 139 - ALA A 144) 4: 3024-A 1y63-A 202 - 209 <=> 142 - 149 (ASN A 234 - TRP A 241 <=> VAL A 153 - THR A 160) 4: 3024-A 1y63-A 211 - 229 <=> 150 - 168 (SER A 243 - LEU A 261 <=> LEU A 161 - LYS A 179) 5: 3024-A 1zin 32 - 54 <=> 1 - 23 (TYR A 64 - LEU A 86 <=> MET 1 - ALA 23) 5: 3024-A 1zin 55 - 77 <=> 25 - 47 (GLY A 87 - GLN A 109 <=> GLY 25 - LEU 47) 5: 3024-A 1zin 117 - 131 <=> 60 - 74 (VAL A 149 - VAL A 163 <=> PRO 60 - LYS 74) 5: 3024-A 1zin 132 - 133 <=> 76 - 77 (ALA A 164 - VAL A 165 <=> ASP 76 - CYS 77) 5: 3024-A 1zin 137 - 144 <=> 78 - 85 (LYS A 169 - ALA A 176 <=> GLN 78 - GLY 85) 5: 3024-A 1zin 146 - 150 <=> 86 - 90 (MET A 178 - ALA A 182 <=> PHE 86 - VAL 90) 5: 3024-A 1zin 151 - 155 <=> 92 - 96 (GLY A 183 - MET A 187 <=> GLN 92 - LEU 96) 5: 3024-A 1zin 156 - 174 <=> 107 - 125 (VAL A 188 - VAL A 206 <=> LEU 107 - THR 125) 5: 3024-A 1zin 180 - 193 <=> 164 - 177 (SER A 212 - SER A 225 <=> ASN 164 - LYS 177) 5: 3024-A 1zin 195 - 201 <=> 180 - 186 (GLN A 227 - SER A 233 <=> LYS 180 - TYR 186) 5: 3024-A 1zin 202 - 227 <=> 192 - 217 (ASN A 234 - LYS A 259 <=> LEU 192 - ARG 217) 6: 3024-A 1xrj-A 31 - 55 <=> 1 - 25 (LEU A 63 - GLY A 87 <=> PRO A 20 - LEU A 44) 6: 3024-A 1xrj-A 56 - 66 <=> 37 - 47 (ALA A 88 - HIS A 98 <=> VAL A 56 - ARG A 66) 6: 3024-A 1xrj-A 96 - 105 <=> 49 - 58 (ARG A 128 - GLY A 137 <=> LEU A 68 - LEU A 77) 6: 3024-A 1xrj-A 117 - 131 <=> 71 - 85 (VAL A 149 - VAL A 163 <=> ASP A 90 - GLY A 104) 6: 3024-A 1xrj-A 132 - 133 <=> 108 - 109 (ALA A 164 - VAL A 165 <=> TYR A 127 - PRO A 128) 6: 3024-A 1xrj-A 137 - 151 <=> 110 - 124 (LYS A 169 - GLY A 183 <=> ALA A 129 - GLN A 143) 6: 3024-A 1xrj-A 152 - 174 <=> 126 - 148 (TRP A 184 - VAL A 206 <=> VAL A 145 - VAL A 167) 6: 3024-A 1xrj-A 180 - 185 <=> 162 - 167 (SER A 212 - GLN A 217 <=> ILE A 181 - ILE A 186) 6: 3024-A 1xrj-A 186 - 191 <=> 169 - 174 (SER A 218 - GLN A 223 <=> PHE A 188 - PHE A 193) 6: 3024-A 1xrj-A 192 - 195 <=> 177 - 180 (MET A 224 - GLN A 227 <=> PHE A 196 - PRO A 199) 6: 3024-A 1xrj-A 197 - 207 <=> 181 - 191 (LEU A 229 - THR A 239 <=> THR A 200 - ARG A 210) 6: 3024-A 1xrj-A 213 - 230 <=> 194 - 211 (VAL A 245 - PRO A 262 <=> ASP A 213 - ASN A 230) 7: 3024-A 5tmp-A 30 - 55 <=> 1 - 26 (GLY A 62 - GLY A 87 <=> ARG A 2 - LEU A 27) 7: 3024-A 5tmp-A 57 - 64 <=> 35 - 42 (TYR A 89 - LEU A 96 <=> VAL A 36 - GLY A 43) 7: 3024-A 5tmp-A 65 - 70 <=> 46 - 51 (GLY A 97 - ALA A 102 <=> ALA A 47 - SER A 52) 7: 3024-A 5tmp-A 96 - 104 <=> 55 - 63 (ARG A 128 - PHE A 136 <=> ASP A 56 - VAL A 64) 7: 3024-A 5tmp-A 109 - 127 <=> 64 - 82 (GLN A 141 - GLU A 159 <=> ILE A 65 - GLU A 83) 7: 3024-A 5tmp-A 128 - 132 <=> 84 - 88 (GLU A 160 - ALA A 164 <=> VAL A 85 - ALA A 89) 7: 3024-A 5tmp-A 133 - 133 <=> 91 - 91 (VAL A 165 - VAL A 165 <=> ASN A 92 - ASN A 92) 7: 3024-A 5tmp-A 137 - 144 <=> 92 - 99 (LYS A 169 - ALA A 176 <=> GLY A 93 - ARG A 100) 7: 3024-A 5tmp-A 147 - 151 <=> 101 - 105 (LEU A 179 - GLY A 183 <=> ASP A 102 - GLN A 106) 7: 3024-A 5tmp-A 154 - 174 <=> 130 - 150 (SER A 186 - VAL A 206 <=> PHE A 131 - ARG A 151) 7: 3024-A 5tmp-A 184 - 191 <=> 159 - 166 (ALA A 216 - GLN A 223 <=> GLU A 160 - PHE A 167) 7: 3024-A 5tmp-A 192 - 201 <=> 168 - 177 (MET A 224 - SER A 233 <=> ARG A 169 - ALA A 178) 7: 3024-A 5tmp-A 202 - 229 <=> 183 - 210 (ASN A 234 - LEU A 261 <=> ILE A 184 - LEU A 211) 8: 3024-A 1shk-A 31 - 54 <=> 2 - 25 (LEU A 63 - LEU A 86 <=> THR A 2 - ALA A 25) 8: 3024-A 1shk-A 55 - 70 <=> 27 - 42 (GLY A 87 - ALA A 102 <=> GLY A 27 - GLY A 42) 8: 3024-A 1shk-A 110 - 130 <=> 50 - 70 (MET A 142 - ASP A 162 <=> ALA A 50 - THR A 70) 8: 3024-A 1shk-A 138 - 145 <=> 71 - 78 (THR A 170 - ALA A 177 <=> PRO A 71 - GLY A 78) 8: 3024-A 1shk-A 146 - 151 <=> 80 - 85 (MET A 178 - GLY A 183 <=> GLY A 80 - GLU A 85) 8: 3024-A 1shk-A 152 - 156 <=> 87 - 91 (TRP A 184 - VAL A 188 <=> ASN A 87 - MET A 91) 8: 3024-A 1shk-A 157 - 174 <=> 95 - 112 (HIS A 189 - VAL A 206 <=> GLY A 95 - 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161 (MET A 224 - SER A 233 <=> GLU A 152 - ALA A 161) 9: 3024-A 1nks-A 202 - 209 <=> 172 - 179 (ASN A 234 - TRP A 241 <=> VAL A 172 - GLU A 179) 9: 3024-A 1nks-A 214 - 226 <=> 182 - 194 (THR A 246 - GLN A 258 <=> PRO A 182 - LYS A 194) 10: 3024-A 2jaq-A 32 - 55 <=> 1 - 24 (TYR A 64 - GLY A 87 <=> MET A 1 - LEU A 24) 10: 3024-A 2jaq-A 56 - 60 <=> 26 - 30 (ALA A 88 - ASP A 92 <=> TYR A 26 - LYS A 30) 10: 3024-A 2jaq-A 139 - 144 <=> 67 - 72 (LEU A 171 - ALA A 176 <=> ASN A 73 - ARG A 78) 10: 3024-A 2jaq-A 147 - 150 <=> 73 - 76 (LEU A 179 - ALA A 182 <=> THR A 79 - GLU A 82) 10: 3024-A 2jaq-A 154 - 178 <=> 111 - 135 (SER A 186 - GLY A 210 <=> LEU A 123 - ARG A 147) 10: 3024-A 2jaq-A 179 - 183 <=> 138 - 142 (LEU A 211 - ALA A 215 <=> GLU A 150 - GLY A 154) 10: 3024-A 2jaq-A 185 - 191 <=> 143 - 149 (GLN A 217 - GLN A 223 <=> GLU A 155 - LEU A 161) 10: 3024-A 2jaq-A 192 - 199 <=> 151 - 158 (MET A 224 - GLU A 231 <=> LYS A 163 - LYS A 170) 10: 3024-A 2jaq-A 202 - 209 <=> 166 - 173 (ASN A 234 - 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ARG A 36) 459: 3024-A 1bsv-A 151 - 154 <=> 47 - 50 (GLY A 183 - SER A 186 <=> ASP A 49 - ALA A 52) 459: 3024-A 1bsv-A 155 - 167 <=> 53 - 65 (MET A 187 - THR A 199 <=> ARG A 55 - GLY A 67) 459: 3024-A 1bsv-A 180 - 186 <=> 69 - 75 (SER A 212 - SER A 218 <=> ALA A 71 - ALA A 77) 459: 3024-A 1bsv-A 193 - 201 <=> 80 - 88 (SER A 225 - SER A 233 <=> GLN A 82 - ILE A 90) 459: 3024-A 1bsv-A 202 - 206 <=> 100 - 104 (ASN A 234 - SER A 238 <=> LEU A 102 - GLY A 106) 459: 3024-A 1bsv-A 209 - 209 <=> 162 - 162 (TRP A 241 - TRP A 241 <=> THR A 164 - THR A 164) 459: 3024-A 1bsv-A 210 - 214 <=> 211 - 215 (GLU A 242 - THR A 246 <=> HIS A 213 - MET A 217) 459: 3024-A 1bsv-A 215 - 223 <=> 217 - 225 (GLN A 247 - ASN A 255 <=> ALA A 219 - LEU A 227) 460: 3024-A 1auq 32 - 41 <=> 16 - 25 (TYR A 64 - GLY A 73 <=> LEU 513 - SER 522) 460: 3024-A 1auq 45 - 57 <=> 37 - 49 (SER A 77 - TYR A 89 <=> LYS 534 - ILE 546) 460: 3024-A 1auq 132 - 133 <=> 50 - 51 (ALA A 164 - VAL A 165 <=> SER 547 - GLN 548) 460: 3024-A 1auq 137 - 146 <=> 52 - 61 (LYS A 169 - MET A 178 <=> LYS 549 - TYR 558) 460: 3024-A 1auq 151 - 154 <=> 102 - 105 (GLY A 183 - SER A 186 <=> LYS 599 - LEU 602) 460: 3024-A 1auq 158 - 167 <=> 120 - 129 (GLU A 190 - THR A 199 <=> ILE 617 - GLU 626) 460: 3024-A 1auq 202 - 208 <=> 151 - 157 (ASN A 234 - LEU A 240 <=> VAL 648 - GLY 654) 460: 3024-A 1auq 209 - 209 <=> 181 - 181 (TRP A 241 - TRP A 241 <=> SER 678 - SER 678) 460: 3024-A 1auq 210 - 227 <=> 185 - 202 (GLU A 242 - LYS A 259 <=> GLU 682 - PRO 699) 460: 3024-A 1auq 230 - 230 <=> 203 - 203 (PRO A 262 - PRO A 262 <=> GLU 700 - GLU 700) 461: 3024-A 1aoe-A 30 - 39 <=> 3 - 12 (GLY A 62 - ILE A 71 <=> LYS A 3 - ALA A 12) 461: 3024-A 1aoe-A 45 - 54 <=> 33 - 42 (SER A 77 - LEU A 86 <=> ILE A 33 - ARG A 42) 461: 3024-A 1aoe-A 55 - 62 <=> 49 - 56 (GLY A 87 - ASP A 94 <=> ARG A 49 - ARG A 56) 461: 3024-A 1aoe-A 64 - 68 <=> 77 - 81 (LEU A 96 - ALA A 100 <=> LEU A 77 - TYR A 81) 461: 3024-A 1aoe-A 123 - 133 <=> 94 - 104 (LYS A 155 - VAL A 165 <=> SER A 94 - SER A 104) 461: 3024-A 1aoe-A 137 - 146 <=> 106 - 115 (LYS A 169 - MET A 178 <=> VAL A 106 - ALA A 115) 461: 3024-A 1aoe-A 150 - 155 <=> 119 - 124 (ALA A 182 - MET A 187 <=> ASN A 119 - ASN A 124) 461: 3024-A 1aoe-A 156 - 165 <=> 127 - 136 (VAL A 188 - PRO A 197 <=> VAL A 127 - GLU A 136) 461: 3024-A 1aoe-A 180 - 183 <=> 140 - 143 (SER A 212 - ALA A 215 <=> PRO A 140 - ILE A 143) 461: 3024-A 1aoe-A 185 - 188 <=> 144 - 147 (GLN A 217 - LEU A 220 <=> GLU A 144 - THR A 147) 461: 3024-A 1aoe-A 196 - 199 <=> 151 - 154 (GLN A 228 - GLU A 231 <=> PHE A 151 - GLU A 154) 461: 3024-A 1aoe-A 210 - 220 <=> 160 - 170 (GLU A 242 - LYS A 252 <=> PRO A 160 - ASP A 170) ## MATRICES: UX+T is the least-squares superimposition of STRID2 (X) onto STRID1 NR. STRID1 STRID2 U(.,1) U(.,2) U(.,3) T(.) 1: 3024-A 2f6r-A U(1,.) 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1: 3024-A 2f6r-A U(2,.) 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1: 3024-A 2f6r-A U(3,.) 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 2: 3024-A 1jjv-A U(1,.) 0.540030 0.777135 0.323155 -38.742294 2: 3024-A 1jjv-A U(2,.) 0.826916 -0.418393 -0.375708 28.850235 2: 3024-A 1jjv-A U(3,.) -0.156770 0.470116 -0.868570 21.678026 3: 3024-A 1tev-A U(1,.) 0.796657 -0.589095 -0.135297 -22.189432 3: 3024-A 1tev-A U(2,.) 0.604201 0.769961 0.205186 -19.958143 3: 3024-A 1tev-A U(3,.) -0.016701 -0.245209 0.969326 16.695333 4: 3024-A 1y63-A U(1,.) -0.448750 -0.884002 -0.131010 20.861639 4: 3024-A 1y63-A U(2,.) -0.854810 0.381852 0.351410 47.092335 4: 3024-A 1y63-A U(3,.) -0.260621 0.269684 -0.927010 46.047501 5: 3024-A 1zin U(1,.) -0.467055 -0.865705 -0.180040 17.973295 5: 3024-A 1zin U(2,.) 0.767139 -0.295464 -0.569384 10.373318 5: 3024-A 1zin U(3,.) 0.439723 -0.404049 0.802115 8.199607 6: 3024-A 1xrj-A U(1,.) -0.911801 -0.166060 0.375558 24.253094 6: 3024-A 1xrj-A U(2,.) -0.240770 0.957074 -0.161366 -41.027565 6: 3024-A 1xrj-A U(3,.) -0.332641 -0.237556 -0.912643 76.835823 7: 3024-A 5tmp-A U(1,.) -0.171662 0.303731 -0.937166 -15.409366 7: 3024-A 5tmp-A U(2,.) 0.959659 -0.163470 -0.228762 25.315947 7: 3024-A 5tmp-A U(3,.) -0.222681 -0.938629 -0.263417 134.853622 8: 3024-A 1shk-A U(1,.) 0.135236 0.409060 0.902431 -15.028948 8: 3024-A 1shk-A U(2,.) 0.989685 -0.099215 -0.103339 -14.041327 8: 3024-A 1shk-A U(3,.) 0.047263 0.907098 -0.418258 -4.348755 9: 3024-A 1nks-A U(1,.) 0.079886 -0.177494 0.980874 -132.070480 9: 3024-A 1nks-A U(2,.) 0.746498 -0.641450 -0.176871 63.428864 9: 3024-A 1nks-A U(3,.) 0.660575 0.746350 0.081256 -43.621918 10: 3024-A 2jaq-A U(1,.) -0.758241 0.409770 -0.507108 -30.654154 10: 3024-A 2jaq-A U(2,.) -0.651883 -0.489515 0.579158 15.533786 10: 3024-A 2jaq-A U(3,.) -0.010915 0.769717 0.638292 43.942009 11: 3024-A 1knq-A U(1,.) -0.234930 0.215717 -0.947773 38.270386 11: 3024-A 1knq-A U(2,.) 0.895084 -0.332167 -0.297472 22.722252 11: 3024-A 1knq-A U(3,.) -0.378989 -0.918222 -0.115048 74.355499 12: 3024-A 1gky U(1,.) -0.916979 0.238254 -0.319977 36.232849 12: 3024-A 1gky U(2,.) -0.313012 -0.926960 0.206805 58.975018 12: 3024-A 1gky U(3,.) -0.247333 0.289793 0.924579 -39.478764 13: 3024-A 1jag-A U(1,.) 0.710693 0.192092 0.676769 -61.648289 13: 3024-A 1jag-A U(2,.) -0.628670 -0.258337 0.733509 71.524864 13: 3024-A 1jag-A U(3,.) 0.315736 -0.946764 -0.062835 126.418098 14: 3024-A 1qhs-A U(1,.) -0.815450 -0.464819 0.344941 17.318701 14: 3024-A 1qhs-A U(2,.) 0.453049 -0.141637 0.880162 -3.499479 14: 3024-A 1qhs-A U(3,.) -0.360259 0.874004 0.326084 -22.832409 15: 3024-A 1via-A U(1,.) -0.620050 0.776019 -0.115466 7.246464 15: 3024-A 1via-A U(2,.) 0.481569 0.492632 0.724849 -3.244440 15: 3024-A 1via-A U(3,.) 0.619379 0.393837 -0.679163 -17.899683 16: 3024-A 1bif U(1,.) -0.664279 -0.707817 -0.240269 86.880898 16: 3024-A 1bif U(2,.) -0.619881 0.701270 -0.352092 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U(3,.) 0.358393 -0.391026 0.847734 10.408005 ## FOOTER References: L. Holm and C. Sander (1996) Mapping the protein universe. Science 273:595-602. Parameters elastic similarity score, threshold 0.20; sequential alignment The following notation is used for data columns: STRID1/STRID2 PDB identifiers of search structure and aligned structure with chain identifier Z Z-score, i.e., strength of structural similarity in standard deviations above expexted. The matched structures are sorted by Z-score. Only matches above a threshold of Z=2 are reported. RMSD positional root mean square deviation of superimposed CA atoms in Angstroms LALI total number of equivalenced residues LSEQ2 length of the entire chain of the equivalenced structure %IDE percentage of sequence identity over equivalenced positions REVERS number of fragments matching in reversed chain direction PERMUT number of topological permutations (loop reconnections between query and matched structure) NFRAG total number of equivalenced fragments TOPO 'S' sequential connectivity of equivalenced fragments 'N' non-sequential alignment PROTEIN COMPND record from the PDB file of the aligned structure SeqNo, PDBNo, AA, STRUCTURE, BP1, BP2, ACC sequential and PDB residue numbers, amino acid (lower case = Cys),secondary structure, solvent exposure as in DSSP (Kabsch and Sander, Biopolymers 22, 2577-2637, 1983). The alignments block shows the amino acid sequence and DSSP code (in lower case) of the equivalenced fragments. OCC number of equivalences spanning this position STRID1 <=> STRID2 sequential residue numbers of equivalenced fragments (PDB residue numbers in parentheses); any topological permutations and matches in reverse chain direction are flagged e-mail Holm@ebi.ac.uk (Internet) anonymous ftp ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/fssp WWW URL http://www.ebi.ac.uk/dali/fssp/ Availability: Under the terms of the GNU Library General Public License.